Please use this identifier to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/11607/5480Full metadata record
| DC Field | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.advisor | ERBAŞ, Prof. Dr. Göksel | - |
| dc.contributor.author | YAĞIZ, Aydın | - |
| dc.date.accessioned | 2026-06-24T10:21:13Z | - |
| dc.date.available | 2026-06-24T10:21:13Z | - |
| dc.date.issued | 2026-06-24 | - |
| dc.date.submitted | 2026-06-15 | - |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11607/5480 | - |
| dc.description.abstract | Amaç: Bu çalışmada, Ege Bölgesi'nde yetiştirilen koyun ve keçilerde görülen abort vakalarında Campylobacter spp., Chlamydia abortus ve Coxiella burnetii'nin moleküler yöntemler ile prevalansının araştırılması ve bölgeye özgü epidemiyolojik profilin ortaya konması amaçlandı. Gereç ve Yöntem: 2018–2020 yılları arasında Bornova Veteriner Kontrol Enstitüsü'ne Ege Bölgesi'nin 7 ilinden (İzmir, Aydın, Denizli, Muğla, Manisa, Kütahya ve Uşak) gönderilen 102 işletmeye ait toplam 140 aborte fetüs örneği çalışma materyalini oluşturdu. Örneklerden High Pure PCR Template Preparation Kit (Roche) ile DNA ekstraksiyonu gerçekleştirildi. C. abortus için ompA, C. burnetii için IS1111 ve Campylobacter spp. için 16S rRNA gen bölgelerini hedefleyen TaqMan prob tabanlı Real-Time PCR analizleri LightCycler 480 (Roche) cihazında yapıldı. Bulgular: İncelenen 140 numunenin 33'ünde (%23,6) en az bir etkene ait Real-Time PCR pozitifliği saptandı. Etken bazında değerlendirildiğinde C. abortus 24 örnekte (%17,1) ile en sık tespit edilen etken oldu; bunu C. burnetii 6 örnek (%4,3) ve Campylobacter spp. 3 örnek (%2,1) izledi. Hiçbir örnekte ko-enfeksiyon saptanmadı. Tür, yıl ve mevsim bazında pozitiflik oranları arasında istatistiksel olarak anlamlı fark bulunamamıştır (p>0,05). Sonuç: Chlamydia abortus, Ege Bölgesi küçükbaş hayvan sürülerinde en yaygın enfeksiyöz abort etkeni olarak belirlendi. Araştırılan üç patojenin tümünün zoonoz karakter taşıması nedeniyle One Health yaklaşımı çerçevesinde entegre sürveyans ve koruyucu önlemlerin uygulanmasının büyük önem taşıdığı sonucuna varıldı. | tr_TR |
| dc.description.tableofcontents | KABUL VE ONAY …………...………………………..…………….…….……… i TEŞEKKÜR ……………………………………………………………...………… ii İÇİNDEKİLER ..…………………………………………….………...…..…….…. iii SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ …..…………………….…………….. vii RESİMLER DİZİNİ ….………….…………………………...………………..…… ix TABLOLAR DİZİNİ ….………….…………………………...…………………… x ÖZET ……………………………………………………………………………..… xii ABSTRACT ………………………………………………………………….…….. xiii 1. GİRİŞ …………………….…………………...……………………….….…..….. 1 2. GENEL BİLGİLER ……………………..…………………………………....….. 3 2.1. Küçükbaş Hayvanlarda Abort ………………………………….……………… 3 2.1.1. Abort Nedenleri ve Ekonomik Önemi….….…….…………………………… 3 2.1.2. Enfeksiyöz Abort Etkenleri ….….…….…………………………………… 5 2.2. Campylobacter spp.…………...……….………………………………….…..... 8 2.2.1. Etiyoloji ve Sınıflandırma..............….………….....…………………….…… 8 2.2.2. Epidemiyoloji …………………………….…………...................................... 11 2.2.3. Patogenezis ve Klinik Bulgular ..…………………………………..………… 13 2.2.4. Teşhis Yöntemleri ……………..…………………………………..………… 14 2.3. Chlamydia abortus..…………...……….………………………………….….... 16 2.3.1. Etiyoloji ve Sınıflandırma..............….………….....…………………….…… 16 2.3.2. Epidemiyoloji …………………………….…………...................................... 18 2.3.3. Patogenezis ve Klinik Bulgular ..…………………………………..………… 20 2.3.4. Teşhis Yöntemleri ……………..…………………………………..………… 23 2.4. Coxiella burnetii .....…………...……….………………………………….….... 25 2.4.1. Etiyoloji ve Sınıflandırma..............….………….....…………………….…… 25 2.4.2. Epidemiyoloji …………………………….…………...................................... 28 2.4.3. Patogenezis ve Klinik Bulgular ..…………………………………..………… 29 2.4.4. Teşhis Yöntemleri ……………..…………………………………..………… 31 2.5. Moleküler Teşhis Yöntemleri..……….………………………………….…....... 34 2.5.1. Real-Time PCR'ın Temel Prensipleri …………..……………………………. 34 2.5.2. Real-Time PCR'ın Abort Teşhisindeki Yeri …..…………………………… 36 3. GEREÇ VE YÖNTEM ……...…………………………………….…..………… 39 3.1. Gereçler ……………………………………………………….....…...………... 39 3.1.1. Çalışma Materyali …………………………………………..….........….…… 39 3.1.2. Kullanılan Kimyasallar, Solusyonlar, Ayıraçlar .……………..…..….……… 42 3.1.2.1. DNA Ekstraksiyon Kiti…………………………………………………….. 42 3.1.2.2. Real-Time PCR analizinde kullanılan primer ve problar …….……………. 43 3.1.2.3. FastStart Essential DNA Probes Master ……………….…….…………….. 44 3.1.2.4. Pozitif Kontroller ……………………………………...…….……………... 44 3.1.3. Kullanılan Cihazlar …………..…………..……………………….………….. 44 3.1.3.1. Hassas Terazi……………………………………………………………...... 44 3.1.3.2. Santrifüj …...……………………………………………………………...... 44 3.1.3.3. Kuru Blok Isıtıcı Cihazı ………………………………..…….……………. 45 3.1.3.4. Real Time PCR Cihazı …………………………...…….…………….......... 45 3.2. Yöntem ………………………………………………………………………… 45 3.2.1. Örnekleme ……………………..…………………………………………….. 45 3.2.2. Örneklerin DNA ekstraksiyonu için hazırlanması..…………...………........... 45 3.2.3. DNA Ekstraksiyonu ………………………………...….……………………. 46 3.2.4. Chlamydia abortus’un Real-Time PCR ile Tespiti ……..……………………. 47 3.2.5. Coxiella burnetii’nin Real-Time PCR ile Tespiti ……..…………………… 48 3.2.6. Campylobacter spp.’nin Real-Time PCR ile Tespiti ..……………………….. 49 4. BULGULAR ………………………………………………………………….…. 50 4.1. Numune Dağılımı …..……………….………………………………….……… 50 4.2. Real-Time PCR Sonuçları ……………………………………………….….…. 53 4.2.1. Chlamydia abortus Bulguları ……………………………….….……………. 54 4.2.2. Coxiella burnetii Bulguları ……………………………….….……………..... 55 4.2.3. Campylobacter spp. Bulguları ……………………….….……………............ 56 4.3. Ko-enfeksiyon Analizi ...…………………………………….……...…………. 56 4.4. İl Bazında Dağılım …………………………………………….…….………… 57 4.5. Tür Bazında Dağılım ……………………………………….…….……………. 57 4.6. Yıl Bazında Dağılım ……………………………………….…….…………….. 58 4.7. Mevsimsel Dağılım ……………………………………….…….…………….. 58 4.8. İşletme Bazında Analiz …………………………………….…….……………. 59 4.8.1. İşletme Numune Dağılımı …………………………….…….……………….. 59 4.8.2. İşletme Düzeyinde Real-Time PCR Pozitifliği ……………….…….……… 60 4.8.3. Numune Sayısı ve Real-Time PCR Sonuçlarının İşletme Bazında Birleşik Analizi……………………………………………………………………………..... 60 4.8.4. İl Bazında İşletme Dağılımı.............................................................................. 61 4.9. İstatistiksel Değerlendirme................................................................................... 62 4.9.1. Genel Prevalans ve %95 Güven Aralıkları........................................................ 62 4.9.2. Tür Bazında Karşılaştırma ............................................................................... 62 4.9.3. Yıl Bazında Karşılaştırma ................................................................................ 63 4.9.4. İl Bazında Karşılaştırma.................................................................................... 64 4.9.5. Mevsimsel Dağılımın İstatistiksel Değerlendirmesi......................................... 65 4.9.6. Genel Değerlendirme........................................................................................ 66 5. TARTIŞMA …………...……….…………………...……...….……………....…. 67 6. SONUÇ VE ÖNERİLER ……………………………..…………..………….….. 75 KAYNAKLAR ..………………………………...……...……………………….….. 77 BİLİMSEL ETİK BEYANI ……………………………………………………… 95 ÖZ GEÇMİŞ …………………………………………...…………………………… 96 | tr_TR |
| dc.language.iso | tur | tr_TR |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | tr_TR |
| dc.subject | Abort, Campylobacter spp., Chlamydia abortus, Coxiella burnetii, Koyun, Keçi, Real Time PCR | tr_TR |
| dc.title | EGE BÖLGESİNDE YETİŞTİRİLEN KOYUN VE KEÇİLERDE GÖRÜLEN ABORT VAKALARINDA, CAMPYLOBACTER SPP, CHLAMYDIA ABORTUS, COXIELLA BURNETII’NİN MOLEKÜLER YÖNTEMLER İLE PREVALANSININ ARAŞTIRILMASI | tr_TR |
| dc.type | doctoralThesis | tr_TR |
| dc.contributor.authorID | 10809067 | tr_TR |
| dc.contributor.department | Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Veterinerlik Mikrobiyolojisi Anabilim Dalı | tr_TR |
| Appears in Collections: | Doktora | |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| Aydın YAĞIZ Doktora Tezi 23.06.2026.pdf | 1.76 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.