dc.contributor.advisor |
Bilgin, Mehmet Dinçer |
|
dc.contributor.author |
Bakay İlhan, Didem |
|
dc.date.accessioned |
2023-09-20T05:02:22Z |
|
dc.date.available |
2023-09-20T05:02:22Z |
|
dc.date.issued |
2023 |
|
dc.date.submitted |
2023 |
|
dc.identifier.uri |
http://hdl.handle.net/11607/5091 |
|
dc.description.abstract |
MİDE KANSERİ HÜCRELERİNE SONODİNAMİK TERAPİ
UYGULAMASINDA HSP 70 İNHİBİSYONU VE KLORİN E6 YÜKLÜ
MİKROKABARCIKLARIN ROLÜ
Bakay İlhan D. Aydın Adnan Menderes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü,
Biyofizik (Tıp) Doktora Programı, Doktora Tezi, Aydın, 2023
Amaç: Araştırmamızın amacı mide kanseri hücrelerine sonodinamik terapi uygulamasında ısı
şok protein 70 inhibisyonu ve klorin e6 yüklü mikrokabarcıkların rolünün araştırılmasıdır.
Gereç ve Yöntem: Elde edilen mikrokabarcıkların boyut analizleri çeşitli yöntemlerle elde
edildikten sonra MKN28 mide kanseri hücre hattında ısı şok protein 70’in inhibisyonunu
sağlamak için hücreler 48 saat pifithrin-μ ile inkübe edilmiştir. Pifithrin-μ inkübasyonunu
takiben ultrases (1MHz, 3W/cm2
, %20 puls, 30sn) ile yıkımı sağlanan klorin e6 yüklü
mikrokabarcıklar varlığında 12 saat inkübe edilmiştir. Son olarak gruplar arasında
sitotoksisite ve apoptoz süreçleri hakkındaki farklılıklar moleküler yöntemlerle incelenmiştir.
Bulgular: Boyut analizleri sonucunda elde edilen mikrokabarcıkların 1-5µm boyutunda
dağılım gösterdiği gözlenmiştir. Klorin e6 içeren mikrokabarcıkların ultrases ile yıkımı
esnasında istatistiksel anlamlı artan kavitasyon verisi elde edilmiştir. Spektroskopik ölçümler
sonucunda klorin e6 trisodyum salt çözeltisinde agregasyon oluşmadığı fakat farklı ölçümlerle
de teyit edilmesi gereken bir bulgu olduğu düşünülmektedir. Yapılan sitotoksisite testleri
sonucunda 1MHz frekans ve 3W/cm2
güçte 30sn süresince %20 puls ultrases uygulanmasına
karar verilmiştir. Uygulama dozu olarak pifithrin-μ için 5μM ve klorin e6 için 5μM dozları
seçilmiştir. Deney grupları incelendiğinde klorin e6 yüklü mikrokabarcıkların ultrases ile
yıkımı sonucu sitotoksisitede ve apoptoz süreçlerinde istatistiksel anlamlı sonuçlar elde
edilmiştir. Isı şok proteini inhibisyonu ile sinerjetik etki gösteren veriler elde edilmiştir.
Sonuç: Sonuç olarak, kombine gruplarda gözlenen artmış hücre ölümü ve apoptoz verisinin
tek başına ultrases, pifithrin-μ ve klorin e6 yüklü mikrokabarcık gruplarında görülen etkinin
toplamından istatistiksel anlamlı olarak daha fazla olduğu gözlenmiştir.
Anahtar kelimeler: Mikrokabarcık, ısı şok protein, sonodinamik terapi, mide kanser |
tr_TR |
dc.description.tableofcontents |
İÇİNDEKİLER
KABUL VE ONAY...........................................................................................................i
TEŞEKKÜRLER ..............................................................................................................ii
İÇİNDEKİLER ................................................................................................................iii
SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ ....................................................................vi
ŞEKİLLER DİZİNİ........................................................................................................viii
RESİMLER DİZİNİ........................................................................................................xii
TABLOLAR DİZİNİ .....................................................................................................xiii
ÖZET..............................................................................................................................xiv
ABSTRACT....................................................................................................................xv
1.GİRİŞ .............................................................................................................................1
2.GENEL BİLGİLER .......................................................................................................3
2.1. Kanser ....................................................................................................................3
2.1.1. Mide Kanseri ve İnsidansı...............................................................................6
2.1.2. Kanserde Tedavi Yöntemleri ..........................................................................7
2.2. Heat Shock Proteinleri ...........................................................................................9
2.2.1. Heat Shock Protein 70...................................................................................11
2.2.2. Heat Shock Protein 70’in Kanserlerde Rolü ve İnhibitörler.........................13
2.3. Pifithrin ................................................................................................................17
2.4. Ultrases.................................................................................................................18
2.5. Sonodinamik Terapi.............................................................................................20
2.5.1. Sonodinamik Terapinin Etki Mekanizmaları................................................24
2.6. Sonoduyarlaştırıcılar ............................................................................................27
2.6.1. Klorin e6 .......................................................................................................29
2.7. Mikrokabarcıklar..................................................................................................30
iv
2.7.1. Mikrokabarcık ve Ultrases Etkileşimi...........................................................34
2.7.2. Sonoporasyon................................................................................................37
3.GEREÇ VE YÖNTEM ................................................................................................39
3.1. GEREÇ.................................................................................................................39
3.1.1. Kullanılan Cihazlar .......................................................................................39
3.1.2. Kullanılan Kimyasallar .................................................................................39
3.2. YÖNTEM.............................................................................................................40
3.2.1. Hücre Hattının Temini, Ekimi, Çoğaltılması ve Deney Protokolüne Uygun
Hazırlanılması...................................................................................................................40
3.2.2. Kimyasalların Hazırlanması..........................................................................42
3.2.3. Mikrokabarcık Üretimi..................................................................................43
3.2.4. Dinamik Işık Saçılımı Cihazı ile Mikrokabarcık Boyut Analizi...................44
3.2.5. Görüntü İşleme Yöntemi ile Mikrokabarcık Boyut Analizi .........................44
3.2.6. Ultrases Kavitasyon Analizi..........................................................................44
3.2.7. Ultrases Aracılı Mikrokabarcık Yıkımı ........................................................44
3.2.8. Spektroskopik Yöntemler ile Mikrokabarcık İçi Klorin Tayini....................45
3.2.9. Deney Grupları ve Şematize Hali .................................................................46
3.2.10. Hücre Canlılığı Analizi ...............................................................................48
3.2.11. Hoechst Boyama ile Apoptotik Yapıların İncelenmesi...............................49
3.2.12. Western Blot Yöntemi ile Apoptotik Belirteçlerin İncelenmesi.................50
3.2.12.1. Hücrelerden Protein İzolasyonu...........................................................50
3.2.12.2. Bikinkoninik Asit (BCA) ile Protein Miktarı Tayini ...........................52
3.2.12.3. SDS-PAGE Jel Elektroforezi ...............................................................55
3.2.12.4. SDS-PAGE Jel Elektroforezinde Kullanılan Ayırıcı ve Toplayıcı Jelin
Hazırlanışı.....................................................................................................................56
3.2.12.5. SDS-PAGE Jel Elektroforezinde Örneklerin Hazırlanması ve Jele
Yüklenmesi...................................................................................................................57
3.2.12.6. SDS-PAGE Jelin Membrana Transfer Edilmesi, Blotlama .................59
v
3.2.12.7. Membranın Primer ve Sekonder Antikor ile Muamele Edilmesi ve
Görüntüleme .................................................................................................................60
3.2.13. Caspase 3-7 Analizi.....................................................................................63
3.2.14. Annexin V ve Ölü Hücre Analizi................................................................63
3.2.15. Oksidatif Stress Analizi...............................................................................64
3.2.16. İstatistiksel Değerlendirme .........................................................................65
4.BULGULAR................................................................................................................66
4.1. Mikrokabarcık Üretimi ........................................................................................66
4.2. DLS cihazı ile Mikrokabarcık Boyut Analizi ......................................................67
4.3. Görüntü işleme yöntemi ile Mikrokabarcık Boyut Analizi..................................69
4.4. Ultrases kavitasyon analizi...................................................................................70
4.5. Ultrases Aracılı Mikrokabarcık Yıkımı ...............................................................71
4.6. Spektroskopik Yöntemler ile Klorin Analizi .......................................................72
4.8. Hücre Canlılığı Analizi ........................................................................................75
4.9. Hoechst Boyama ile Apoptotik Yapıların İncelenmesi........................................89
4.10. Western Blot Yöntemi ile Apoptotik Belirteçlerin İncelenmesi........................92
4.11. Caspase 3-7 Analizi .........................................................................................101
4.12. Annexin V ve Ölü Hücre Analizi.....................................................................102
4.13. Oksidatif Stress Analizi....................................................................................103
5.TARTIŞMA ...............................................................................................................104
6.SONUÇ VE ÖNERİLER...........................................................................................114
KAYNAKLAR .............................................................................................................116
ÖZ GEÇMİŞ .................................................................................................................124 |
tr_TR |
dc.language.iso |
tur |
tr_TR |
dc.publisher |
Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü |
tr_TR |
dc.rights |
info:eu-repo/semantics/embargoedAccess |
tr_TR |
dc.subject |
Mikrokabarcık, ısı şok protein, sonodinamik terapi, mide kanseri |
tr_TR |
dc.title |
MİDE KANSERİ HÜCRELERİNE SONODİNAMİK TERAPİ UYGULAMASINDA HSP 70 İNHİBİSYONU VE KLORİN E6 YÜKLÜ MİKROKABARCIKLARIN ROLÜ |
tr_TR |
dc.type |
doctoralThesis |
tr_TR |
dc.contributor.authorID |
230086 |
tr_TR |
dc.contributor.department |
Adnan Menderes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Biyofizik (Tıp) Doktora Program |
tr_TR |