Akciğer Kanserinde Rps26p25 Pseudogeninin Hücre Canlılığı, Apoptoz Ve Hücre Döngüsü Üzerindeki Etkisinin Araştırılması

DSpace Home
→
Tez
→
Yüksek Lisans
→
View Item

dc.contributor.advisor	Göker Bağca, Bakiye
dc.contributor.author	Ülgü, Gülşah Nur
dc.date.accessioned	2025-08-20T05:00:36Z
dc.date.available	2025-08-20T05:00:36Z
dc.date.issued	2025-08-20
dc.date.submitted	2025-07-28
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11607/5379
dc.description.abstract	Ülgü G. N. Aydın Adnan Menderes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyoloji Programı, Yüksek Lisans Tezi, Aydın, 2025. Amaç: Bu çalışmada, RPS26P25 adlı pseudogenin akciğer kanseri hücrelerindeki potansiyel rolü araştırılmış ve terapötik hedef olarak değerlendirilebilirliği incelenmiştir. Gereç ve Yöntem: Çalışmada insan akciğer adenokarsinom hücre hattı (A549) ile sağlıklı Tip II alveol epitel hücre hattı (T2A) kullanılmıştır. Hücreler MEM besiyerinde kültürlenmiş, canlılık tripan mavisi ile izlenmiştir. RPS26P25 ekspresyonu qPCR ile belirlenmiş, gen susturma siRNA ile gerçekleştirilmiştir. Susturma sonrası RNA izolasyonu yapılarak qPCR ile doğrulama yapılmıştır. Apoptoz ve hücre döngüsü akış sitometrisi ile değerlendirilmiştir. Sisplatin ile kombinasyon çalışmaları yürütülmüş, veriler GraphPad Prism yazılımı ile analiz edilmiştir. Bulgular: RPS26P25 pseudogeninin susturulması, A549 hücrelerinde toplam apoptotik hücre oranında %16,07’lik anlamlı artışa (p < 0,0001) neden olmuş; sisplatinle kombinasyonu ek %4,65 artış sağlamış ancak bu fark anlamlı bulunmamıştır (p = 0,1016). T2A hücrelerinde ise apoptoz %6,69 artmış (p = 0,0101), kombinasyonla %5,32 azalmıştır (p = 0,052). Hücre döngüsü analizinde, A549 hücrelerinde G0/G1 fazı artmış (p = 0,0137), S fazı azalmıştır. Sisplatin S fazında birikmeye yol açmış (p < 0,0001), bu etki gen susturmasıyla değişmemiştir. T2A hücrelerindeki uygulamalar ise G1, S ve G2 fazlarında anlamlı bir değişiklik oluşturmamıştır (p > 0,05). Sonuç: RPS26P25 pseudogeninin akciğer kanseri hücrelerinde apoptoz ve kemoterapiye duyarlılığı etkilediği gösterilmiştir. Bu bulgular, söz konusu pseudogenin terapötik hedef ve potansiyel biyobelirteç adayı olabileceğini desteklemektedir. Daha ileri in vivo ve klinik çalışmalar gereklidir.	tr_TR
dc.description.tableofcontents	KABUL VE ONAY................................... ı TEŞEKKÜR........................................ ıı İÇİNDEKİLER..................................... ııı SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ.................. vıı ŞEKİLLER DİZİNİ................................. x TABLOLAR DİZİNİ................................. xıı ÖZET............................................ xııı ABSTRACT........................................ xıv 1. GİRİŞ........................................ 1 1.1.Araştırmanın Problem........................ 1 1.2. Araştırmanın Sorusu........................ 1 1.3. Araştırmanın Hipotezi...................... 1 1.4. Araştırmanın Varsayımları.................. 1 1.5. Araştırmanın Sınırlılıkları................ 2 1.6. Araştırmanın Amacı......................... 2 2. GENEL BİLGİLER............................... 3 2.1. Kanser..................................... 3 2.1.1. Kanserin Temel Özellikler................ 3 2.1.2. Kanserin Kökeni.......................... 5 2.1.2.1. Genetik Mutasyonlar.................... 5 2.1.2.2. Epigenetik Değişiklikler ve Gen İfadesi......................................... 5 2.1.2.3. Çevresel Faktörler ve Kanser Gelişimi.. 6 2.1.2.4. Tümör Mikroçevresi ve Kanser........... 6 2.1.2.5. Metastaz ve Kanserin Yayılması......... 6 2.2. Akciğer Kanseri............................ 7 2.2.1. Epidemiyoloji............................ 7 2.2.2. Risk Faktöri............................. 8 2.2.3. Sınıflandırma............................ 8 2.2.4. Moleküler Temelleri...................... 9 2.2.5. Tanı Yöntemleri.......................... 12 2.2.5.1. Klinik Belirtiler...................... 12 2.2.5.2. Görüntüleme Teknikleri................. 12 2.2.5.3. Biyopsi ve Sitolojik İncelemeler....... 13 2.2.5.4. Moleküler Tanı Yöntemleri.............. 13 2.2.5.5. Tedavi Yöntemleri...................... 13 2.2.5.6. Prognoz ve İzlem....................... 17 2.3. Pseudogenler............................... 18 2.3.1. Pseudogenlerin Tanımı ve Genel Özellikleri..................................... 18 2.3.2. Kanser Biyolojisinde Pseudogenler........ 19 2.3.2.1. ceRNA Ağı ve MikroRNA Rekabeti......... 19 2.3.2.2. Epigenetik Mekanizmalar................ 20 2.3.2.3. Tümöre Özgü İmza ve Biyobelirteç Potansiyeli..................................... 21 2.3.2.4. Potansiyel Klinik Uygulamalar ve Gelecek Perspektifler........................... 22 2.3.3. Akciğer Kanserinde Pseudogenle........... 22 2.3.3.1. Tanı ve Prognozda Pseudogenlerin Rolü.. 22 2.3.4. RS26P25 Pseudogeni....................... 23 3. GEREÇ VE YÖNTEM.............................. 25 3.1. Hücre Kültürü Çalışmaları.................. 25 3.1.1. Kullanılan Hücreler...................... 25 3.1.2. Farklı Akciğer Hücre Modellerinin Çoğaltılması ve Takibi.......................... 25 3.1.3. Hücrelerin Pasajlanması.................. 26 3.1.4. Hücrelerin Dondurulması.................. 26 3.1.5. Hücrelerin Çözülmesi..................... 27 3.2. Hücre Modellerinde RPS26P25 Pseudogeninin Ekspresyon DüzeylerininBelirlenmesi............. 27 3.2.1. RNA İzolasyonu........................... 27 3.2.2. RNA Miktarının ve Saflık Değerlerinin Ölçümü.......................................... 28 3.2.3. Komplementer DNA (cDNA) Sentezi.......... 28 3.2.4. Kantitatif Ters Transkriptaz Polimeraz Zincir Reaksiyonu (qRT-PCR)..................... 28 3.3. Hücre Modellerinde RPS26P25 Pseudogeninin Susturulması ve Validasyonu..................... 29 3.4. Sı̇splatı̇nı̇n Hücreler Üzerı̇ndekı̇ Sı̇totoksı̇k Etkı̇sı̇nı̇n Belirlenmesi.......................... 30 3.5. Fonksiyonel in vitro Çalışmalar............ 31 3.5.1. RPS26P25 Pseudogeninin Apoptoz Üzerindeki Etkisinin Belirlenmesi.......................... 31 3.5.2. RPS26P25 Pseudogeninin Hücre Döngüsü Üzerindeki Etkisinin Belirlenmesi............... 32 4. BULGULAR..................................... 33 4.1. RPS26P25 Geninin Ekspresyon Düzeyi......... 33 4.2. Hücre Modellerinde RPS26P25 Pseudogeninin Susturulması ve Validasyonu..................... 33 4.3. Sı̇totoksı̇site Analizleri................... 34 4.4. Apoptoz Analizleri Sonuçları............... 35 4.5. Hücre Döngüsü Analizleri Sonuçları......... 42 5. TARTIŞMA..................................... 50 6. SONUÇ VE ÖNERİLER............................ 53 KAYNAKLAR....................................... 54 BİLİMSEL ETİK BEYANI............................ 61 ÖZGEÇMİŞ........................................ 62	tr_TR
dc.language.iso	tur	tr_TR
dc.rights	info:eu-repo/semantics/embargoedAccess	tr_TR
dc.subject	Akciğer Kanseri, Apoptoz, Hücre Canlılığı, Pseudogen, RNA İnterferansı, Sisplatin	tr_TR
dc.title	Akciğer Kanserinde Rps26p25 Pseudogeninin Hücre Canlılığı, Apoptoz Ve Hücre Döngüsü Üzerindeki Etkisinin Araştırılması	tr_TR
dc.title.alternative	EVALUATION OF THE IMPACT OF RPS26P25 PSEUDOGENE ON CELL VIABILITY, APOPTOSIS, AND CELL CYCLE IN LUNG CANCER CELLS	tr_TR
dc.type	masterThesis	tr_TR
dc.contributor.department	Adnan Menderes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji Bölümü	tr_TR