eArşiv@Adu

Kainik asit ile oluşturulan eksitotoksitite modelinde endoplazmik retikulum stres markerlarının araştırılması

Basit öğe kaydını göster

dc.contributor.advisor Dönmez Yalçın, Gizem
dc.contributor.author Sarı, Alime
dc.date.accessioned 2021-02-01T11:32:04Z
dc.date.available 2021-02-01T11:32:04Z
dc.date.issued 2020
dc.date.submitted 2020-01-10
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11607/3975
dc.description.abstract Endoplazmik Retikulum (ER) stresi yanlış katlanmış ya da katlanamamış proteinlerin birikmesi sonucunda ortaya çıkmaktadır. ER stresi, tüm beyin hastalıklarında, kanser ve metabolik hastalıklarda görülen adaptif bir stres cevabıdır. Eksitotoksisite, sinapslarda fazla glutamat birikimiyle meydana gelir. Kainik asit hücresel ve hayvansal modellerde eksitotoksisiteye yol açan bir toksindir. Kainik asite bağlı eksitotoksisite hücrede strese neden olur. Bu nedenle, bu çalışmada, amacımız, kainik asite bağlı eksitotoksisite ve ER stres arasındaki ilişkiyi iki majör endoplazmik retikulum stres markırı olan ATF5 ve fosforile eIF2’yı analiz ederek incelemektir. MTT Assay Testi ile 50, 200, 1000 µM dozlarında kainik asit, N2A hücrelerine verilerek 24 saat sonunda hangi dozlarda hücre ölümü gerçekleştiği belirlendi. 24 saat inkübasyon sonucunda kontrol grubu ve kainik asit verilen hücrelerden protein ekstraktları elde edildi. Bradford Assay ile protein miktar tayini gerçekleştirildi. ER stres markırlarından; ATF5 ve fosforile eIF2 markırları western blot yöntemi ile incelenmiştir. Kainik asit ile muamele edilmiş neuroblastoma hücrelerinde ATF5 ve fosforile eIF2 seviyelerinin kontrole göre değişmediği ilk kez gösterildi. Çalışmamız sonucunda 50, 200, 1000 µM ve 24 saat süren kainik asit muamelesi, ATF5 ve fosforile eIF2 ile gösterilebilecek endoplazmik retikulum stresi oluşturmak için yeterli olmayabileceği düşünüldü. Süre ve konsantrasyon olarak arttırılmış kainik asit muamelesi ya da farklı markırların denenmesi gerekmektedir. tr_TR
dc.description.tableofcontents KABUL VE ONAY SAYFASI i TEŞEKKÜR ii SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİSİ v ŞEKİLLER DİZİNİ vii TABLOLAR DİZİNİ viii ABSTRACT x 1. GİRİŞ ………………………………………………………………………………………..1 2. GENEL BİLGİLER ………………………………………………………………………….2 2.2. Endoplazmik Retikulum Stresi 3 2.3. Nörodejeneratif Hastalıklarda Endoplazmik Retikulum Stresi 6 2.4.Fosforile eIF2-α Stres Markırı 7 2.5. ATF-5 Stres Markırı 10 2.6. Eksitotoksisite 11 2.7.Glutamat 12 2.7.1. Glutamat Biyosentezi 15 2.7.2. Glutamat Reseptörleri 15 2.7.3. Glutamat Taşıyıcıları 17 3. GEREÇ VE YÖNTEMLER ………………………………………………………………..20 3.1. Gereç 20 3.1.1. Kullanılan Cihazlar 20 3.3. Deney Düzeneğinin Hazırlanması 22 3.3.1.Çalışmada Kullanılan Hücre Tipi 22 3.3.2. Hücre Kültürü Uygulamaları 23 3.3.2.1.Hücre Çözme ve Hücre Kültürü 23 3.3.2.3.Hücrelerin pasajlanması 24 3.3.2.4.Hücrelerin sayılması ve hücre canlılığı 25 3.3.2.5. Dondurma besiyerinin hazırlanması 25 3.3.2.6. Hücrelerin dondurulması 25 3.3.3. Kainik Asitin Konsantre Edilmesi ve Uygulama Dozlarının Hazırlanması 26 3.3.4. MTT Testi Assay Testi ve Uygun Kainik Asit Konsantrasyonunun Belirlenmesi 27 3.3.5.Hücre Kültürü ve Kainik Asit Uygulaması 28 3.3.6. RIPA Lizis Tamponu Kullanılarak Protein İzolasyonu 29 3.3.7. Bradford (Coomassie Brillant Blue ile Protein Miktar Tayini) Yöntemi 30 3.3.8. Western Blot: 31 3.3.8.2 Western Blot Aşamaları 33 3.3.8.3.Örneklerin hazırlanması, jele yüklenmesi ve jel elektroforezi: 33 3.3.8.4. Jelden membrana transfer, bloklama, blotlama ve görüntüleme 34 3.4.İstatislikler 35 4. BULGULAR ……………………………………………………………………………….36 4.1. MTT Sonuçlarının Değerlendirilmesi 36 4.2. Western Blot Sonuçlarının Değerlendirilmesi 37 4.2.1. Bradford Assay ile Protein Miktar ve Konsantrasyon Tayininin Sonuçları 37 4.2.2. ATF-5 Markırının Western Blot ile Tespiti 38 4.2.3. Fosforile eIF2α Markırının Western Blot ile Tespiti 39 4.2.4. Western Blot Sonrası Bantların Image J Programı ile Kuantifikasyonu 40 5. TARTIŞMA ………………………………………………………………………………...41 SONUÇ VE ÖNERİLER ……………………………………………………………………..42 KAYNAKLAR ………………………………………………………………………………..43 ÖZGEÇMİŞ …………………………………………………………………………………..49 tr_TR
dc.language.iso tur tr_TR
dc.publisher ADNAN MENDERES ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ tr_TR
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess tr_TR
dc.subject Research Subject Categories::MEDICINE ATF5, Fosforile eIF2alpha, Eksitotoksitite, Endoplazmik Retikulum Stresi, Kainik Asit tr_TR
dc.title Kainik asit ile oluşturulan eksitotoksitite modelinde endoplazmik retikulum stres markerlarının araştırılması tr_TR
dc.title.alternative Investigation of endoplasmic reticulum stress markers in A kainic acid formed excitotoxicity model tr_TR
dc.type masterThesis tr_TR
dc.contributor.department Adnan Menderes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı tr_TR


Bu öğenin dosyaları:

Bu öğe aşağıdaki koleksiyon(lar)da görünmektedir.

Basit öğe kaydını göster