eArşiv@Adu

Kainik asit ile hücrelerde eksitotoksisite modelinin oluşturulması ve Glutamat Taşıyıcısı-1 (GLT-1)'in incelenmesi.

Basit öğe kaydını göster

dc.contributor.advisor Dönmez Yalçın, Gizem
dc.contributor.author Uyarıcı, Rabia
dc.date.accessioned 2019-08-22T05:43:45Z
dc.date.available 2019-08-22T05:43:45Z
dc.date.issued 2019
dc.date.submitted 2019
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11607/3583
dc.description.abstract Eksitotoksisite, MSS’ nin moleküler işleyişinde sinaptik boşluğa salınan glutamatın, anormal ve aşırı artışı olarak tanımlanan bir durumdur. Çoğunlukla glutamatı sinaptik boşluktan temizleyecek glutamat taşıyıcılarının, glutamatın taşınımını gerçekleştirememesi sonucu gerçekleşir ve hücre ölümüyle sonuçlanır. Kainik asit, glutamat reseptör agonisti olarak bilinen güçlü bir nörotoksindir ve nöronal hasar oluşumu ve gelişimini tetikleyerek eksitotoksisiteye neden olur. MSS normal işleyişinde, presinaptik nöronlardan sinaptik boşluğa salınan glutamatın, astrositlerin ve postsinaptik nöronların membranlarında bulunan glutamat taşıyıcıları tarafından hücrelere alımı ve sinaptik boşluktan temizlenmesi gerçekleştirilmektedir. En fazla glutamat taşınımı GLT-1 ile sağlanmaktadır. Bu çalışmada; nöroblastoma ve glia hücrelerinde, kainik asit ile eksitotoksisitenin indüklenmesi sonucu GLT-1’in ifadesinde meydana gelen değişiklikler ve bu taşıyıcıların normal süreçteki glutamat taşınımında önemi gösterilmek istenmiştir. MTT Assay Testi ile 50, 200, 500, 1000 µM dozlarda kainik asit, N2A ve IHA hücrelerine verilerek 24 saat sonunda hangi dozda eksitotoksisite durumu ile hücre ölümü gerçekleştiği belirlenmiş, belirlenen dozda petrilerde kültüre edilen hücrelere kainik asit verilmiştir. 24 saat inkübasyon sonrası kontrol ve kainik asit verilen hücrelerden protein ekstraktları elde edilmiş ve protein miktar tayini gerçekleştirilmiştir. Western Blot tekniği kullanılarak GLT-1 taşıyıcısının protein düzeyindeki ifadesine bakılmıştır. Protein ifadesi belirlenemeyen hücrelerden RNA izolasyonu gerçekleştirilmiş, cDNA üretilmiş ve RT-PCR tekniği kullanılarak GLT-1’in mRNA düzeyindeki ifadesi kontrol ve kainik asit verilen örnekler arasında karşılaştırılmıştır. Bu çalışmalar sonucunda, kullanılan N2A hücre hattı için kainik asit ile indüklenen GLT-1 protein ifadesi Western Blot tekniği ile görüntülenemedi. Bu nedenle, kontrol ve kainik asit verilen N2A hücrelerinden RNA elde edilerek GLT-1’in mRNA düzeyi araştırıldı. GLT-1’in mRNA düzeyindeki ifadesinin, kainik asit verilmiş hücrelerde kontrole oranla arttığı gözlemlendi. Bununla birlikte, glia hücrelerinde yapılan çalışmalarda ise kainik asit verilen hücrelerin GLT-1 protein seviyesinin kontrol hücrelerine göre arttığı gözlemlendi. Her iki hücre türünde alınan sonuçlar birbiri ile uyumlu olup eksitotoksisite durumunda, sinaptik boşlukta fazla bulunan glutamatı toplamak için GLT-1 seviyesinde beklenen artışın görüldüğü bulundu. tr_TR
dc.description.sponsorship Adnan Menderes Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından TPF-17057 proje numarası ile desteklenmiştir. tr_TR
dc.description.tableofcontents 1.İÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY SAYFASI ……..………………………………………………….. i TEŞEKKÜR………………………………………………..……………….………… ii İÇİNDEKİLER………………………………………….…………………………… iii SİMGELERVE KISALTMALAR DİZİNİ………………..………………………… vi ŞEKİLLER DİZİNİ…………………………………………………………………… vii TABLOLAR DİZİNİ…………………………………………………………….…… ix ÖZET…………………………………………………………………………...…… x ABSTRACT……………………………………………………………………….…… xii 1. GİRİŞ……………………………………………………………………………..… 1 2. GENEL BİLGİLER……………………………………………………………….. 3 2.1. Kısa Bir Tarihçe ……………....………………………….……………………… 3 2.2. Bir Eksitatör Nörotransmitter: Glutamat …………...………………………… 4 2.3. Glutamat ve Biyosentezi……………………………………………………… 5 2.4. Glutamat Reseptörleri…………………………………………………………… 6 2.4.1. İyonotopik Reseptörler……………………………………………………….... 7 2.4.1.1. NMDA (N-metil-D-aspartat) reseptörleri………………………………........ 7 2.4.1.2. AMPA(α-amino-3-hidroksi-5-metil-4-isoksazolepropiyonik asit )/kainat reseptörleri.................................................................................................... 9 2.4.2. Metabotropik Reseptörler …………………………………………………….. 9 2.5. Glutamat Taşıyıcıları ………………………………………………………...... 11 2.5.1. GLAST (Glumat/Aspartat Taşıyıcısı) ……………………………………… 12 2.5.2. GLT-1 (Glutamat Taşıyıcısı-1) ……………………………………………… 12 2.5.3. EAAT-3 (Eksitatör Amino Asit Taşıyıcısı-3)………………………………. 13 2.5.4. EAAT-4 (Eksitatör Amino Asit Taşıyıcısı-4)…………...…………………… 14 2.5.5. EAAT-5 (Eksitatör Amino Asit Taşıyıcısı-5)……………...………………… 14 2.6. Glutamat Taşınımı (Glutamate Uptake) …………………………………… 15 2.7. Eksitotoksisite ……………………………………………………………… 17 3. GEREÇ VE YÖNTEM……………………………………………………… 20 3.1. Kullanılan Malzemeler...……………………………………………………. 20 3.2. Kullanılan Cihazlar…......…………………………..……………………… 22 3.3. Deney Düzeneğinin Hazırlanması………………………………………….. 23 3.3.1. Hücre Kültürü Uygulamaları ……………………………………………… 23 3.3.1.1. Hücre çözme …….....……………………………………..…....……...… 23 3.3.1.2. Hücrelerin pasajlanması ………………………………………………… 23 3.3.1.3. Hücrelerin sayılması ve hücre canlılığı……………………………………… 24 3.3.1.4. Dondurma besiyerinin hazırlanması………………………………………… 24 3.3.1.5. Hücrelerin dondurulması…………………………………………………… 25 3.3.1.6. Besiyeri hazırlama…………………………………………………………… 26 3.3.2. Kainik Asitin Konsantre Edilmesi ve Uygulama Dozlarının Hazırlanması…… 26 3.3.3. MTT (Metiltiazol difenil tetrazolyum) Assay Testi ve Uygulama Yapılacak Kainik Asit Dozunun Belirlenmesi................................................................................. 27 3.3.4. Hücre Kültürü ve Kainik Asit Uygulaması………………………………… 28 3.3.5. RIPA Lizis Tamponu Kullanılarak Protein İzolasyonu……………………. 29 3.3.6. Bradford Assay (Protein Miktarı Tayini)…………………………………… 29 3.3.7. Western Blot ………………………………………………………………… 31 3.3.7.1. Tampon çözeltilerin hazırlanması…………………………………………… 32 3.3.7.2. Örneklerin hazırlanması, jele yüklenmesi ve jel elektroforezi………………… 32 3.3.7.3. Jelden membrana transfer, bloklama, blotlama ve görüntüleme …………… 33 3.3.8. RNA İzolasyonu………………………………………………………… 34 3.3.9. cDNA Sentezi ……………………………………………………… 35 3.3.10. Real Time PCR (qPCR - Kuantitatif PCR) …………………………… 36 3.4. İstatistik……………………………………………………………………… 39 4. BULGULAR …………………………………………………………………… 40 4.1. MTT Sonuçlarının Değerlendirilmesi………………………………………… 40 4.2. Western Blot Sonuçlarının Değerlendirilmesi………………………………… 41 4.2.1. Bradford Assay ile Protein Miktarı Tayininin Sonuçları………………… 41 4.2.2. GLT-1 Proteininin İfadesinin Western Blot ile Tespiti …………………… 43 4.2.3. Western Blot Sonrası Bantların Image J programı ile Kuantifikasyonu… 45 4.3. Kuantitatif PCR (qPCR) Sonuçlarının Değerlendirilmesi.......……………… 47 5. TARTIŞMA …………………………………………………………………… 51 6. SONUÇLAR VE ÖNERİLER…………………………………………………… 53 KAYNAKLAR……………………………………………………………………… 54 ÖZGEÇMİŞ……………………………………………………………………………. 59 tr_TR
dc.language.iso tur tr_TR
dc.publisher Aydın Adnan Menderes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü tr_TR
dc.rights info:eu-repo/semantics/closedAccess tr_TR
dc.subject EAAT-2, eksitotoksisite, glutamat taşınımı, kainik asit tr_TR
dc.title Kainik asit ile hücrelerde eksitotoksisite modelinin oluşturulması ve Glutamat Taşıyıcısı-1 (GLT-1)'in incelenmesi. tr_TR
dc.type masterThesis tr_TR
dc.contributor.department Aydın Adnan Menderes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı tr_TR


Bu öğenin dosyaları:

Bu öğe aşağıdaki koleksiyon(lar)da görünmektedir.

Basit öğe kaydını göster