eArşiv@Adu

RATLARDA YANGI ŞİDDETİNİN BAZI AKUT FAZ PROTEİNLERİ VE GEN EKSPRESYONLARINA ETKİSİ

Basit öğe kaydını göster

dc.contributor.advisor Ulutaş, Pınar Alkım
dc.contributor.author Abbak, Mürüvvet
dc.date.accessioned 2019-07-29T11:27:38Z
dc.date.available 2019-07-29T11:27:38Z
dc.date.issued 2019
dc.date.submitted 2019-04-05
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11607/3570
dc.description.abstract ÖZET RATLARDA YANGI ŞİDDETİNİN BAZI AKUT FAZ PROTEİNLERİ VE GEN EKSPRESYONLARINA ETKİSİ Abbak M. Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Biyokimya Programı Doktora Tezi, Aydın, 2019. Balıklardan memelilere tüm canlılarda mikroorganizmalar, fiziksel, kimyasal ve enfeksiyon etkenleri, tümör faktörleri ve immunolojik nedenler gibi çeşitli faktörlere bağlı olarak inflamasyon şekillenir. Bu sürecin bir parçası olan ve başlıca karaciğerden sentezlenen akut faz proteinleri (AFP), inflamasyona karşı savunma mekanizmasının bir parçasıdır. Aynı zamanda klinik olarak tanı amaçlı kullanılmaktadır. Bu çalışmada deneysel yangı oluşturulan ratlardaki AFP düzeyleri ile bunların karaciğerdeki gen ekspresyonlarını birlikte değerlendirmek ve doza bağlı kan ve ekspresyon düzeylerinin etkilenip etkilenmediğinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Araştırmamızda 12-14 haftalık, ortalama 220-300 g ağırlığında 147 adet Wistar albino dişi rat kullanılmıştır. Ratlarda farklı şiddette akut yangı oluşturmak için hayvanlara Freund’s Complate Adjuvant (FCA, Sigma-Aldrich Chemical Co LTD, Poole, UK) uygulaması yapılmıştır. Ratlar rastgele olarak 5 gruba bölünerek her bir gruba (Kontrol grubu n=7 ve deneme grupları n=35 hayvan) sırasıyla 0, 1.25, 2.5, 5 ve 10 ml/kg dozlarında FCA (Mycobacterium tuberculosis- 1μg/ml) intraperitonal olarak enjekte edilmiştir. FCA uygulanan dört grubun (grup 2, 3, 4, 5) herbirinden 6, 12, 24, 48 ve 96. saatlerde rastgele seçilen yedişer rattan kan ve doku örnekleri uygun şekilde toplanarak saklanmıştır. Elde edilen serum örneklerinden C-reaktif protein (CRP), Serum Amiloid A (SAA) ve Haptoglobin (Hp) ELISA yöntemi ile analiz edilmiştir. Doku örneklerinden sırasıyla mRNA ve cDNA sentezleri yapılmış ve real time PCR’da uygun primerler kullanılarak CRP, SAA, Hp ve GAPDH genlerine ait ekspresyon düzeyleri belirlenmiştir. Serum protein fraksiyonları elektroforetik olarak gösterilmiş ve sonuçlar istatistiki olarak değerlendirilmiştir Elde edilen sonuçlara göre doza bağlı AFP’nin kan düzeylerinde sadece CRP konsantrasyonlarında en düşük düzey olan 1,25 ml/kg dozda FCA uygulanan grubun diğerlerinden daha düşük yanıt verdiği; diğer tüm doz gruplarında (2,5 ml/kg, 5 ml/kg, 10 ml/kg) yanıtın benzer olduğu görülmüştür. Diğer AFP konsantrasyonlarında ise doza bağlı kan seviyelerinde herhangi bir değişiklik olmadığı belirlenmiştir. SAA kan konsantrasyonlarında doza ve zamana bağlı olarak düzeyler arasında belirleyici bir fark bulunanmamıştır Çalışılan AFP’lerine ait karaciğer gen ekspresyon düzeylerinin her üç proteinde de arttığı gözlenmiştir. Gen ekspresyonlarında tıpkı kan düzeylerindeki gibi doza bağımlı anlamlı bir değişiklik gözlenmemiştir. Ayrıca karaciğer dokusunda çalışılan genlerin ekspresyonlarının, kan AFP düzeylerinin tam bir yansıması olmadığı da belirlenmiştir. Bunun nedeninin de bu proteinlerin ekstrahepatik dokulardan da sentezi olarak yorumlanmıştır. Farklı şiddetlerde oluşturulan yangıların CRP, Hp ve SAA proteinlerinin kandaki düzeyleri ve karaciğerdeki gen ekspresyonlarının incelendiği bu çalışmanın daha sonra yapılacak çalışmalara referans olabileceği öngörülmektedir. Bundan sonra farklı yangısal uyarıcılar ile oluşturulan inflamasyon modellerindeki karaciğer ve diğer dokuların ekspresyonlarının da inceleneceği çalışmalar yapılması bu konu ile ilgili literatüre katkı sağlayacaktır. tr_TR
dc.description.tableofcontents İÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY SAYFASI i TEŞEKKÜR ii İÇİNDEKİLER iii SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ v ŞEKİLLER DİZİNİ vii TABLOLAR DİZİNİ x ÖZET xi ABSTRACT xiii 1. GİRİŞ 1 2. GENEL BİLGİLER 3 2.1. İnflamasyon 3 2.1.1. İnflamasyonun Başlıca Sebepleri 4 2.1.2. İnflamasyonun Kardinal Belirtileri 5 2.2. Akut İnflamasyon 6 2.3. Kronik İnflamasyon 9 2.4. İnflamasyonun Kimyasal Mekanizmaları 10 2.5. Akut Faz Proteinleri 11 2.5.1. Akut Faz Proteinlerin Sentezi 13 2.5.2. Pozitif Akut Faz Proteinleri 15 2.5.2.1. C reaktif protein (CRP) 15 2.5.2.2. Serum Amiloid A (SAA) 16 2.5.2.3. Haptoglobin (Hp) 17 2.6. PCR ve Real Time PCR 19 2.6.1. Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) 19 2.6.2. Real Time PCR 21 2.6.2.1. Belirleme sistemleri 22 2.6.2.2. Ct değeri ve komperatif Ct hesaplaması metodu 23 2.7. Gen Ekspresyonu 24 3. GEREÇ VE YÖNTEM 27 3.1. Gereç 27 3.1.1. Deney Hayvanı Materyali 27 3.1.2. Çalışmada Kullanılan Kimyasal Maddeler ve Cihazlar 27 3.1.3. Primerler 28 3.2. Yöntem 30 3.2.1. Deney Grupları ve Uygulama Protokolü 30 3.2.2. Serum ve doku örneklerinin hazırlanması 31 3.2.3. Biyokimyasal Analizler 31 3.2.3.1. C reaktif protein (CRP) düzeyinin belirlenmesi 31 3.2.3.2. Serum amiloid A (SAA) düzeyinin belirlenmesi 34 3.2.3.3. Serum haptoglobin düzeyinin belirlenmesi 35 3.2.4. Moleküler Analizler 36 3.2.4.1. Karaciğer dokusundan total RNA izolasyonu 36 3.2.4.2. cDNA sentezi 38 3.2.4.3. Real Time PCR 39 3.2.4.3.1. PCR ürünlerinin agaroz jelde kontrolü 41 3.2.4.4. Serum protein fraksiyonlarının gösterilmesi 41 3.2.4.4.1. Protein tayini- protein kantifikasyonu 41 3.2.4.4.2. Protein presipitasyonu 42 3.2.4.5. SDS PAGE 45 3.3. İstatistiksel Analiz 46 4. BULGULAR 48 4.1. Serum CRP, SAA ve Haptoglobin Düzeyleri 48 4.2. Real Time PCR sonuçları 48 4.2.1. Farklı Dozlarda FCA Uygulanan Gruplarda Saatlere Göre CRP, Hp ve SAA Gen Ekspresyonlarındaki Değişiklikler 48 4.2.2. PCR Ürünlerinin Kontrolü 56 4.3. Serum Proteinleri SDS PAGE Sonuçları 58 5. TARTIŞMA 67 6. SONUÇ VE ÖNERİLER 76 KAYNAKLAR 78 ÖZGEÇMİŞ 94 tr_TR
dc.language.iso tur tr_TR
dc.publisher AYDIN ADNAN MENDERES ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ tr_TR
dc.rights info:eu-repo/semantics/embargoedAccess tr_TR
dc.subject Akut Faz Proteinleri, İnflamasyon, Gen Ekspresyonu, Rat tr_TR
dc.title RATLARDA YANGI ŞİDDETİNİN BAZI AKUT FAZ PROTEİNLERİ VE GEN EKSPRESYONLARINA ETKİSİ tr_TR
dc.type doctoralThesis tr_TR
dc.contributor.department Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Biyokimya (Veteriner) Anabilim Dalı tr_TR


Bu öğenin dosyaları:

Bu öğe aşağıdaki koleksiyon(lar)da görünmektedir.

Basit öğe kaydını göster