İSHALLİ KÖPEKLERDEN ELDE EDİLEN ESCHERICHIA COLI İZOLATLARININ PATOTİPİK VE FİLOGENETİK ÖZELLİKLERİNİN İNCELENMESİ

Abstract

Amaç: Bu çalışmada evcil köpeklerden elde edilen intestinal patojenik Escherichia coli (DEC) izolatlarının patotiplerinin, filotiplerinin ve antimikrobiyal direnç durumlarının değerlendirilemesi ve arasındaki ilişkilerinin analiz edilmesi amaçlandı. Gereç ve Yöntem: Bu çalışmada, 40 ishal ve 40 ishal olmayan evcil köpekten alınan rektal sürüntü örneklerinden elde edilen 200 E. coli izolatı materyal olarak kullanıldı. E. coli izolasyonları klasik konvansiyonel yöntemler ile gerçekleştirildikten sonra identifikasyonlar BD Phoenix 100 sistemi kullanılarak yapıldı. Genotipik olarak da polimeraz zindir reaksiyonu (PZR) ile doğrulandı. İzolatların patotipleri grupları multipleks PZR ile belirlendi. Antibiyotik duyarlılık testlerinde BD Phoenix 100 otomatize sistem kullanıldı. Bulgular: Patotiplendirme çalışmaları tüm E. coli izolatlarının EHEC (%47,2), EPEC (%34,5), ETEC (%12,8), EIEC (%5,5) patotiplerinde bulunduğunu; filotiplendirme çalışmaları ise izolatların filogrup B2 ve C (%23,7), D (%20,0), B1 (%12,7), E (%9,0), F (%3,6) ve A (%1,8) filotiplerinde yer aldığını gösterdi. Antibiyotik duyarlılık test sonuçları izolatların tüm %78,2’sinin çoklu antibiyotik direncine (MDR) sahip olduğunu ortaya koydu. Köpeklerin klinik durumu ile ampisilin, amoksisilin klavulonat, siprofloksasin ve tigesiklin direnci arasında anlamlı bir istatistiksel ilişki tespit edilirken; izolatların çoklu antibiyotik direnç durumları, patotipleri ve filotipleri arasında anlamlı bir istatistiksel ilişki saptanmadı. Sonuç: Köpek izolatlarında DEC patotiplerine özgü virülans genlerinin varlığı ishal olan köpekler kadar sağlıklı görünümlü evcil köpeklerin insan enfeksiyonlarının potansiyel bir kaynağı olabileceğini ve çok farklı filogrupların varlığı E. coli popülasyon çeşitliliğini ortaya koyarken; çoklu antibiyotik direnci taşıyan izolatların yüksek oranı enfeksiyonların tedavisi ve kontrolü için antibiyotik seçiminin özenle yapılması gerekliliğini belirtmektedir.