SALMONELLA SEROTİPLERİNDE BİYOFİLM VE VİRULENS İLİŞKİSİNİN  ARAŞTIRILMASI

DSpace Ana Sayfası
→
Tez
→
Doktora
→
Öğe Göster

dc.contributor.advisor	SAVAŞAN, SERAP, DOÇ. DR.
dc.contributor.author	DOYURAN, EYÜP SALİH
dc.date.accessioned	2018-02-19T13:06:51Z
dc.date.available	2018-02-19T13:06:51Z
dc.date.issued	2018-02-19
dc.date.submitted	2018-01-26
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11607/3276
dc.description.abstract	Araştırmamızda Salmonella serotiplerinde biyofilm ve virulens genlerinin ilişkisi incelenmiştir. Salmonella serotiplerindeki biyofilm ile ilgili bapA, sdiA, invA, agfD ve adrA gen varlıkları PCR yöntemi ile incelendi. Araştırma için farklı kaynaklardan izole edilmiş olan 44 adet Salmonella izolatının 10’u Salmonella Typhimurium, 10’u Salmonella Enteritidis ve 24’ü Salmonella İnfantis’tir. İncelenen 44 serotipin, 38’ inde (% 86.36) bapA geni, 26 sında ( % 59) sdiA geni,44 ünde yani tamamında (% 100) oranında invA geni, 39 unda (%88.64) agfD geni ve 35 inde (%79.55) oranında adrA geni tespit edilmiştir. İncelenen çeşitli virulens genlerinin özelliklerin saptanmasında fenotipik yöntem ile PCR tekniği uyumluluk göstermesine karşın, bazı özelliklerde PCR tekniği ile saptanan sonuçların fenotipik sonuçlara kıyasla yüksek bulunması moleküler çalışmaların çok sayıda gen ile ilişkili bir özelliğin ayrıntılı olarak incelenmesinde yarar sağladığını ve her iki yöntemin bir arada kullanılmasının daha güvenilir bir sonuç elde etmede önemli olduğunu ortaya koydu. Bu çalışma ile; Salmonella’nın insanlar için patojen olduğu ve dünyada letal etkili bir çok salgına yol açtığı göz önüne alınırsa gıda üretim yerlerinde, hammaddeden son ürüne kadar genel hijyenik kuralların uygulanmasının ve kros kontaminasyonu engelleyici önlemlerin alınmasının gerekliliği ortaya konulmuştur.	tr_TR
dc.description.tableofcontents	KABUL ONAY i TEŞEKKÜR ii İÇİNDEKİLER iii SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ vi ŞEKİLLER DİZİNİ vii RESİMLER DİZİNİ viii TABLOLAR DİZİNİ ix ÖZET x ABSTRACT xi 1.GİRİŞ 1 2.GENEL BİLGİLER 3 2.1.Tarihçe, Sınıflandırma ve İsimlendirme 3 2.2.Taksonomi 4 2.3.Morfoloji, Kültür ve Biyokimyasal Özellikler 7 2.4.Antijen Yapısı 10 2.4.1..Somatik (O)-Hücre Duvar Antijeni 10 2.4.2.O-Antijen Değişimleri 11 2.4.3.Lizojenik Konversiyon 11 2.4.4.Plazmid Konversiyon 11 2.4.5.Hareket (H) Antijenleri 12 2.4.6.Trifazik suşlar 12 2.4.7.Vİ Antijeni 12 2.4.8.Fimbrial Antijenler 13 2.5.Serotiplendirme 13 2.5.1.Salmonella Antijenleri 13 2.5.2.Serotiplendirmede Rutin Algoritm 14 2.5.3.Epidemiyolojik Açıdan Önemli Salmonella Serotipleri 14 2.5.4.Faj Tiplendirme ve Profajlar 15 2.5.5.Serotiplere Göre Moleküler Tiplendirme Metodları 16 2.6. Salmonella Virulens Faktörleri 17 2.6.1.Salmonella Virulens Plazmidleri 19 2.6.2. Salmonella Patojenite Adaları 19 2.6.2.1. Salmonella Patojenite Adası-1 (SPA-1) 20 2.6.2.2. Salmonella Patojenite Adası-2 (SPA-2) 22 2.6.2.3. Salmonella Patojenite Adası-3 (SPA-3) 23 2.6.2.4. Salmonella Patojenite Adası-4 (SPA-4) 24 2.6.2.5. Salmonella Patojenite Adası-5 (SPA-5) 24 2.6.2.6. Salmonella Patojenite Adası-6 (SPA-6) 25 2.6.2.7. Salmonella Patojenite Adası-7 (SPA-7) 25 2.6.2.8. Salmonella Patojenite Adası-8 (SPA-8) 25 2.6.2.9. Salmonella Patojenite Adası-9 (SPA-9) 25 2.6.2.10. Salmonella Patojenite Adası-10 (SPA-10) 26 2.6.2.11. Salmonella Genomik Adası-1 (Salmonella Genomic Island;SGI-1) 26 2.6.2.12.Yüksek Patojenite Adası (High Pathogenicity Island; HPI) 26 2.6.3.Tip III Sekresyon Sistemi (TTSS) 28 2.6.4.Enfeksiyonun Hücre İçi Dönemi 28 2.6.5.Barsaktan Yayılım ve Sistemik Enfeksiyon 28 2.6.7.Doğal ve Kazanılmış Bağışıklıktan Kaçış 29 2.7. Salmonella Biyofilmleri 30 2.7.1.Biyofilm İçerisindeki Hayat Döngüsü 37 2.7.1.1.Tutunma ve Kolonizasyon 37 2.7.1.2.Büyüme ve Gelişme 38 2.7.1.3.Hareket 39 2.7.1.4.Ayrılma ve Eksternal Kolonizasyon 39 2.7.2.Biyofilmlerin Avantajları 40 2.7.3.Salmonella’larda Biyofilm Oluşumu 41 2.7.4.Salmonella’ların Biyofilm Oluşturmasında Etkili Hücresel Elemanları (Yüzey Eklentileri) 50 2.7.4.1.Flagella 50 2.7.4.2.Fimbria 50 2.7.5.Biyofilm Oluşumunu Etkileyen Çevresel Faktörler 51 2.7.6.Hücreden Hücreye İletişim 52 2.8.Patogenez ve Virülans Mekanizmaları 53 3.GEREÇ VE YÖNTEM 54 3.1.Metot 54 3.1.2. İdentifikasyon 54 3.1.3. Biyofilm Üretiminin Fenotipik Olarak Belirlenmesi 54 3.1.4.Salmonella serotiplerindeki biyofilm ile ilgili sdiA, , bapA, agfD, adrA ve invA gen varlıklarının PCR ile incelenmesi 54 4. BULGULAR 55 4.1. Bakteri İzolatları 58 4.2. İdentifikasyon Bulguları 58 4.3.PCR Bulguları 58 5.TARTIŞMA 58 6.SONUÇ 67 KAYNAKLAR 73 ÖZGEÇMİŞ 81	tr_TR
dc.language.iso	tur	tr_TR
dc.rights	info:eu-repo/semantics/closedAccess	tr_TR
dc.subject	Salmonella, Biyofilm, Virulens, PCR	tr_TR
dc.title	SALMONELLA SEROTİPLERİNDE BİYOFİLM VE VİRULENS İLİŞKİSİNİN ARAŞTIRILMASI	tr_TR
dc.title.alternative	INVESTIGATION OF BIOFILM AND VIRULENCE AFFECT ON SALMONELLA SEROTYPES	tr_TR
dc.type	doctoralThesis	tr_TR
dc.contributor.authorID	10182013	tr_TR
dc.contributor.department	ADNAN MENDERES ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ	tr_TR