Amaç: Köpeklerde meydana gelen inflamatuar deri hastalıkları arasında yer alan köpek
atopik dermatiti en yaygın olarak çevresel alerjenlere karşı yönlendirilen, İmmünoglobulin
E antikorları ile ilişkili karakteristik klinik özelliklere sahip, inflamatuar ve kaşıntılı alerjik
deri tutulumu ile seyretmektedir. Çok sayıda çalışma astım ve atopik dermatit gibi alerjik
hastalıkların gelişiminin, bağırsak mikrobiyal çeşitliliği ve bileşimindeki değişikliklerle
yakından ilişkili olduğunu göstermiştir. Enterik hastalıkların gelişimine genellikle kutanöz
lezyon belirtileri eşlik eder ve bu durum bağırsak ve derinin birbirlerini etkileyebileceği
anlamına gelmektedir. Bu nedenle bağırsak mikrobiyal değişikliklerini hedeflemek atopik
dermatitli hastalarda bağışıklık tepkilerini düzenlemek ve kutanöz sağlığı iyileştirmek için
bir alternatif olabilmektedir. Disbiyozun daha iyi anlaşılması için deri ve bağırsak
mikrobiyomu arasındaki etkileşimi takip etmek ve yeni terapötik yaklaşımlara ışık tutmak
önem arz etmektedir. Atopik dermatite neden olan alerjen etkenlerin yanı sıra mikrobiyota
değişikliklerinin de atopiden müzdarip köpeklerde değişikliklere yol açtığı ve hastalıkla
direk ilişkili olduğunun gösterilmesi çalışmamızın ana hedefi olmuştur.
Gereç ve Yöntem: Araştırmamızın hayvan materyalini Aydın Adnan Menderes
Üniversitesi, Veteriner Fakültesi Küçük Hayvan Kliniğine atopik dermatit ön tanısı (kaşıntı,
alopesi, kabuklanma, kepeklenme, hiperpigmentasyon, vb.) anamnezi ile getirilen farklı
yaşta, her iki cinsiyetten köpekler oluşturdu. I. grupta Favrot kriterleri doğrultusunda atopik
dermatit bulunan köpekler (n=14), II. grupta ise sağlıklı köpekler (atopik dermatit ya da
başka herhangi bir hastalığı bulunmayan) (n=12) olarak 26 köpek yer aldı. Olgularda ilişkin
hastalıklara yönelik epidermal korneometrik analizleri de içeren detaylı laboratuvar
analizleri gerçekleştirildi. Tüm gruplardaki köpeklerde 20 farklı alerjene spesifik IgE
düzeyleri in vitro Polycheck alerji testi ile belirlendi. Mikrobiyota analizleri toplanan dışkı
xi
örnekleri gerekli koşullarda saklanıp, MiDOG® Hepsi Bir Arada Mikrobiyal Test
kullanılarak yeni nesil DNA dizileme testi ile yurtdışı hizmet alımı şeklinde gerçekleştirildi.
Elde edilen parametrelerin hesaplanması ve karşılaştırılmasında uygun istatistiksel
yöntemler kullanıldı.
Bulgular: Filum bazında mikrobiyota kompozisyonu sonuçlarında atopik dermatitli
köpeklerde yüzdesel anlamda Bacteroidetes ve Proteobacteria’nın sağlıklı gruba göre daha
yüksek olduğu bunun aksine sağlıklı grupta ise Firmicutes, Actinobacteria ve
Fusobacteria’nın atopik dermatitli köpeklerin olduğu gruba göre daha yüksek olduğu
görüldü. Aile bazında atopik dermatitli hayvanlarda Actinomycetaceae,
Corynebacteriaceae, Porphyromonadaceae, Streptococcaceae, Fusobacteriaceae,
Campylobacteraceae, Enterobacteriaceae, Pseudomonadaceae üyeleri sağlıklı
hayvanlardan sayısal anlamda daha yüksekken sağlıklı hayvanlarda ise Coriobacteriaceae,
Clostridiaceae, Peptostreptococcaceae, Ruminococcaceae, Bacteroidaceae,
Lachnospiraceae familyaları hasta hayvanlardan daha yüksek olarak görüldü. Sağlıklı
hayvanların tür bazında mikrobiyom sonuçlarında en çok görülen türler arasında
Fusobacteriales familyasından tür tanımlaması yapılamamış bakteriler, Peptoclostridium
sp34341, Porphyromonas cangingivalis, Corynebacterium amycolatum ve Corynebacterium
jeikeium yer aldı. Atopik dermatitli köpeklerin tür bazında mikrobiyom sonuçlarında ise
görülen türler arasında Megamonas funiformis, Pseudomonadales ve Fusobacteriales
familyasından tür tanımlaması yapılamamış bakteriler, Corynebacterium amycolatum,
Porphyromonas cangingivalis, Campylobacter helveticus, Corynebacterium lactis,
Bacteroides plebeius, Prevotella copri, Fusobacterium mortiferum ve Blautia hansenii
saptandı.
Sonuç: Analizleri yapılan hastalar ile kontrol grubu arasında anlamlı farklar bulundu.
Mikrobiyota analizlerinin atopik dermatit ile olan yakın ilişkisi gelecek tedavi yöntemlerine
ışık tutmaktadır.
Objective: Canine atopic dermatitis, which is among the inflammatory skin diseases
occurring in dogs, is most commonly directed against environmental allergens and
progresses with inflammatory and pruritic allergic skin involvement with characteristic
clinical features associated with Immunoglobulin E antibodies. Numerous studies have
shown that the development of allergic diseases such as asthma and atopic dermatitis is
closely related to changes in gut microbial diversity and composition. The development of
enteric diseases is often accompanied by signs of cutaneous lesions, meaning that the gut
and skin can affect each other. Therefore, targeting gut microbial changes may be an
alternative to regulate immune responses and improve cutaneous health in patients with
atopic dermatitis. To better understand dysbiosis, it is important to follow the interaction
between the skin and gut microbiome and shed light on new therapeutic approaches. The
main goal of our study was to demonstrate that microbiota changes, as well as allergenic
factors that cause atopic dermatitis, cause changes in dogs suffering from atopy and are
directly related to the disease.
Materials and Methods: The animal material of our study consisted of dogs of both sexes
and of different ages, brought to the Small Animal Clinic of the Faculty of Veterinary
Medicine, Aydın Adnan Menderes University, with a preliminary diagnosis of atopic
dermatitis (itching, alopecia, crusting, dandruff, hyperpigmentation, etc.) anamnesis. Group
I included dogs with atopic dermatitis in line with Favrot criteria (n=14), and Group II
included 26 dogs, healthy dogs (without atopic dermatitis or any other disease) (n = 12).
Detailed laboratory analyzes including epidermal corneometric analyzes were performed for
the relevant diseases in the cases. IgE levels specific to 20 different allergens in dogs in all
groups were determined by the in vitro Polycheck allergy test. Microbiota analyzes were
xiii
carried out by storing the collected fecal samples under the necessary conditions and using
the MiDOG® All-in-One Microbial Test with a new generation DNA sequencing test and
outsourcing overseas services. Appropriate statistical methods were used to calculate and
compare the obtained parameters.
Results: In the results of microbiota composition based on phylum, it was seen that
Bacteroidetes and Proteobacteria were higher in percentage terms in dogs with atopic
dermatitis compared to the healthy group, and on the contrary, Firmicutes, Actinobacteria
and Fusobacteria were higher in the healthy group compared to the group of dogs with
atopic dermatitis. At family level, members of Actinomycetaceae, Corynebacteriaceae,
Porphyromonadaceae, Streptococcaceae, Fusobacteriaceae, Campylobacteraceae,
Enterobacteriaceae, Pseudomonadaceae families were numerically higher in animals with
atopic dermatitis than in healthy animals, while Coriobacteriaceae, Clostridiaceae,
Peptostreptococcaceae, Ruminococcaceae, Bacteroidaceae, Lachnospiraceae families were
seen to be higher in healthy animals than in sick animals. Among the species most
frequently seen in the species-based microbiome results of healthy animals were
unidentified bacteria from the Fusobacteriales family, Peptoclostridium sp34341,
Porphyromonas cangingivalis, Corynebacterium amycolatum and Corynebacterium
jeikeium. Species seen in the species-based microbiome results of dogs with atopic
dermatitis include Megamonas funiformis, unidentified bacteria from the Pseudomonadales
and Fusobacteriales families, Corynebacterium amycolatum, Porphyromonas cangingivalis,
Campylobacter helveticus, Corynebacterium lactis, Bacteroides plebeius, Prevotella copri,
Fusobacterium mortiferum and Blautia hansenii was detected.
Conclusion: Significant differences were found between the analyzed patients and the
control group. The close relationship between microbiota analyzes and atopic dermatitis is
promising for future treatment methods.
