Bu çalışma, 2004 (Temmuz ? Kasım) ve 2005 (Eylül) yılları arasında Aydın
İli ve ilçelerinde pamuk yetiştirilen alanlardaki yabancı ot ve pamuk bitkilerinden
endofitik bakteri izole etmek ve izole edilen bu bakterilerin Verticillium Solgunluğu
hastalığına karşı in-vivo ve in-vitro etkinliklerini ve ayrıca bitki gelişimine olan
etkilerini belirlemek amacıyla yapılmıştır. Yapılan izolasyon çalışmaları sonucunda
yabancı ot ve pamuk bitkilerinden toplam 280 adet bakteri izolatı elde edilmiştir.
Yürütülen in?vitro testlerde pamuk bitkilerinden toplam 12 adet antagonist bakteri
izolatı elde edilirken yabancı otlardan endofitik bakteri izole edilememiştir. Ayrıca
hastalık belirtilerinin görüldüğü yabancı ot ve pamuk bitkilerinden yapılan izolasyon
çalışmaları sonucunda 1 adet yabancı ot ve 7 adet pamuk bitkisinden olmak üzere
toplam 8 adet Verticillium spp. izolatı elde edilmiş ve pamık bitkisinde yapılan
patojenisite çalışmaları sonucunda bu izolatların Verticillium dahliae olduğu
belirlenmiştir. Pamuk bitkisinden izole edilen in vitro'da ön eleme testinde etkili
bulunan ve bitki patojeni olmadığı tütün testi ile tespit edilen 12 adet endofitik
bakteri izolatından in- vitro'da Verticillium dahliae' nın gelişimine karşı en yüksek
etki F2 (% 66,8), F5 (% 61,8) ve B8 (% 48,7) izolatlarında saptanmıştır. In-vivo
koşullarda ise antagonist bakterilerin V. dahliae'a karşı hastalık şiddeti
değerlendirmelerinde E21, C5 ve F5 izolatları etkili bulunmuştur. In-vivo testlerde
etkili bulunan antagonist bakterilerden E21 ve F5 izolatlarından rifampicine
dayanıklı mutant ırk elde edilebilmiş ve pamuk fidelerindeki dağılımı incelendiğinde
bu ırkların köklerde içsel olarak kolonize olabildiği belirlenmiştir. Mutant antagonist
bakteri izolatlarının V. dahliae'a karşı etkinliklerinde normal izolatlarla
kıyaslandığında yüzde hastalık şiddetleri açısından istatistiki olarak fark olmadığı ve
hastalığı kontrol altına alabildiği görülmüştür. Ayrıca izole edilen endofitik
bakterilerin doğrudan fungus gelişimine etkilerini incelemek amacıyla bölmesiz
petride en yüksek engelleme F5 (%31,43), F2 (% 31,43) ve C5 (% 11,43)
izolatlarında kaydedilirken bölmeli petride uçucu bileşiklerin gelişmeyi teşvik
etkilerine yönelik en yüksek etki ise E22 (% 20,75), I3 (% 11,32) ve E21 (% 9,43)
izolatlarında bulunmuştur. 12 adet Antagonist bakteriden E22, E21, B5, F8, I3 ve H9
izolatlarının fosfat çözebilme yeteneğine sahip olduğu belirlenmiştir. Yapılan gram
boyama ve biyokimyasal testler sonucunda 2 endofitik bakterinin gram pozitif ve
Bacillus cinsine ait olduğu 8 adedinin ise fluoresan Pseudomonas cinsine ait olduğu
saptanmıştır.
In 2004-2005 growing season, the study was carried out in cotton growing
areas of Aydin province and towns with the aim of isolating endophytic bacteria
from cotton and weed plants and using the bacteria in-vitro and in-vivo activity
against Verticillium wilt and growth promotion of cotton radicle. Eight fungal
isolates (7 from cotton plants and 1 Amaranthus sp.) were collected from cotton
growing fields in Aydin and identified as Verticillium dahliae according to the
morphological characteristics and pathogenicity tests. Twelve bacterial strains out of
280 isolates were isolated from weeds and cotton plants showed in-vitro antagonistic
effect against V. dahliae. None of the twelve-endophytic bacterial strains reacted as
non-pathogenic in tobacco hypersensitivity test. The most effective isolates against
V. dahliae were and F2 (% 66,8), F5 (% 61,8) and B8 (% 48,7) in -vitro tests while
the isolates E21, C5 and F5 were significantly reduced Verticillium wilt symptoms
in vivo tests. The rifampicin resistant strains of E21, C5 and F5 were also tested for
colonization in cotton seedlings and disease reduction ability comparing non-mutant
ones. Endophytic strains were further evaluated for the inhibition capacity of
mycelial growth of V. dahliae and growth promotion effect of cotton seedlings by
means of volatile compounds in divided plastic petri dishes. The volatile compounds
of F5 (% 31,43), F2 (% 31,43) and C5 (% 11,43) significantly inhibited mycelial
growth of V. dahliae and E22 (% 20,75), I3 (% 11,32) and E21 (% 9,43)
significantly induced radicle growth of cotton. The antagonistic strains were
determined for the ability of phosphate solubilization and E22, E21, B5, F8, I3 and
H9 were found to solubilize phosphate in-vitro. Two endophytic strains were
identified as Bacillus sp. and eight was fluorescent Pseudomonas according to gram
staining and biochemical tests.
