Meme Kanseri Patogenezinde Rps26p25  Pseudogeninin Rolünün Araştırılması

DSpace Ana Sayfası
→
Tez
→
Yüksek Lisans
→
Öğe Göster

dc.contributor.advisor	Göker Bağca, Bakiye
dc.contributor.author	Akyol Sağlı, Badegül
dc.date.accessioned	2025-08-22T05:02:03Z
dc.date.available	2025-08-22T05:02:03Z
dc.date.issued	2025-08-22
dc.date.submitted	2025-07-28
dc.identifier.other	TPF-25010
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11607/5389
dc.description.abstract	Amaç: Bu çalışmada, RPS26P25 pseudogeninin meme kanseri hücre hatlarında ekspresyonunun değerlendirilmesi, gen susturulmasının hücre canlılığı, apoptoz ve sisplatin duyarlılığı üzerindeki etkilerinin araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Analitik tasarımdaki bu araştırma, laboratuvar ortamında in vitro olarak yürütülmüştür. RPS26P25 ekspresyon analizi için MCF‑7, MDA‑MB‑231 ve sağlıklı hücre hattı MCF10A kullanılmıştır. Hücre konsantrasyonu optimizasyonu MTT testi ile gerçekleştirilmiş, her iki meme kanseri hücre hattı için optimal yoğunluk 250×10³ hücre/ml olarak belirlenmiştir. qRT‑PCR ile gen ifadesi ölçülmüş, gen susturulması için siRNA uygulanmıştır. Sitotoksisite ve IC₅₀ değerleri MTT testiyle hesaplanmış, sisplatin uygulamasından sonra apoptoz ve hücre döngüsü analizleri akım sitometrisi ile yapılmıştır. Deneyler üç tekrarlı olarak gerçekleştirilmiş, istatistiksel değerlendirmelerde Student T-testi ve One-way ANOVA uygulanmıştır. Bulgular: RPS26P25 geninin ekspresyonu MCF‑7’de MCF10A’ya göre 14,95 kat, MDA‑MB‑231'de 5,74 kat artış göstermiştir. Gen susturulması, her iki tümör hücre hattında hücre canlılığını azaltmış ve apoptozu artırmıştır. Sisplatine karşı bulunan IC₅₀ değerleri MCF‑7 için 2,46 µM, MDA‑MB‑231 için 49,56 µM olarak hesaplanmıştır. Ek olarak, gen susturulması sisplatin etkisiyle kombine edildiğinde, her iki hücre hattında erken ve geç apoptoz oranlarında artış belirlenmiştir. Sonuç: RPS26P25 pseudogeninin meme kanseri hücrelerinde artmış şekilde ifade edildiği ve gen susturulmasının hücre canlılığını azaltıp apoptozu artırarak sisplatine duyarlılığı yükselttiği bulunmuştur. Bu sonuçlar, RPS26P25’in hedeflenmesinin potansiyel bir terapötik strateji olabileceğini düşündürmektedir.	tr_TR
dc.description.tableofcontents	KABUL VE ONAY …………...………………………..…………….…….………... i TEŞEKKÜR ……………………………………………………...………………...... ii İÇİNDEKİLER ..…………………………………………….………...…………....... iv SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ …..…………………………….……....... viii ŞEKİLLER DİZİNİ ….………….…………………………...……………..……....... ix TABLOLAR DİZİNİ ….………….…………………………...…………………....... xi ÖZET ……………………………………………………………………………….... xii ABSTRACT …………………………………………………….………………….... xiii 1. GİRİŞ …………………….…………………...…………………….….…..…….... 1 1.1. Araştırmanın Problemi ……………………………….….…………………......... 1 1.2. Araştırmanın Sorusu ……………………………………….……….………......... 1 1.3. Araştırmanın Hipotezleri ……………….………………………..…………......... 1 1.4. Araştırmanın Varsayımları ………………………………………………............. 2 1.5. Araştırmanın Sınırlılıkları ………………………………………………….......... 2 1.6. Araştırmanın Amacı …………………………………………………………....... 2 2. GENEL BİLGİLER …………………..…………………………………....…......... 3 2.1. Kanser Tanımı ve Tarihçesi …………………………………………………........ 3 2.2. Meme Kanseri Tanımı ve Tarihçesi .……….….…………………………............ 5 2.2.1. Meme Kanserini Oluşturan Risk Faktörleri, İnsidansı ve Sağkalım Oranları …...……….………………………………….…………………………….................. 5 2.2.2. Meme Kanserinin Alt Tipleri ve Uygun Tedavi Yöntemleri ……………............ 6 2.3. Genomun Organizasyonu ………….…………………………………………...... 7 2.3.1. Pseudogenler ………………..………………………………………………..... 8 2.3.2. Pseudogenlerin Genetik Düzenlemedeki Rolleri …………………………......... 9 2.3.3. Ribozomal Pseudogenler …………………...………………………………...... 10 2.3.4. RPS26P25 Geninin Özellikleri …………….………………………………....... 11 2.4. Hücre Ölümü ve Hücre Döngüsünün Durdurulması ………………………........... 11 2.5. Hücre Ölüm Tipleri …………………………………………………………........ 12 2.5.1. Apoptoz ……………………………………………..….........……………….... 13 2.5.1.1. Apoptozun Biyokimyasal Süreçleri …………………..…………………........ 14 2.5.1.1.1. Ekstrinsik Yolak …..……………………….……………………………..... 15 2.5.1.1.2. İntrinsik Yolak …………………………………………………………....... 15 2.5.1.2. Apoptozun Genetik Temeli ve İlgili Gen Aileleri ……………………........... 16 2.5.1.2.1. Kaspazlar ………………………………………………………………....... 16 2.5.1.2.2. Bcl-2 Ailesi ………………………………………………………………... 17 2.5.2. Nekroz ………………………………………………………………………..... 19 2.5.3. Otofaji ………………………………………………………………………..... 19 2.6. Hücre Döngüsü ………………………………………………………………....... 20 2.6.1. Hücre Döngüsü Düzenleyicilerinin Kanserle İlişkisi …………………….......... 21 2.6.2. Kanser Tedavisinde Hücre Döngüsünü Hedefleyen Tedavi Yaklaşımları ve İlaçlar ……………………………………………………………………………........ 21 2.7. Kanserde Hedefe Yönelik Tedavi Yaklaşımları ……………………………......... 22 2.8. Sisplatin ………………………………………………………………………...... 22 3. GEREÇ ve YÖNTEM ............................................................................................... 24 3.1. Gereç …………………………………………………………………………...... 24 3.1.1. Cihazlar ……………………………………………………………………...... 24 3.1.2. Kullanılan Kimyasal Maddeler ……………………………………………........ 25 3.2. Yöntem ………………………………………………………………………....... 27 3.2.1. Hücre Kültürü Çalışmaları ……………………………………………….......... 27 3.2.1.1. Farklı Meme Kanseri Hücrelerinin Çoğaltılması ……………………….......... 29 3.2.1.2. Hücrelerin Kültür Ortamında Büyütülmesi ve İzlenmesi ……………............. 29 3.2.1.3. Hücrelerin Pasajlanması …………………………………………………....... 30 3.2.1.4. Hücrelerin Dondurulması ………………………………………………......... 30 3.2.1.5. Hücrelerin Çözülmesi ……………………………………………………....... 31 3.2.1.6. Hücre Canlılık Testi ………………………………………………………..... 31 3.2.2. Farklı Meme Kanseri Hücrelerinde RPS26P25 Pseudogeninin Ekspresyon Düzeylerinin qPCR Yöntemi İle Belirlenmesi ……………………….......................... 32 3.2.2.1. RNA İzolasyonu …………………………………………………………....... 32 3.2.2.2. RNA Konsantrasyonu ve Saflık Analizi …………………………………....... 33 3.2.2.3. cDNA Sentezi ……………………………………………………………....... 33 3.2.2.4. Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (qRT-PCR) …………............. 34 3.2.3. Hücre Modellerinde RPS26P25 Pseudogeninin Susturulması ve Validasyonu …………………………………………………………………………....................... 36 3.2.3.1. Transfeksiyon Deneyi (siRNA Uygulaması) ……………………………........ 37 3.2.3.2. Transkripsiyon Validasyonu ……………………………………………........ 37 3.2.4. Sitotoksisite Analizi ve MTT Testi …………………………………………...... 37 3.2.5. Fonksiyonel in vitro Çalışmalar ……………………………………………....... 39 3.2.5.1. RPS26P25 Pseudogeninin Apoptoz Üzerindeki Etkisinin Belirlenmesi ………………………………………………………………………………………... 3.2.5.2. RPS26P25 Pseudogeninin Hücre Döngüsü Üzerindeki Etkisinin Belirlenmesi …………………………………………………………………………....................... 39 40 4. BULGULAR ……………………………………………………………………..... 42 4.1. Deneylerde Kullanılacak Optimum Hücre Yoğunluğunun Belirlenmesi …........... 42 4.2. RPS26P25 Pseudogeninin Farklı Hücre Hatlarındaki Ekspresyon Düzeyleri ……………………………………………………………………………................... 43 4.3. RPS26P25 Pseudogeninin Susturulduğunun Doğrulanması …….......................... 43 4.4. Sisplatinin MCF-7 ve MDA-MB-231 Hücreleri Üzerindeki Sitotoksik Etkilerinin Analizi …………………………………………………………………....................... 44 4.5. RPS26P25 Pseudogeninin Susturulmasının MCF-7 ve MDA-MB-231 Hücreleri Üzerindeki Apoptotik Etkilerinin Analizi ……………………………......................... 4.6. 45 RPS26P25 Pseudogeninin Susturulmasının MCF-7 ve MDA-MB-231 Hücrelerinin Hücre Döngüsü Üzerindeki Etkilerinin Analizi ……………………........ 5. TARTIŞMA ……………………………………………………………………….. 60 6. SONUÇ ve ÖNERİLER ………………………………………………………….... 63 KAYNAKLAR ………………………………………………………………………. 64 BİLİMSEL ETİK BEYANI ………………………………………………………...... 71 ÖZ GEÇMİŞ ………………………………………………………………………..... 72	tr_TR
dc.language.iso	tur	tr_TR
dc.rights	info:eu-repo/semantics/restrictedAccess	tr_TR
dc.subject	Apoptoz, Meme kanseri, pse‑siRNA, RPS26P25, Sisplatin	tr_TR
dc.title	Meme Kanseri Patogenezinde Rps26p25 Pseudogeninin Rolünün Araştırılması	tr_TR
dc.type	masterThesis	tr_TR
dc.contributor.department	Adnan Menderes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyoloji	tr_TR