İncirde (Ficus carica L.) rapd, srap ve scar belirteçleri ile cinsiyetin belirlenmesi

DSpace Ana Sayfası
→
Tez
→
Yüksek Lisans
→
Öğe Göster

dc.contributor.advisor	Dalkılıç, Zeynel
dc.contributor.author	Ağır, Ahmet Rıza
dc.date.accessioned	2020-08-17T12:44:15Z
dc.date.available	2020-08-17T12:44:15Z
dc.date.issued	2019
dc.date.submitted	2019
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11607/3910
dc.description.abstract	Türkiye’nin en önemli zirai ihracat ürünlerinden biri olan incir (Moraceae Ficus carica L. 2n=2x=26) ginodioik bir bitkidir. Dişi bitkilerin meyveleri taze ve kuru olarak tüketilmekte ve erkeklere göre daha çok ticari öneme sahiptir. İncirde melez tohumdan (çöğür) elde edilen bitkilerin cinsiyetinin morfolojik olarak belirlenmesi gençlik kısırlığı yüzünden 5-7 yıl sürmektedir. İncirde ıslah çalışmalarını hızlandırmak için cinsiyete bağlı belirteçlerin bulunması çok önemli olup incirde cinsiyeti belirleyen bölgeye ait belirteç bulmak amacıyla 2016-2017 yıllarında yapılan bu çalışmada ticari önemi yüksek yerli 5 dişi (‘Sarılop’, ‘Siyah Orak’, ‘Bursa Siyahı’, ‘Morgüz’, ‘Yeşilgüz’) ve 5 erkek (‘Kaba’, ‘Karabulut’, ‘Kıbrıslı’, ‘Taşlık’, ‘Yanako’) incir çeşidi kullanılmıştır. Cinsiyete göre oluşturulan kümelerde BSA (Küme Açılım Analizi) ile 110 RAPD (Rastgele Çoğaltılmış DNA Polimorfizmi) primeri ve 154 SRAP (Baz Dizisi İlişkilendirimiş Çoğaltılmış Polimorfizim) primer kombinasyonu test edilmiştir. RAPD ve SRAP primerlerinin hiçbiri cinsiyete bağlı polimorfik bant oluşturmamıştır. İncir genomunda cinsiyetle bağlantılı gen bölgesi içinde olduğu belirtilen 7 SCAR primerinden sadece MADF4 ve MADF6 primerleri sırasıyla 1.450 bp ve 1.300 bp boyutunda erkek cinsiyetine bağlı bant oluşturmuşlardır. Bu çalışmaya göre MADF4 ve MADF6 SCAR primerleri ile çiçeklenme öncesi gençlik kısırlığı döneminde yerli dişi ve erkek incir çeşitlerinin cinsiyeti %100 güvenilirlikle belirlenebilir	tr_TR
dc.description.tableofcontents	İÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY SAYFASI .......................................................................... iii BİLİMSEL ETİK BİLDİRİM SAYFASI ........................................................... v ÖZET .................................................................................................................. vii ABSTRACT ........................................................................................................ ix ÖNSÖZ ............................................................................................................... xi KISALTMALAR DİZİNİ ................................................................................... xv ŞEKİLLER DİZİNİ ............................................................................................. xvii ÇİZELGELER DİZİNİ ....................................................................................... .xix 1. GİRİŞ .............................................................................................................. 1 2. KAYNAK ÖZETLERİ .................................................................................. 7 2.2. RAPD ........................................................................................................... 7 2.2. SRAP ............................................................................................................ 7 2.3. SCAR ........................................................................................................... 8 2.4. BSA .............................................................................................................. 8 2.5. Bitkilerde Cinsiyeti Belirlemeye Yönelik Yapılmış Çalışmalar .................. 8 2.6. İncirde Yapılan Moleküler Belirteç Çalışmaları .......................................... 10 3. MATERYAL VE YÖNTEM .......................................................................... 14 3.1 Materyal ........................................................................................................ 14 3.2 Yöntem .......................................................................................................... 14 3.2.1. DNA Çıkartılması ..................................................................................... 15 3.2.2. BSA Analizi .............................................................................................. 17 3.2.3. RAPD-PCR Analizi .................................................................................. 17 xiv 3.2.4. SRAP PCR Analizi .................................................................................... 19 3.2.5. SCAR-PCR Analizi ................................................................................... 21 3.2.4. Agarose Jel Elektroforezi .......................................................................... 23 3.2.5. Verilerin Değerlendirilmesi ....................................................................... 24 4. BULGULAR ................................................................................................... 26 4.1. DNA Çıkartılması ......................................................................................... 26 4.1.1. 16/06/2016 Tarihindeki DNA Çıkartılması ............................................... 26 4.1.2. 22/09/2016 Tarihindeki DNA Çıkartılması ............................................... 27 4.2. PCR Uygulamaları ........................................................................................ 28 4.2.1. Sipariş Verilen Primerler ile Yapılan RAPD-PCR .................................... 28 4.2.2. Operon Primerler ile Yapılan RAPD-PCR ................................................ 30 4.2.3. SRAP-PCR Analizleri ............................................................................... 34 4.2.4. SCAR-PCR Analizleri ............................................................................... 40 5. TARTIŞMA VE SONUÇ ................................................................................ 44 KAYNAKLAR .................................................................................................... 47 ÖZGEÇMİŞ ......................................................................................................... 55	tr_TR
dc.language.iso	tur	tr_TR
dc.publisher	Adnan Menderes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü	tr_TR
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	tr_TR
dc.subject	Ficus carica, Cinsiyete bağlı belirteç, Bitki ıslahı, BSA, RAPD, SCAR, SRAP	tr_TR
dc.title	İncirde (Ficus carica L.) rapd, srap ve scar belirteçleri ile cinsiyetin belirlenmesi	tr_TR
dc.type	masterThesis	tr_TR
dc.contributor.department	Aydın Adnan Menderes Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı	tr_TR