dc.contributor.advisor |
Ertabaklar, Hatice |
|
dc.contributor.advisor |
Güçlü, Özgür |
|
dc.contributor.author |
Yıldız, İbrahim |
|
dc.date.accessioned |
2020-02-13T10:59:56Z |
|
dc.date.available |
2020-02-13T10:59:56Z |
|
dc.date.issued |
2020-02-13 |
|
dc.date.submitted |
2020-01-21 |
|
dc.identifier.uri |
http://hdl.handle.net/11607/3687 |
|
dc.description.abstract |
Bu çalışmanın amacı Aydın Adnan Menderes Üniversitesi, Uygulama ve Araştırma Hastanesi, Parazitoloji Laboratuvarı’na çeşitli kliniklerden selofan bant ve dışkı örnekleri gönderilen olgularda Enterobius vermicularis (E. vermicularis) ve Dientamoeba fragilis (D. fragilis) birlikteliğini araştırmak ve bulunan D. fragilis’lerin genotiplerini belirlemektir. Ayrıca D. fragilis tanısında kullanılan trikrom boyama ve polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemlerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır.
Bu amaçla laboratuvarımıza gönderilen selofan bant örneklerinde E. vermicularis yumurtası saptanan 74 olgunun dışkı örneği ile yumurta saptanmayan 74 olguya ait toplam 148 dışkı örneği çalışmaya dahil edilmiştir. Tüm örneklere trikrom boyama ve PZR yöntemleri uygulanarak D. fragilis araştırılmıştır. Dientamoeba fragilis izolatlarının alt tiplerinin belirlenmesi için 18S ribozomal RNA gen bölgesi sekanslanmıştır. Ayrıca D. fragilis saptanan olguların demografik özellikleri ve klinik bulguları değerlendirilmiştir.
Çalışmamızda E. vermicularis pozitif 74 olgunun trikrom boyama yöntemi ile üçünde (%4,05), PZR yöntemiyle ise 28’inde (%37,8) D. fragilis varlığı saptanmıştır. Kontrol grubunu oluşturan E. vermicularis negatif 74 olgunun ise trikrom boyama yöntemi ile birinde (%1,35) PZR yöntemi ile ise 14’ünde (%18,91) D. fragilis saptanmıştır. Enterobius vermicularis ile D. fragilis’in birlikte görülme olasılığı istatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur (p<0,05). Sekans analizi yapılan 26 D. fragilis izolatının tamamı genotip 1 olarak belirlenmiştir. Dientamoeba fragilis varlığı ile klinik bulgular arasında anlamlı bir ilişki bulunamamıştır. Cinsiyet ve yaşanan bölge ile D. fragilis görülmesi arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark saptanmamıştır.
Dientamoeba fragilis’in direkt mikroskopik tanısı oldukça zor olup bu nedenle rutin tanıda sıklıkla boyama yöntemleri ve kültür tercih edilmektedir. Son yıllarda moleküler yöntemlerin gelişmesiyle parazitin tanısında kullanılmaya başlanmıştır. Bu çalışmanın sonucunda Enterobius vermicularis saptanan olgularda D. fragilis’in sıklıkla eşlik edebileceği görülmüş olup E. vermicularis’li olgularda D. fragilis varlığının araştırılması akla getirilmelidir. Ayrıca D. fragilis tanısında yüksek duyarlılık ve özgüllük değerlerine sahip PZR gibi ikinci bir yöntemin kullanılmasının yanlış sonuçları önlemek için faydalı olabileceği düşünülmüştür. Klinik bulgular ve D. fragilis arasında anlamlı bir ilişkinin bulunamaması parazitin patojen ve apatojen alt tiplerinin olabileceği görüşünü desteklemekte olup bu konuda yapılacak yeni araştırmaların yapılması gerektiği vurgulanmıştır. |
tr_TR |
dc.description.tableofcontents |
KABUL VE ONAY SAYFASI i
TEŞEKKÜR ii
İÇİNDEKİLER iii
SİMGELER ve KISALTMALAR DİZİNİ v
ŞEKİLLER DİZİNİ vi
RESİMLER DİZİNİ vii
TABLOLAR DİZİNİ iix
ÖZET ix
ABSTRACT xi
1. GİRİŞ 1
2. GENEL BİLGİLER 2
2.1. Dientamoeba fragilis Tarihi 2
2.2. Taksonomi 3
2.3. Morfoloji 3
2.3.1. Trofozoit 4
2.3.2. Prekist 5
2.3.3. Kist 5
2.4. Dientamoeba fragilis’in Genotiplendirilmesi 7
2.5. Yaşam Döngüsü ve Bulaş 8
2.6. Epidemiyoloji 10
2.7. Patogenez ve Klinik 14
2.8. Tanı Yöntemleri 14
2.8.1. Mikroskopik Tanı Yöntemleri 15
2.8.2. Kültür 16
2.8.3. İmmunolojik Testler 17
2.8.4. Moleküler Tanı Yöntemleri 18
2.9. Tedavi ve Korunma 21
3. GEREÇ VE YÖNTEM 23
3.1. Olguların Seçilmesi ve Örneklerin Toplanması 23
3.2. Selofan Bant Örneklerinde Direkt Mikroskopi ile Enterobius vermicularis
Araştırılması. 23
3.3. Dışkı Örneklerinde Kalıcı Boyama ile Dientamoeba fragilis Araştırılması 24
3.3.1 Trikrom Boyama 24
3.3.1.1. Kullanılan Malzemelerin Hazırlanması 24
3.3.1.1.1. Trikrom Boyası 24
3.3.1.1.2. D’antoni İyot Solüsyonu 24
3.3.1.1.3. %90’lık Asit Alkol 25
3.3.1.1.4. Schaudin Fiksatifi 25
3.3.1.2. Yöntem 25
3.4. DNA İzolasyonu 26
3.4.1. DNA İzolasyon Protokolü 26
3.5. İzolatlarda PZR Yöntemi ile Dientamoeba fragilis Araştırılması 27
3.6. Sekans Analizi ve İzolatlar Arasındaki Genetik Uzaklığın Belirlenmesi 28
3.7. İstatistiksel Analizler 28
3.8. Anket Formu 29
4. BULGULAR 30
4.1. Dışkı Örnekleri ve Olgular 30
4.2. Direkt Mikroskopi 30
4.3. PZR Sonuçları 31
4.4. Dientamoeba fragilis ve Enterobius vermicularis Birlikteliğinin
Karşılaştırılması 32
4.5. Saptanan D. fragilis PZR Ürünlerinin Sekans Analiz Sonuçları 33
4.6. Dientamoeba fragilis 18S rRNA Dizilerinin Filogenetik Analizi 40
4.7. Tanıda Kullanılan Yöntemlerin Karşılaştırılması 41
4.8. Demografik Özellikler ve Semptomların Analizi 43
5. TARTIŞMA 46
6. SONUÇLAR VE ÖNERİLER 55
KAYNAKLAR 56
Ek 1 Etik Kurul Onayı 70
ÖZGEÇMİŞ 71 |
tr_TR |
dc.language.iso |
tur |
tr_TR |
dc.rights |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
tr_TR |
dc.subject |
Aydın, Dientamoeba fragilis, Enterobius vermicularis, PZR, trikrom |
tr_TR |
dc.title |
ENTEROBIUS VERMICULARIS SAPTANAN OLGULARIN DIŞKILARINDA PZR YÖNTEMİ İLE DIENTAMOEBA FRAGILIS VARLIĞININ ARAŞTIRILMASI |
tr_TR |
dc.title.alternative |
THE INVESTIGATION OF DIENTAMOEBA FRAGILIS FREQUENCY IN FECAL SAMPLES OF ENTEROBIUS VERMICULARIS POSITIVE CASES BY PCR |
tr_TR |
dc.type |
doctoralThesis |
tr_TR |
dc.contributor.department |
Aydın Adnan Menderes Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Parazitloji Anabilim Dalı |
tr_TR |