eArşiv@Adu

Kanatlı Patojenik Escherichia Coli'lerde Mobilize Kolistin Direnç Geni-1'in Araştırılması

Basit öğe kaydını göster

dc.contributor.advisor Türkyılmaz, Süheyla
dc.contributor.author Yılmaz, Ecenur
dc.date.accessioned 2024-06-27T11:02:48Z
dc.date.available 2024-06-27T11:02:48Z
dc.date.issued 2024-06-27
dc.date.submitted 2024-06-03
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11607/5185
dc.description.abstract Amaç: Bu çalışma, kanatlı patojenik Escherichia coli (APEC) izolatlarında plazmit aracılı kolistin direnci sağlayan mobilize kolistin direnç geni 1 (mcr-1) varlığının belirlenmesi ve kolistin dirençli izolatların antibiyotik direnç profillerinin incelenmesi amaçlandı. Gereç ve Yöntem: Çalışmada, kolibasillozis şüpheli 200 broyler karaciğer örneği materyal olarak kullanıldı. E. coli izolasyonları klasik konvansiyonel yöntemler ile gerçekleştirildikten sonra identifikasyonlar ve antibiyotik duyarlılık testleri otomatize mikrobiyoloji sistemi (BD Phoenix 100TM, ABD) sistemi yardımı ile yapıldı. Fenotipik olarak kolistin dirençli olduğu tespit edilen izolatlarda mcr-1 gen varlığı polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile incelendi. Bulgular: İki yüz broyler karaciğer örneğinden elde edilen 156 (%78) E. coli’nin 10 (%6,4)’unun fenotipik olarak kolistin dirençli olduğu saptandı. Kolistin dirençli E. coli izolatların %80’inin levofloksasine, %70’inin sefazolin ve sefuroksime, %60’ının sefotazidime, %50’sinin gentamisin ve seftriaksona, %40’ının sefepime, %30’unun seftolozan tazobaktama, %20’sinin piperasilin tazobaktama dirençli oldukları belirlendi. Tüm izolatlar amikasin, ertapenem, imipenem, meropenem duyarlı; ampisilin, amoksisilin klavulanat, ampisilin sulbaktam, trimethoprim sulfamethoksazol ve tigesiklin dirençli olup; çoklu antibiyotik direncine (MDR) sahip idi. Fenotipik olarak kolistin dirençli oldukları tespit edilen tüm izolatların genotipik olarak da mcr-1 genini taşıdıkları tespit edildi. Sonuç: Bu bulgular, APEC izolatlarında kolistin direncinin mobilize olmasının, plazmidik direnç genlerinin hızlı yayılmasına ve geniş kapsamlı antibiyotik direncinin artmasına katkı sağladığını göstermektedir. Beşeri hekimlikte de kullanılan antibiyotiklere direnç saptanmış olması halk sağlığı için potansiyel bir tehdit oluşturabilir. Gelecekteki çalışmalar, farklı bölgelerden alınan örneklerle yapılmalı ve bu riskin daha iyi anlaşılması için geniş bir örneklem grubunu içermelidir. tr_TR
dc.description.tableofcontents KABUL VE ONAY …………...………………………..………………….………… i TEŞEKKÜR …………………………………………………………….…………… ii İÇİNDEKİLER ..…………………………………………….………...……….….…. iii SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ …..…………………….…………….…. vi ŞEKİLLER DİZİNİ ….………….…………………………...……………….……… ix RESİMLER DİZİNİ ….………….…………………………...……………………… x TABLOLAR DİZİNİ ….………….…………………………...…………………….. xi ÖZET ………………………………………………………………………………… xii ABSTRACT ………………………………………………………………….………. xiii 1. GİRİŞ …………………….…………………...………………………….…….….. 1 2. GENEL BİLGİLER ……………………..…………………………………....…… 3 2.1. Kanatlı Patojenik Escherichia coli ………………………………………………….. 3 2.1.1. Zoonotik Tehlike ve Kontrol Yöntemleri Üzerine Güncel Bakış ………………. 3 2.1.2. Tavuklarda Antibiyotik Direnci ve APEC Kontrolü: Geleceğin Zorlukları ve Çözüm Yolları………………………………………………………………………….. 5 2.1.3. APEC Enfeksiyonlarının Kontrolünde Yeni Yaklaşımlar ve Çözümler……….. 6 2.2. Kolistin Nedir?.......................................................................................................... 7 2.2.1. Yapısı, Etki Mekanizması ve Antimikrobiyal Spektrumu………………………. 7 2.2.2. Kromozomal ve Plazmit Aracılı Kolistin Direnç Mekanizmaları..........….…….. 8 2.2.3. Duyarlılık Testi Zorlukları ………………….…………....................................... 9 iv 2.2.4. Kolistinin İnsan Hekimliğinde Kullanımı ………..………….............................. 10 2. 2.5. Kolistinin Veteriner Hekimliğinde Kullanımı ………..………………………... 10 2.2.6. Kommensal ve Patojen E. coli …………………………………………...……... 12 2.2.7.Kanatlılardan Elde Edilen Bakteri İzolatlarında Kolistin Direnci ve mcr Genleri. 13 3. GEREÇ VE YÖNTEM ……...……………………………………….………….… 17 3.1. Gereç …………………………………………………………....…..………….... 17 3.1.1. Cihazlar ……………………………………………………..….........….……... 17 3.1.2. Hayvan Materyali …………………………..………………..…..….………… 17 3.1.3. Referans Suşlar……………… …………..……………………….………….... 18 3.1.4. Besiyerleri……………………………………………………………………… 18 3.1.4.1. Eosin Methylene Blue Agar ………………………………………………… 18 3.1.4.2. MacConkey Agar …………………………………………………………….. 18 3.1.4.3. Kanlı Agar ……………………………………………………………………. 19 3.1.4.4. Nutrient Agar………………………………………………………………… 19 3.1.4.5. Nutrient Broth………………………………………………………………... 19 3.1.4.6. Brain Hearth Infusion Broth…………………………………………………. 19 3.1.5. Ayıraç ve Boyalar……………………………………………………………… 20 3.1.5.1. Gram Boyama Seti………………………………………………………….. 20 3.1.5.2. Oksidaz Test Kiti…………………………………………………………….. 20 3.1.5.3. Hidrojen Peroksit…………………………………………………………… 20 3.1.6. Antibiyogram ve Kolistin Direncinin Fenotipik Olarak Belirlenmesi ………… 20 3.1.7. Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR)…………………………………………….. 21 3.1.7.1. Kullanılan Solusyon ve Boyalar…………………………………………….. 21 v 3.1.7.1.1. 10x Tris Borik Asit EDTA Buffer………………………………………… 21 3.1.7.1.2. 0,5x TBE………………………………………………………………….. 21 3.1.7.1.3. Yükleme Tamponu………………………………………………………… 21 3.1.7.1.4. 5x FIREPol® Master Mix ……………………………………………….. 22 3.1.7.1.5. Primerler……………………………………………………………………. 22 3.1.7.1.6. Agaroz Jel……………………………………………………………………. 22 3.1.7.1.7. Elektroforez………………………………………………………………….. 23 3.1.7.1.8. Görüntüleme………………………………………………………………… 23 3.1.7.1.9. Marker………………………………………………………………………. 23 3.2. Yöntem ……………………………………………………………………………. 24 3.2.1. Bakteriyel İzolasyon ……………….…………………………………………… 24 3.2.2. Bakteriyel İzolatların BD Phoenix 100™ ile İdentifikasyonu ve Antibiyotik Duyarlılık Testlerinin Yapılması………………………………………………………. 24 3.2.3. DNA İzolasyonu, Miktar Tayinleri ve Saflık Kontrolleri……………………….. 25 3.2.4. Polimeraz Zincir Reaksiyonu……………………………………………………. 26 4. BULGULAR ………………………………………………………………….….... 28 4.1. Bakteri İzolasyon ve İdentifikasyonu …………………………………………… 28 vi 4.2. Antibiyotik Duyarlılık Testi …………………….…….………………………….. 29 4.2.1. Çoklu Antibiyotik Direnci ………………………………………………………. 33 4.3. Polimeraz Zincir Reaksiyonu ….………………………………….….…………… 34 5. TARTIŞMA …………...……….…………………...……...….……………....…... 35 6. SONUÇ VE ÖNERİLER ……………………………..…………..………….….… 41 KAYNAKLAR ..………………………………...……...……………………….…… 43 BİLİMSEL ETİK BEYANI… …………………………………………………….….. 54 ÖZ GEÇMİŞ ………………………………………………………………………….. tr_TR
dc.language.iso tur tr_TR
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess tr_TR
dc.subject Escherichia coli, İlaç Direnci, Kolistin tr_TR
dc.title Kanatlı Patojenik Escherichia Coli'lerde Mobilize Kolistin Direnç Geni-1'in Araştırılması tr_TR
dc.title.alternative INVESTIGATION OF THE MOBILE COLISTIN RESİSTANCE GENE-1 IN AVIAN PATHOGENIC ESCHERICHIA COLI tr_TR
dc.type masterThesis tr_TR
dc.contributor.authorID 10645769 tr_TR
dc.contributor.department AYDIN ADNAN MENDERES ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ tr_TR


Bu öğenin dosyaları:

Bu öğe aşağıdaki koleksiyon(lar)da görünmektedir.

Basit öğe kaydını göster