dc.contributor.advisor |
Erbaş, Göksel |
|
dc.contributor.author |
Kirazlı, İlyas |
|
dc.date.accessioned |
2025-02-13T07:55:37Z |
|
dc.date.available |
2025-02-13T07:55:37Z |
|
dc.date.issued |
2025 |
|
dc.date.submitted |
2025-01-31 |
|
dc.identifier.citation |
Kirazlı İ, Erbaş G. (2025) Güney Marmara Bölgesinde yaygın görülen mastitis mikroorganizmalarının malditof-ms yöntemi ile tanımlanması ve antibiyotik dirençliliklerinin belirlenmesi |
tr_TR |
dc.identifier.uri |
http://hdl.handle.net/11607/5287 |
|
dc.description.abstract |
Amaç: Bu araştırma, Güney Marmara bölgesinde yetiştirilen büyükbaş süt ineklerinde mastitise neden olan etkenleri teşhis ederek hakim floranın belirlenmesi ve antibiyotik dirençlerinin belirlenmesini hedeflemektedir. Böylelikle, hayvanların antimikrobiyal tedavilerinde etkene yönelik tedavi planlarının oluşturulması ve bilinçli antibiyotik kullanımının öneminin vurgulanması sağlanacaktır.
Gereç ve Yöntem: Güney Marmara Bölgesinde büyükbaş süt ineği yetiştiriciliği yapan büyük işletmelerden ve küçük çaplı (3-10 Sağmal) yetiştiricilerin hayvanlarından elde edilmiş toplam 122 mastitis etkeni patojen mikroorganizma 5% koyun kanlı agar (Columbia Sheep Blood 5%) ve CPS Elite® (bioMerieux,Fransa) besiyerleri kullanılarak izole edilmiştir. Elde Edilen mikroorganizmalar Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time-of-Flight Mass Spektrometri (Maldi-Tof MS, VITEK® MS PRIME ,bioMerieux, Fransa) cihazı ile tür tanımlamaları gerçekleştirilmiştir. Tanımlanmış olan mikroorganizmaların antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi için otomatik antibiyogram cihazı (VITEK® 2 COMPACT, bioMerieux,Fransa) kullanılmıştır.
Bulgular: Yapılan araştırma sürecinde Güney Marmara Bölgesindeki, 100 farklı mastitis vakasından toplam 122 farklı mikroorganizma izole edilmiştir. İzole edilen mikroorganizmalar 31 farklı türe ait olup her 3 vakanın en az 1’ine Escherichia coli veya Staphyloccus aureus sebebiyet verdiği görülmüştür. E.coli ve Staphyloccus aureus türlerinin birden fazla antimikrobik maddeye karşı orta ve yüksek dirençte olduğu gözlemlenmiştir. E.coli türleri; Ampisilin, Sefalotin, Tetrasiklin, Trimetoprim/Sulfametoksazol, Seftiofur antimikrobiklerine karşı orta ve yüksek direnç, Enrofloxacin ve Flumequine antimikrobiklerine karşı orta direnç gösterme eğiliminde olduğu görülmüştür. Staphyloccus aureus türleri; Benzilpenisilin, Seftiofur, Neomisin, Oksasilin, Tetrasiklin, Tilkomisin antimikrobiklerine karşı orta veya yüksek direnç, Tilosin antimikrobiğine karşı da orta direnç gösterme eğilimindedir. Bölgedeki mastitis etmenlerinden en sık görülen bu iki tür ortak olarak seftiofur ve tetrasiklin antimikrobiklerine karşı ortak direnç gösterdiği görülmüştür.
Sonuç: Bu çalışmada Güney Marmara Bölgesindeki büyükbaş süt ineklerinde mastitise sebebiyet veren patojen mikroorganizmaların tanımlamaları yapılmıştır. Tanımlanan türlerden insidensi en yüksek iki tür olan E.coli ve Staphyloccus aureus türleri için yapılan antibiyotik duyarlılık testleri sonuçlarında seftiofur ve tetrasiklin antimikrobiklerine karşı güçlü bir ortak direnç olduğu görülmüştür. |
tr_TR |
dc.description.sponsorship |
Bu tez Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından VTF-24024 proje numarası ile desteklenmiştir |
tr_TR |
dc.description.tableofcontents |
KABUL VE ONAY i
TEŞEKKÜR ii
İÇİNDEKİLER iii
SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ vi
ŞEKİLLER DİZİNİ vii
RESİMLER DİZİNİ viii
TABLOLAR DİZİNİ ix
ÖZET x
ABSTRACT xii
1. GİRİŞ 1
2. GENEL BİLGİLER 3
2.1. Mastitis 3
2.1.1. Mastitisin Sınıflandırılması 3
2.1.1.2. Klinik Mastitis 4
2.1.1.2.1 Kronik Mastitis 4
2.1.1.2.2. Akut Mastitis 4
2.1.1.2.3. Subakut Mastitis 5
2.1.1.2.4. Septik Mastitis 5
2.1.1.3. Subklinik Mastitis 5
2.2.1. Mastitis Etkenleri 6
2.2.2. Mastitis Patojenleri 6
2.2.2.1. Staphylococcus aureus 7
2.2.2.2. Streptococcus agalactiae 8
2.2.2.3. Escherichia coli (E. coli) 9
2.2.2.4. Streptococcus uberis 10
2.2.2.5. Klebsiella spp. 11
2.2.2.6. Coagulase-negative Staphylococci (CNS) 12
2.2.2.7. Mycoplasma spp. 12
2.2.2.8. Pseudomonas aeruginosa 13
2.3. Mastitisin Laboratuvar Teşhis Yöntemleri 14
2.3.1. Somatik Hücre Sayımı (SCC) 14
2.3.2. California Mastitis Test (CMT) 15
2.3.3. Bakteriyolojik Kültür Testi 16
2.3.3.1. Mikroskobik Tanımlama 17
2.3.3.2. Biyokimyasal Testler 18
2.3.3.3. Moleküler Tanımlama Yöntemleri 18
2.3.3.4. Otomatik Tanımlama Sistemleri 19
2.3.4. Elektriksel İletkenlik Testi 19
3. GEREÇ VE YÖNTEM 21
3.1. Gereç 21
3.1.1. Cihazlar 21
3.1.1.1. VITEK® MS PRIME (MALDI-TOF MS) 22
3.1.1.2. VITEK® 2 COMPACT 22
3.1.2. Kullanılan Kitler ve Besiyerleri 23
3.1.2.1. VITEK® MS-DS Target-Slide 23
3.1.2.2. VITEK® MS CHCA 24
3.1.2.3. VITEK® MS PICKME Kalem ve Kalem Ucu 24
3.1.2.4. VITEK® 2 AST GP79 25
3.1.2.5. VITEK® 2 AST GN96 27
3.1.3. Mikroorganizma Temini 28
3.2. Yöntem 29
3.2.1. Örnek alımı 29
3.2.2. Mikroorganizma İzolasyonu 29
3.2.2.1. ChromID CPS Elite® Besiyeri 29
3.2.2.2. 5% Koyun Kanlı Agar (Columbia +5% Sheep Blood) 30
3.2.3. Mikroorganizmaların VITEK® MS PRIME (MALDI-TOF MS) İle Tanımlanması 30
3.2.4. VITEK®2 COMPACT Cihazı ile Antibiyotik Duyarlılık Testlerinin Gerçekleştirilmesi 31
4. BULGULAR 32
4.1. Tanımlama Bulguları 32
4.1.1. İl Bazında Mastitis Vakalarının Değerlendirmesi 33
4.2. Antibiyotik Duyarlılık Bulguları 36
4.2.1. Escherichia coli Antibiyotik Duyarlılık Çalışması 36
4.2.2. Staphyloccus aureus Antibiyotik Duyarlılık Çalışması 42
5. TARTIŞMA 45
6. SONUÇ VE ÖNERİLER 48
KAYNAKLAR 50
BİLİMSEL ETİK BEYANI 57
ÖZ GEÇMİŞ 58 |
tr_TR |
dc.language.iso |
tur |
tr_TR |
dc.publisher |
Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü |
tr_TR |
dc.rights |
info:eu-repo/semantics/embargoedAccess |
tr_TR |
dc.subject |
Mastitis, Maldi-Tof Ms, Antimikrobik, Büyükbaş Süt İneği, Staphyloccus aureus, Escherichia coli, Otomatik Antibiyogram |
tr_TR |
dc.title |
Güney Marmara Bölgesinde yaygın görülen mastitis mikroorganizmalarının malditof-ms yöntemi ile tanımlanması ve antibiyotik dirençliliklerinin belirlenmesi |
tr_TR |
dc.title.alternative |
IDENTIFICATION OF MASTITIS MICROORGANISMS COMMON IN SOUTH MARMARA REGION WITH MALDI-TOF MS METHOD AND DETERMINATION OF THEIR ANTIBIOTIC RESISTANCE |
tr_TR |
dc.type |
masterThesis |
tr_TR |
dc.contributor.department |
ADÜ Sağlık Bilimleri Enstitüsü Veterinerlik Mikrobiyolojisi ABD |
tr_TR |