PROSTAT KANSERİNDE IRF5 TRANSKRİPSİYON FAKTÖRÜ VE CXCR4/CXCL12 KEMOKİN RESEPTÖRÜ ARASINDAKİ İLİŞKİ

DSpace Ana Sayfası
→
Tez
→
Yüksek Lisans
→
Öğe Göster

dc.contributor.advisor	Çevik, Özge
dc.contributor.author	Büyükkarıncalı, Nesrin
dc.date.accessioned	2021-08-31T05:07:50Z
dc.date.available	2021-08-31T05:07:50Z
dc.date.issued	2021
dc.date.submitted	2021-06-24
dc.identifier.citation	BÜYÜKKARINCALI Nesrin,Prostat Kanserinde IRF5 Transkripsiyon Faktörü ve CXCR4/CXCL12 Kemokin Reseptörü Arasındaki İlişki, Aydın, 2021	tr_TR
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11607/4127
dc.description.abstract	PROSTAT KANSERİNDE IRF5 TRANSKRİPSİYON FAKTÖRÜ VE CXCR4/CXCL12 KEMOKİN RESEPTÖRÜ ARASINDAKİ İLİŞKİ Büyükkarıncalı N. Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Biyokimya (Tıp) Programı Yüksek Lisans Tezi, Aydın, 2021 Amaç: Kemokinler kanserde metastaz oluşumunu sağlayan ve tümörün mikroçevresini etkileyen geniş bir polipeptid ailesidir. İntereferon regülatör faktör-5 (IRF5) bir transkripsiyon faktörü olup interferonlar ve sitokinlerin uyarımında önemli bir proteindir. Bu tez çalışmasında IRF5 ile bir kemokin reseptör ailesi üyesi CXCR4/CXCL12’nin prostat kanserindeki rolü ve aralarındaki ilişkinin araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Araştırmada androjenden bağımsız insan prostat kanser hücre hattı PC3 kullanılmıştır. PC3 hücrelerinde, IRF5 ekspresyonu için pIRF5 plazmidi kullanılmış ve trasfekte edilmiştir. CXCR4 ve CXCL12 protein ekspresyon düzeyleri western blot ile ve gen ekspresyon düzeyleri ise qPCR yöntemi ile tespit edilmiştir. IRF5 transfeksiyonu sonrasında hücrelerde koloni oluşumu incelenmiş ve hücre medyumlarında CXCL12 sekresyonu ölçülmüştür. Bulgular: IRF5 transfekte edilen PC3 hücrelerinde hücre canlılığı ve koloni oluşumunun anlamlı derecede azaldığı tespit edilmiştir. IRF5 trensfekte edilen hücrelerin CXCR4 ve CXCL12 protein ekspresyonu ve gen ekspresyon düzeylerinin anlamlı derecede azaldığı görülmüştür. Sonuç: Bu çalışma bir transkripsiyon faktörü olan IRF5’in prostat kanserinde gelişen mikroçevre aracılı metastazda rol oynayan CXCR4/CXCL12 üzerinde etkisinin olduğunu göstermektedir. Prostat kanser tedavisinde IRF5 gen terapisi metastazın egnellenmesini sağlayabilir ve bu konuda yeni geliştirilecek tedavi yöntemleri için önemli katkılar sunabilir. Anahtar Kelimeler: CXCL12 (SDF1), CXCR4, IRF5, Kanser immünolojisi, Prostat kanseri	tr_TR
dc.description.sponsorship	Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından TPF-19021 proje numarası ile desteklenmiştir	tr_TR
dc.description.tableofcontents	İÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY SAYFASI iii TEŞEKKÜR iv İÇİNDEKİLER v SİMGELER ve KISALTMALAR DİZİNİ viii ŞEKİLLER DİZİNİ xi RESİMLER DİZİNİ xiii TABLOLAR DİZİNİ xiv ÖZET xv ABSTRACT xvi 1.GİRİŞ 1 2. GENEL BİLGİLER 3 2.1. Prostat Kanseri 3 2.1.1 Prostat Dokusu, Anotomisi ve Fonksiyonu 5 2.1.2. Etiyoloji ve Risk Faktörleri 6 2.1.3. Prostat Kanserinde Klinik Bulgular ve Tanı 7 2.1.4. Prostat Kanserinde Evreleme 10 2.1.5. Prostat Kanserinde Tedavi 12 2.2. Kemokinler 13 2.2.1. CXCL12/SDF-1 Kemokin Ligandı 15 2.2.2. CXCR4 Kemokin Reseptörü 16 2.2.3. CXCL12 / CXCR4 Ekseniyle Düzenlenen Biyolojik Süreçler 19 2.2.4 CXCL12/CXCR4 Kanser İlişkisi 20 2.3. İnterferonlar (IFN) 21 2.3.1. Tip I İnterferonlar 22 2.3.2. Tip II İnterferonlar 23 2.3.3. Tip III İnterferonlar 24 2.4. İnterferon Düzenleyici Faktörler (IRF) 26 2.4.1. IRF 5 (İnterferon Düzenleyici Faktör 5) 29 3. GEREÇ VE YÖNTEM 31 3.1 Kullanılan Malzemeler 31 3.2. Kullanılan Cihazlar 32 3.3. Hücre Kültürü 32 3.3.1. Hücrelerin Büyütülüp Çoğaltılması 32 3.3.2. Hücrelerin Pasajlanması 32 3.4. pIRF5 Plazmitlerinin Çoğaltılması ve İzolasyonu 33 3.4.1. Elektroporasyon 33 3.4.1.1 Bakteri Kültürlerinin, Araçlarının ve Reaktiflerinin Hazırlanması 34 3.4.1.2 Elektrokompetent Bakterilerin Büyümesi 34 3.4.1.3 Elektrokompetent Bakteriyel Hücrelerin Hazırlanması 35 3.4.1.4 Elektrokompetent Bakterilerin Transformasyonu 35 3.4.2. Plazmid İzolasyonu 36 3.4.3. Plazmidlerin Miktar Tayini 38 3.5. IRF5 Plazmidi Transfeksiyon İşlemi 38 3.6. Hücrelerde Yapılan Western Blot Çalışmaları 39 3.6.1. SDS Page Jel Elektroforezi (Sodyum Dodesil Sülfat Poliakrilamit Gel Elektroforezi) ve Western Blot Tekniği 39 3.6.2. Western Blot/SDS Page Aşamasında Hazırlanan Çözeltiler 40 3.7. Hücrelerde Yapılan QPCR Çalışmaları 43 3.7.1. RNA İzolasyonu 43 3.7.2 cDNA (Complementer DNA) Sentezi 44 3.7.3. QPCR Yöntemi 44 3.8. İstatiksel Analiz 45 4. BULGULAR 46 4.1. Plazmidlerin Çoğaltılması ve Klonların Seçimi 46 4.2. Transfeksiyon Sonucu Hücrelerdeki Değişiklikler 46 4.3. PC3 Hücrelerinde Western Blot Analizleri 48 4.4. PC3 Hücrelerinde QPCR ile gen Ekspresyon Analizleri 52 5. TARTIŞMA 55 6. SONUÇ ve ÖNERiLER 60 KAYNAKLAR 61 BILIMSEL ETIK BEYANI 72 ÖZGEÇMİŞ 73	tr_TR
dc.language.iso	tur	tr_TR
dc.publisher	Aydın Adnan Menderes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü	tr_TR
dc.rights	info:eu-repo/semantics/closedAccess	tr_TR
dc.subject	CXCL12 (SDF1), CXCR4, IRF5, Kanser immünolojisi, Prostat kanseri	tr_TR
dc.title	PROSTAT KANSERİNDE IRF5 TRANSKRİPSİYON FAKTÖRÜ VE CXCR4/CXCL12 KEMOKİN RESEPTÖRÜ ARASINDAKİ İLİŞKİ	tr_TR
dc.type	masterThesis	tr_TR
dc.contributor.department	Aydın Adnan Menderes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyokimya Anabilim Dalı	tr_TR