SUBKLİNİK MASTİTİSLİ İNEK SÜTLERİNDEN ELDE EDİLEN STAPHYLOCOCCOUS AUREUS İZOLATLARINDA BAZI TOKSİN GENLERİNİN VE ANTİBİYOTİK DİRENÇLİLİĞİNİN İNCELENMESİ

DSpace Ana Sayfası
→
Tez
→
Yüksek Lisans
→
Öğe Göster

dc.contributor.advisor	PROF. DR. SÜHEYLA, TÜRKYILMAZ
dc.contributor.author	ERDEM, SUR
dc.date.accessioned	2019-01-22T13:04:57Z
dc.date.available	2019-01-22T13:04:57Z
dc.date.issued	2019-01-22
dc.date.submitted	2019-01-17
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11607/3519
dc.description.abstract	Bu çalışmada subklinik mastitisli inek sütlerinden elde edilen Staphylococcus aureus izolatlarında önemli toksin genlerinin ve antibiyotik dirençliliğinin incelenmesi amaçlandı. Çalışmanın materyalini 200 subklinik mastitisli sütten elde edilen 31 adet S. aureus izolatı oluşturdu. Bakteri identifikasyonunun doğrulanmasında ve toksin (eksfoliyatif toksin, Panton-Valentine lökosidin, toksik şok sendrom toksin 1) genlerinin belirlenmesinde polimeraz zincir reaksiyonundan (PZR) faydalanıldı. İzolatların dokuz antimikrobiyal aileye ait dokuz antibiyotiğe karşı duyarlılıkları disk difüzyon yöntemi ile incelendi. S. aureus olarak identifiye edilen 31 izolatın toksin genlerinin PZR ile incelenmesi sonucu izolatların %48,38 (15/31)’inin bu toksin genlerinin en az bir tanesinin bulunduğu gösterildi. Toksin geni taşıyan izolatların %73,3 (11/15) ’ünün eksfoliyatif toksin D geni (etd), %33,3 (5/15)’ünün Panton-Valentine lökosidin geni (luk-PV), %26,6 (4/15)’sının toksik şok sendromu toksini 1 geni (tst-1), %13,3 (2/15)’ünün eksfoliyatif toksin A geni (eta) genlerini taşıdığı belirlendi. Toplam 5 toksin gen profili elde edildi. İzolatların tümü penisilin G’ye karşı dirençli olup; 23’ü (%74,1) çoklu antimikrobiyel dirençli idi. Toplam 9 antibiyotik direnç fenotipi saptandı. Sonuç olarak; materyal alınan işletmede mastitisli ineklerin sütlerinden elde edilen S. aureus izolatlarında çoklu antibiyotik dirençli izolatların varlığı işletmede ciddi bir direnç probleminin bulunduğunu ortaya koymuş ve çeşitli toksin genlerine sahip patojenik S. aureus izolatlarının olması bu hayvanlardan elde edilen sütlerin halk sağlığı açısından potansiyel bir tehdit oluşturabileceğini kanaatini doğurmuştur.	tr_TR
dc.description.tableofcontents	KABUL VE ONAY SAYFASI…………………………………………………..….. i TEŞEKKÜR…………………………………………………………………………. ii İÇİNDEKİLER………………………………………………………………………. SİMGELER VE KISALTMALAR………………………………………………… iii vi TABLOLAR DİZİNİ………………………………………………………………... viii ŞEKİLLER DİZİNİ…………………………………………………………………. ix RESİMLER DİZİNİ………………………………………………………………… ÖZET…………………………………………………………………………………. ABSTRACT…………………………………………………………………………... x xi xii 1. GİRİŞ………………………………………………………………………………. 1 1.1. Genel Özellikleri………………………………………………………………….. 2 1.2. Tarihçe…………..………………………………………………………………... 3 1.3. Bakterinin Prevalansı ve Önemi …………………………………………………. 4 1.4. Rezervuarları ve Bulaşması…………………………………………………….… 5 1.5. Sığırların Meme İçi 1.5. Sığırların Meme İçi 1.5. Sığırların Meme İçi 1.5. Sığırların Meme İçi 1.5. Sığırların Meme İçi 1.5. Sığırların Meme İçi 1.5. Sığırların Meme İçi 1.5. Sığırların Meme İçi S. aureus S. aureusS. aureus Enfeksiyonunun Patogenezi……………................ Enfeksiyonunun Patogenezi……………................ Enfeksiyonunun Patogenezi……………................ Enfeksiyonunun Patogenezi……………................ Enfeksiyonunun Patogenezi……………................ Enfeksiyonunun Patogenezi……………................ Enfeksiyonunun Patogenezi……………................ Enfeksiyonunun Patogenezi……………................ Enfeksiyonunun Patogenezi……………................ Enfeksiyonunun Patogenezi……………................ Enfeksiyonunun Patogenezi……………................ Enfeksiyonunun Patogenezi……………................ Enfeksiyonunun Patogenezi……………................ 1.5.1. S. aureus S. aureusS. aureus ’un Meme Bezine Meme Bezine Meme Bezine Meme Bezine Meme Bezine Meme Bezine Meme Bezine Girişi………. …………………………… ………… 1.5.2. S. aureus S. aureusS. aureus ’un Meme Bezine ’un Meme Bezine ’un Meme Bezine ’un Meme Bezine ’un Meme Bezine ’un Meme Bezine ’un Meme Bezine Kolonizasyonu KolonizasyonuKolonizasyonuKolonizasyonuKolonizasyonu ……………………………………. 1.5.3. Meme Bezine 1.5.3. Meme Bezine 1.5.3. Meme Bezine 1.5.3. Meme Bezine Adhezyonu….. Adhezyonu….. Adhezyonu….. Adhezyonu….. Adhezyonu….. …………………………………………………... …………………………………………………... 1.5.3.1. Adhezinlerin rolü……………………………………………………………... 1.5.3.1. Adhezinlerin rolü……………………………………………………………... 1.5.3.1. Adhezinlerin rolü……………………………………………………………... 1.5.3.1. Adhezinlerin rolü……………………………………………………………... 1.5.3.1. Adhezinlerin rolü……………………………………………………………... 1.5.3.1. Adhezinlerin rolü……………………………………………………………... 1.5.3.1. Adhezinlerin rolü……………………………………………………………... 1.5.3.1. Adhezinlerin rolü……………………………………………………………... 1.5.3.2. Antifagositik faktörlerin ekspresyonu……… 1.5.3.2. Antifagositik faktörlerin ekspresyonu……… 1.5.3.2. Antifagositik faktörlerin ekspresyonu……… 1.5.3.2. Antifagositik faktörlerin ekspresyonu……… 1.5.3.2. Antifagositik faktörlerin ekspresyonu……… 1.5.3.2. Antifagositik faktörlerin ekspresyonu……… 1.5.3.2. Antifagositik faktörlerin ekspresyonu……… 1.5.3.2. Antifagositik faktörlerin ekspresyonu……… 1.5.3.2. Antifagositik faktörlerin ekspresyonu……… 1.5.3.2. Antifagositik faktörlerin ekspresyonu……… 1.5.3.2. Antifagositik faktörlerin ekspresyonu……… 1.5.3.2. Antifagositik faktörlerin ekspresyonu……… 1.5.3.2. Antifagositik faktörlerin ekspresyonu……… ………………………………… 1.5.3.3. S. aureus S. aureusS. aureus yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... yüzey bileşenlerinin in vivo ekspresyonunun kuramsal kinetiği…... 1.5.4. Meme Bezinde Oluşan Patolojik Değişiklikler………………………………… 1.5.4. Meme Bezinde Oluşan Patolojik Değişiklikler………………………………… 1.5.4. Meme Bezinde Oluşan Patolojik Değişiklikler………………………………… 1.5.4. Meme Bezinde Oluşan Patolojik Değişiklikler………………………………… 1.5.4. Meme Bezinde Oluşan Patolojik Değişiklikler………………………………… 1.5.4. Meme Bezinde Oluşan Patolojik Değişiklikler………………………………… 1.5.4. Meme Bezinde Oluşan Patolojik Değişiklikler………………………………… 1.5.4. Meme Bezinde Oluşan Patolojik Değişiklikler………………………………… 1.5.4. Meme Bezinde Oluşan Patolojik Değişiklikler………………………………… 1.5.4. Meme Bezinde Oluşan Patolojik Değişiklikler………………………………… 1.5.4. Meme Bezinde Oluşan Patolojik Değişiklikler………………………………… 1.5.4. Meme Bezinde Oluşan Patolojik Değişiklikler………………………………… 1.5.4. Meme Bezinde Oluşan Patolojik Değişiklikler………………………………… 1.5.4.1. Toksinlerin rolü……………………………………………………………….. 1.5.4.1. Toksinlerin rolü……………………………………………………………….. 1.5.4.1. Toksinlerin rolü……………………………………………………………….. 1.5.4.1. Toksinlerin rolü……………………………………………………………….. 1.5.4.1. Toksinlerin rolü……………………………………………………………….. 1.5.4.2. Ekstrasellüler enzimlerin ve 1.5.4.2. Ekstrasellüler enzimlerin ve 1.5.4.2. Ekstrasellüler enzimlerin ve 1.5.4.2. Ekstrasellüler enzimlerin ve 1.5.4.2. Ekstrasellüler enzimlerin ve 1.5.4.2. Ekstrasellüler enzimlerin ve 1.5.4.2. Ekstrasellüler enzimlerin ve 1.5.4.2. Ekstrasellüler enzimlerin ve 1.5.4.2. Ekstrasellüler enzimlerin ve 1.5.4.2. Ekstrasellüler enzimlerin ve koagülazın rolü………………………………… koagülazın rolü………………………………… koagülazın rolü………………………………… koagülazın rolü………………………………… koagülazın rolü………………………………… 1.5.5. S. aureus S. aureusS. aureus ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. ve Sığır İmmun Sistemi Arasındaki Etkileşim……………………….. 6 6 8 9 9 10 13 14 15 16 17 1.6. S. aureus’un Virülens Faktörlerinin Meme İçi Enfeksiyonundaki Rolü………… 1.6.1. Virülens Faktörlerin Kontrolü ve Ekspresyonu………………………………… 1.6.2. Enfeksiyonun Oluşmasında Rol Oynayan Toksinler…………………………… 1.6.2.1. Panton-Valentine lökosidin…………………………………………………... 1.6.2.2. Toksik şok sendrom toksini…………………………………………………... 1.6.2.3. Eksfoliyatif toksin…………………………………………………………….. 17 18 18 19 20 21 iv 1.6.3. Enfeksiyonun Sürdürülmesinde Rol Oynayan Virülens Faktörleri…………….. 22 1.7. Antibiyotik Dirençliliği………………………………………………………….. 1.7.1. S. aureus’un Direnç Geliştirdiği Antibiyotikler………………………………... 1.7.1.1. Penisilin direnci………………………………………………………………. 1.7.1.2. Metisilin direnci………………………………………………………………. 1.7.1.3. Aminoglikozid direnci………………………………………………………... 1.7.1.4. Kinolon direnci……………………………………………………………….. 1.7.1.5. Tetrasiklin direnci…………………………………………………………….. 1.7.1.6. Trimetoprim sülfametoksazol direnci………………………………………… 1.7.1.7. Linezolid direnci……………………………………………………………… 1.7.1.8. Makrolid, linkozamid ve streptogramin direnci……………………………… 1.7.1.9. Vankomisin direnci…………………………………………………………… 24 26 26 26 27 27 28 29 29 30 30 2. GEREÇ VE YÖNTEM…………………………….……………………………... 31 2.1. Gereç………………………………………………………………………….….. 31 2.1.1. İzolasyon Örnekleri…………………………………………………………… İzolasyon Örnekleri…………………………………………………………… İzolasyon Örnekleri…………………………………………………………… İzolasyon Örnekleri…………………………………………………………… İzolasyon Örnekleri…………………………………………………………… İzolasyon Örnekleri…………………………………………………………… İzolasyon Örnekleri…………………………………………………………… İzolasyon Örnekleri…………………………………………………………… İzolasyon Örnekleri…………………………………………………………… .. 31 2.1.2. Standart Suşlar ve Pozitif Kontroller………………………………………..….. 31 2.1.3. Kullanılan Besiyerleri……………………………………………………….….. 2.1.3.1. Mannitol salt agar…………………………………………………………….. 2.1.3.2. Mueller hinton agar…………………………………………………………… 2.1.3.3. Skim milk powder……………………………………………………………. 31 32 32 32 2.1.4. Boyalar ve Ayıraçlar……………………………………………………….…… 2.1.4.1. Gram boyama seti……………………………………………………….……. 2.1.4.2. Katalaz testi…………………………………………………………………... 2.1.4.3. Koagulaz testi………………………………………………………………… 33 33 33 33 2.1.5. Antibiyotik diskleri…………………………………………………………….. 33 2.1.6. Polimeraz Zincir Reaksiyonu…………………………………………………... 2.1.6.1. Solüsyon ve boyalar………………………………………………………….. 2.1.6.1.1. TBE buffer…………………………………………………………………. 2.1.6.1.2. Yükleme tamponu..………………………………………………………… 2.1.6.2. Primerler……………………………………………………………………… 2.1.6.3. Kullanılan cihazlar……………………………………………………………. 2.1.6.4. Agarose jel……………………………………………………………………. 2.1.6.5. Marker………………………………………………………………………… 33 33 33 34 34 35 35 35 v 2.2. Yöntem…………………………………………………………………………… 35 2.2.1. Örneklerin Alınması……………………………………………………………. 35 2.2.2. Stafilokok İzolasyonu……………………………………………………….….. 36 2.2.3. S. aureus’un İdentifikasyonu…………………………………………………… 2.2.3.1. Fenotipik identifikasyon……………………………………………………… 2.2.3.1.1. Biyokimyasal testler………………………………………………………... 2.2.3.1.1.1. Katalaz testi………………………………………………………………. 2.2.3.1.1.2. Lam koagulaz testi………………………………………………………... 2.2.3.2. Genotipik identifikasyon……………………………………………………... 2.2.3.2.1. DNA ekstraksiyonu………………………………………………………… 2.2.3.2.2. PZR…………………………………………………………………………. 36 36 36 36 37 37 37 38 2.2.4. Antibiyotik Duyarlılık Testinin Yapılışı ve Değerlendirilmesi………………… 39 3. BULGULAR………………………………………………………………………. 41 3.1. İzolasyon ve İdentifikasyon……………..………………………………………... 41 3.2. Genotipik İdentifikasyon…………………………………………………………. 41 3.3. Polimeraz Zincir Reaksiyonu…………………....……………………………….. 42 3.4. Antibiyotik Dirençlilik……………………………………………………….…… 45 4. TARTIŞMA…………………….…………………………………………………. 48 5. SONUÇ VE ÖNERİLER……………………………………………….………… 52 KAYNAKLARKAYNAKLARKAYNAKLAR KAYNAKLARKAYNAKLARKAYNAKLARKAYNAKLAR ……………………………… ……………………………… …………………………………… …. 54-75 ÖZGEÇMİŞ ÖZGEÇMİŞ ÖZGEÇMİŞ ÖZGEÇMİŞ ÖZGEÇMİŞ ÖZGEÇMİŞ ……………………………………………………………………… ….. 76	tr_TR
dc.language.iso	tur	tr_TR
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	tr_TR
dc.subject	Subklinik mastitis, Staphylococcus aureus, toksin gen, antibiyogram	tr_TR
dc.title	SUBKLİNİK MASTİTİSLİ İNEK SÜTLERİNDEN ELDE EDİLEN STAPHYLOCOCCOUS AUREUS İZOLATLARINDA BAZI TOKSİN GENLERİNİN VE ANTİBİYOTİK DİRENÇLİLİĞİNİN İNCELENMESİ	tr_TR
dc.type	masterThesis	tr_TR
dc.contributor.department	SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ	tr_TR