| dc.contributor.advisor |
PARIN, UĞUR, DR. ÖĞR. ÜYESİ |
|
| dc.contributor.author |
FATMA ÖZGE, ÖZDEMİR |
|
| dc.date.accessioned |
2018-05-04T06:33:16Z |
|
| dc.date.available |
2018-05-04T06:33:16Z |
|
| dc.date.issued |
2018-04-19 |
|
| dc.date.submitted |
2018-04-05 |
|
| dc.identifier.citation |
SUBKLİNİK MASTİTİSLİ SIĞIRLARDAN MAJOR PATOJENLERİN İZOLASYONU VE ANTİBİYOTİKLERE DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ
Özdemir F.Ö. Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Yüksek Lisans Tezi, Aydın, 2018. |
tr_TR |
| dc.identifier.uri |
http://hdl.handle.net/11607/3289 |
|
| dc.description.abstract |
Sığır mastitislerine sebep olan bakteriyel etkenler orijin ve bulaşma yolları yönünden iki gruba ayrılmaktadır. Bunlardan birincisi olan başlıca bulaşıcı etkenler, S. aureus ve Streptococcus sp. ve E. coli gibi türleri kapsamaktadır. Bu etkenler çok yaygın olarak görülerek, özellikle eller ve süt sağma üniteleri ile yayılmaktadır. Araştırmamızda, süt üretimi için oldukça önem taşıyan subklinik mastitis olgularındaki sık rastlanan S. aureus, Streptococcus sp. ve E. coli etkenlerinin izolasyonu antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi hedeflenmiştir. Çalışmamız için Aydın ilinde bulunan ve subklinik mastitis problemi gösteren 138 adet hayvandan aseptik ve tekniğine uygun olarak süt numunesi alınmıştır. Araştırmamızda ise İncelenen 552 süt örneğinden 102 (% 18.5) adet S. aureus, 21 (%3.8) adet Streptococcus sp., ve 15 (% 2.7) adet E. coli izolasyonu gerçekleştirilmiştir. Genotipik identifikasyonda spesifik primerlerle gerçekleştirilen PCR sonrasında tüm izolatlar moleküler olarak S. aureus, Streptococcus sp. ve E. coli açısından doğrulanmıştır. Elde edilen S. aureus, Streptococcus sp. ve E. coli izolatları amoksisilin-klavulanik asit, oksitetrasiklin, sefoperazon ve sefaleksin-kanamisin antibiyotiklerine duyarlı olarak saptanmıştır. |
tr_TR |
| dc.description.tableofcontents |
KABUL VE ONAY SAYFASI i
TEŞEKKÜR ii
İÇİNDEKİLER iii
SİMGELER ve KISALTMALAR DİZİNİ v
TABLOLAR DİZİNİ vi
RESİMLER DİZİNİ vii
ÖZET viii
ABSTRACT ix
1. GİRİŞ 1
2. GENEL BİLGİLER 3
2.1. Mastitis Hastalığının Tanımı 3
2.1.1. Mastitisin Hastalığının Ekonomik Önemi 4
2.2. Mastitis Hastalığının Semptomları 5
2.2.1.Klinik Mastitisler 5
2.2.2. Subklinik Mastitisler 6
2.3. Mastitis Hastalığındaki Türlerin Laboratuvar Tanısı 7
2.3.1.Çevresel Mikroorganizmalar 8
2.3.1.1. Gram Negatif Çevresel Mikroorganizmalar 9
2.3.1.1.1. Escherichia coli İnfeksiyonları 9
2.3.1.2. Gram Pozitif Çevresel Mikroorganizmalar 10
2.3.1.2.1. Streptococcus Türleri 10
2.3.1.2.2. Staphylococcus Türleri 12
2.3.2.Bulaşıcı Mikroorganizmalar 13
2.3.3.Fırsatçı Mikroorganizmalar 14
2.3.4. Diğer Mikroorganizmalar 14
2.4. Mastitis Hastalığında Kullanılan Antibiyotikler 15
2.5. Antibiyotikler ve Etki Mekanizmaları 15
2.5.1. Bakteri Hücre Duvarı Sentezini İnhibe Eden Antibiyotikler 17
2.5.2. Sitoplazma Membran Permeabilitesini Bozan Antibiyotikler 18
2.5.3. Ribozomlarla Protein Sentezini Bozan Antibiyotikler 18
2.5.4. Nükleik Asit Sentezini İnhibe Eden Antibiyotikler 19
2.6. Antibiyotik Direnci 19
3. GEREÇ ve YÖNTEM 21
3.1. Gereç 21
3.1.1. İzolasyon Örnekleri 21
3.1.2. Standart Suşlar ve Pozitif Kontroller 21
3.1.3. Besiyerleri 21
3.1.3.1. Kanlı Agar (Merck 1.10886) 22
3.1.3.2. MacConkey Agar (Merck 1.05465) 22
3.1.3.3. Eosin Methylene Blue Agar (Merck 1.01347) 22
3.1.3.4. Mueller-Hinton Agar (Merck 1.05437) 22
3.1.3.5. Brain Hearth Infusion Broth (Oxoid-CM1135) (% 20 gliserinli) 22
3.1.3.6. Trypton Soya Agar (TSA) (Merck 105458) 23
3.1.3.7. Trypton Soya Broth (TSB) (Merck 105459) 23
3.1.3.8. Nutrient Broth (Merck 1.05443) 23
3.1.3.9. MR-VP Medium (Oxoid CM 43) 23
3.1.3.10. Simmons Sitrat Besiyeri (SRL-SM 017) 23
3.1.3.11. DNAse Test Agar (Merck 1.10449) 23
3.1 4. Ayıraç ve Boyalar 24
3.1.4.1. Oksidaz Ayıracı (Oxoid, BR 64) 24
3.1.4.2. Kovaks indol Ayıracı (Merck 109293) 24
3.1.4.3. Methyl red Ayıracı (MR) 24
3.1.4.4. Voges proskauer Ayıracı (VP) 24
3.1.4.5. Gram Boyama Seti (Merck-111885) 25
3.1.4.6. Kaliforniya Mastitis Test Ayracı (Immucell®) 25
3.1.5. Solusyonlar 25
3.1.5.1. TAE Elektroforez Buffer 25
3.1.5.2. Gel Loading Buffer (6 X) 25
3.1.6. Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) 26
3.1.6.1. Kullanılan Cihazlar 26
3.1.6.2. MgCl2, Taq DNA Polymerase, 10X Taq Buffer, dNTP Set 26
3.1.6.3. Primerler 26
3.1.6.4. Elektroforez Cihazı 27
3.1.6.5. Agarose Jel Hazırlanışı 27
3.1.6.6. Etidyum Bromür 27
3. 1. 7. Antibiyotik Diskleri 27
3.2. Yöntem 28
3. 2. 1. Örneklerin Alınması 28
3.2.2. S. aureus ve Streptococcus sp. İzolasyonu 28
3.2.2.1. S. aureus ve Streptococcus Türlerinin Tespiti İçin Gram Boyama 28
3.2.2.2. S. aureus ve Streptococcus Türlerinin Katalaz Testi ile Ayrımı 29
3.2.2.3. Biyokimyasal Testler 29
3. 2. 3. E. coli İzolasyonu 30
3.2.3.1. E. coli Tespiti İçin Gram Boyama 30
3.2.3.2. Biyokimyasal Testler 30
3.2.4. Genotipik İdentifikasyon 32
3.2.4.1. DNA İzolasyonu 32
3.2.4.2. PCR 32
3.2.5. Antibiyotik Duyarlılık Testi 34
4. BULGULAR 35
4.1. İzolasyon ve İdentifikasyon Bulguları 35
4.1.2. Genotipik İdentifikasyon Bulguları 38
4.2. Antibiyogram Bulguları 38
5. TARTIŞMA 41
6. SONUÇ ve ÖNERİLER 47
KAYNAKLAR 48
ÖZGEÇMİŞ 53 |
tr_TR |
| dc.language.iso |
tur |
tr_TR |
| dc.publisher |
ADNAN MENDERES ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ |
tr_TR |
| dc.rights |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
tr_TR |
| dc.subject |
Subklinik mastitis, S. aureus, Streptococcus sp., E. coli, PCR, antibiyogram |
tr_TR |
| dc.title |
SUBKLİNİK MASTİTİSLİ SIĞIRLARDAN MAJOR PATOJENLERİN İZOLASYONU VE ANTİBİYOTİKLERE DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ |
tr_TR |
| dc.title.alternative |
ISOLATION OF MAJOR PATHOGENS FROM CATTLE WITH SUBCLINICAL MASTITIS AND DETERMINATION OF ANTIBIOTIC SUSCEPTIBILITIES |
tr_TR |
| dc.type |
masterThesis |
tr_TR |
| dc.contributor.authorID |
10188414 |
tr_TR |
| dc.contributor.department |
ADNAN MENDERES ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ |
tr_TR |