SIĞIR MASTİTİSLERİYLE İLİŞKİLİ AEROCOCCUS VIRIDANS TÜRÜNÜN MOLEKÜLER İDENTİFİKASYONU VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ

DSpace Ana Sayfası
→
Tez
→
Yüksek Lisans
→
Öğe Göster

dc.contributor.advisor	Kırkan, Şükrü
dc.contributor.author	Oklay, Mehmet Ali
dc.date.accessioned	2018-09-20T07:00:44Z
dc.date.available	2018-09-20T07:00:44Z
dc.date.issued	2018-09-20
dc.date.submitted	2018-09-11
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11607/3403
dc.description.abstract	SIĞIR MASTİTİSLERİYLE İLİŞKİLİ AEROCOCCUS VIRIDANS TÜRÜNÜN MOLEKÜLER İDENTİFİKASYONU VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ Oklay MA. Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Yüksek Lisans Tezi, Aydın, 2018. Aerococcus türleri çevrede saprofitik olarak bulunabildiği gibi birçok insan ve hayvan infeksiyonlarından da izole edilmiştir. Sığırlarda klinik ve subklinik mastitis vakalarında da tespit edildiği bildirilmiştir. Streptococcus ve Staphylococcus türleri ile olan benzerliği bilinmekte ve bu nedenle hatalı teşhislere neden olabilmektedir. Araştırmamız için Aydın ilindeki çiftliklerden klinik mastitis tespit edilmiş 100 inekten süt numunesi toplanmıştır. Numuneler soğuk zincirle Adnan Menderes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalına getirilmiştir. 16S rRNA geninin dizilimine yönelik genotipik identifikasyon ve otomatize ileri identifikasyon sistemi olan MALDI-TOF MS ile birlikte, klinik ve subklinik mastitisli sığırlardan 15 adet (%15) Aerococcus viridans identifikasyonu yapılmıştır. Ayrıca Minimal İnhibitör Konsantrasyon (MİK) belirleme yöntemine dayalı olarak yapılan antibiyotik duyarlılık testlerinde izolatların Siprofloksasin, Tigesiklin ve Trimetoprim-Sulfometoksazol’e % 100, Vankomisin’e %87, Eritromisin’e % 80, Tetrasiklin’e % 67, Penisilin ve Linezolide % 53.3 oranlarında duyarlı; Nitrofurantoin’e %93 ve Teikoplanin’e % 53.3 oranlarında dirençli olduğu saptanmıştır. Elde edilen bölgesel verilerin, ileride yapılacak araştırmalarda A. viridans etkeninin sığırlarda mastitis hastalığındaki rolünün aydınlatılması açısından ışık tutması umulmaktadır.	tr_TR
dc.description.tableofcontents	İÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY i TEŞEKKÜR ii İÇİNDEKİLER iii RESİMLER DİZİNİ v TABLOLAR DİZİNİ vi ÖZET vii ABSTRACT viii 1. GİRİŞ 1 2. GENEL BİLGİLER 3 2.1. Aerococcus Türleri 3 2.2. Aerococcus Türlerinin Biyokimyasal Özellikleri 4 2.3. Aerococcus Türlerinin Virulans Mekanizması 6 2.4. Aerococcus Türlerinin İzolasyon ve İdentifikasyonları 7 2.5. Klinik ve Subklinik Mastitis Vakalarında Aerococcus Türleri 9 2.6. Aerococcus Türlerinde Antibiyotik Direnci 11 3. GEREÇ ve YÖNTEM 14 3.1. Gereç 14 3.1.1. Besiyerleri ve Ayıraçlar 14 3.1.1.1. Besiyerleri 14 3.1.1.1.1. Blood Agar (Merck 1. 10886) 14 3.1.1.1.2. Mueller-Hinton Agar (MHA) (Oxoid CM 129) 15 3.1.1.1.3. Brain Heart Infusion Broth (BHIB) (% 20 Gliserinli) (Oxoid CM 0225) 15 3.1.1.1.4. Trypton Soya Broth (TSB) (Oxoid CM 129) 15 3.1.2. Kaliforniya Mastitis Test Ayracı (Immucell®) 15 3.1.3. Primerler 16 3.2. Yöntem 16 3.2.1. Örneklerin Alınması 16 3.2.2. Aerococcus sp. İzolasyonu 17 3.2.3. Aerococcus sp. Mikroskopisi 17 3.2.4. Aerococcus sp. Konvansiyonel İdentifikasyonu 17 3.2.4.1. Katalaz Testi 17 3.2.5. Aerococcus sp. VITEK MS (MALDI-TOF MS) ile İdentifikasyon 18 3.2.6. Aerococcus İzolatlarının Genotipik İdentifikasyonu 19 3.2.6.1. DNA Ekstraksiyonu 19 3.2.6.2. PCR 19 3.2.6.2.1. Aerococcus sp 16S rRNA PCR Aşaması 19 3.2.6.2.2. Aerococcus viridans tür spesifik PCR Aşaması 20 3.2.6.3. PCR Ürün Jel Elektroforezi 21 3.3. Antibiyogram 22 4. BULGULAR 23 4.1. Konvansiyonel Yöntemler ile Aerococcus sp. İzolasyon Bulguları 23 4.2. VITEK MS (MALDI-TOF MS) ile Aerococcus viridans İdentifikasyon Bulguları 23 4.3. Aerococcus sp. 16S rRNA ve Tür Spesifik PCR ile Genotipik İdentifikasyon Bulguları 24 4.4. Antibiyogram Bulguları 27 5. TARTIŞMA 30 6. SONUÇ ve ÖNERİLER 34 KAYNAKLAR 35 ÖZGEÇMİŞ 41	tr_TR
dc.language.iso	tur	tr_TR
dc.rights	info:eu-repo/semantics/closedAccess	tr_TR
dc.subject	Sığır, Aerococcus viridans, 16S rRNA, Mastitis, İdentifikasyon	tr_TR
dc.title	SIĞIR MASTİTİSLERİYLE İLİŞKİLİ AEROCOCCUS VIRIDANS TÜRÜNÜN MOLEKÜLER İDENTİFİKASYONU VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ	tr_TR
dc.title.alternative	MOLECULAR IDENTIFICATION OF AEROCOCCUS VIRIDANS ASSOCIATED WITH BOVINE MASTITIS AND DETERMINATION OF ANTIBIOTIC SUSCEPTIBILITIES	tr_TR
dc.type	masterThesis	tr_TR
dc.contributor.authorID	10212558	tr_TR
dc.contributor.department	Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü	tr_TR