Please use this identifier to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/11607/5210
Full metadata record
DC Field | Value | Language |
---|---|---|
dc.contributor.advisor | Parın, Uğur | - |
dc.contributor.author | Boyraz, Abdullah | - |
dc.date.accessioned | 2024-08-13T09:03:27Z | - |
dc.date.available | 2024-08-13T09:03:27Z | - |
dc.date.issued | 2024-08-13 | - |
dc.date.submitted | 2024-08-07 | - |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11607/5210 | - |
dc.description.abstract | Amaç: Bu araştırma doğal sucul ortamlardan biri olan Beymelek lagünündeki su ve balık örneklerinden izole edilen bakterilerde en sık karşılaşılan antibiyotik direnç genlerinin varlığının tespiti amacıyla yapılmıştır. Gereç ve Yöntem: Araştırma Antalya ili Demre ilçesi sınırlarında bulunan Beymelek lagününün beş farklı noktasından iki farklı dönemde alınan su örnekleri ve lagün deniz bağlantı noktasından elde edilen balık türleri ile gerçekleştirilmiştir. Su ve balık örneklerinden izole edilen bakteriler tanımlandıktan sonra belirlenen 16 gen için PCR işlemi uygulanmıştır. Su numunelerinin alındığı noktalarda sıcaklık, pH ve tuzluluk değerleri ölçülmüş ve elde edilen veriler doğrultusunda bakterileri türleri ve seçilen antibiyotik direnç genleri varlığı kıyaslanmıştır. Bulgular: Şubat ayında alınan su örneklerinden 16, ağustos ayı örneklerinden ise 12 bakteri suşu izole edilmiştir. Sıcaklık ve tuzluluğun artması bazı bakterilerin izole edilmesini desteklerken, toplam bakteri sayısında azalmaya neden olmuştur. Hem su örneklerinden hem de balıklardan ortak olarak izole edilen bakteri türleri Pseudomonas luteola, Pseudomonas stutzeri, Kocuria kristinae ve Kocuria rhizophila iken, su örneklerinden ortak olarak izole edilen bakteriler Micrococcus luteus ve Kocuria rhizophila olmuştur. 38 bakteri suşunda bakılan 16 antibiyotik direnç geninden yalnızca intI1, blaTEM, ermB, sul1, sul2 ve tetW genleri izole edilmiştir. Sonuç: Bu çalışmada çevre kökenli bakterilerde antibiyotik direnç geni varlığı teyit edilmiştir. | tr_TR |
dc.description.tableofcontents | İÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY i TEŞEKKÜR ii İÇİNDEKİLER iii SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ vi ŞEKİLLER DİZİNİ vii RESİMLER DİZİNİ viii TABLOLAR DİZİNİ x ÖZET xi ABSTRACT xii 1. GİRİŞ 1 2. GENEL BİLGİLER 3 2.1. Denizlerde ve balıklarda görülen bakteriler 3 2.2 Antibiyotik direnci 4 2.3. Mobil Genetik Elementler 5 2.3.1. İntegronlar 5 2.3.2. Transpozonlar 6 2.3.3. Fajlar 7 2.3.4. Plazmidler 7 2.4. Yatay Gen Transfer Mekanizmaları 8 2.4.1. Konjugasyon 8 2.4.2. Transformasyon 8 2.4.3. Transdüksiyon 8 2.5. Antimikrobiyal Direnç Mekanizmaları 9 2.5.1. Hücre zarı geçirgenliğinin değiştirilmesi 10 2.5.2. Enzimatik modifikasyon ve inaktivasyon 10 2.5.3. Farklı metabolik yollar 11 2.5.4. Hedef bölgelerin değişimi 11 2.5.5. Aktif akış pompaları 11 2.5.6. Çoklu İlaç Direnci 12 2.6. Antibiyotiklerin Etki Mekanizmaları 13 2.6.1. β-laktam antibiyotikler 13 2.6.2. Aminoglikozidler 14 2.6.3. Tetrasiklinler 14 2.6.4. Kinolonlar 15 2.6.5. Makrolid/Linkozamid/Streptogramin (MLS grubu) antibiyotikler 15 2.6.6. Sulfonamidler ve Trimetoprim 15 2.6.7. Amfenikoller 16 2.7. Antibiyotik Direnç Genleri 17 2.7.1. β-laktam (ampC, blaTEM): 17 2.7.2. Aminoglikozid (aadA1): 18 2.7.3. Tetrasiklin (tetA, tetB, tetW): 18 2.7.4. Kinolon (qnrA1): 18 2.7.5. Makrolid/Linkozamid/Streptogramin (ermB, mphA): 19 2.7.6. Sulfonamid (sul1, sul2, sul3) Trimetoprim (dfrA1): 19 2.7.7. Amfenikol (cfr, floR): 19 2.7.8. Sınıf 1 integron integraz (intI1): 20 2.8. Antibiyotik Direncinin Ekolojik Sistemlere Etkileri 20 2.9. Lagünler 22 2.9.1. Beymelek Lagünü (36°16′K 30°03′D) 23 3. GEREÇ VE YÖNTEM 24 3.1. Gereç 24 3.1.1. Örnekleme 24 3.1.2. Kullanılan Cihazlar ve Ekipmanlar 25 3.1.3. Kullanılan Besiyerleri ve Kimyasallar 26 3.1.4. Primerler 28 3.2. Yöntem 29 3.2.1. Su ve Balık Örneklerinin Alınması 29 3.2.2. Su ve Balık Örneklerinden Bakteriyolojik Ekimler 30 3.2.3 Gram Boyama 33 3.2.4. Katalaz ve Oksidaz Testleri 33 3.2.5. Bakterilerin Tanımlanması 33 3.2.6. Koloni PCR 34 3.2.7. Antibiyotik Direnç Genlerinin PCR ile Belirlenmesi: 35 3.2.8. Jel Elektroforezi 36 3.2.9. Jel görüntüleme 36 4. BULGULAR 37 4.1. Su Örnekleri 37 4.1. Balık Örnekleri 39 4.3. Bakteri Tanımlama 42 4.4. PCR Bulguları 48 5. TARTIŞMA 59 6. SONUÇ VE ÖNERİLER 79 KAYNAKLAR 80 ÖZ GEÇMİŞ 115 | tr_TR |
dc.language.iso | tur | tr_TR |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | tr_TR |
dc.subject | Lagün, Su, Balık, Bakteri, Antibiyotik direnci, Antimikrobiyal direnç, Gen | tr_TR |
dc.title | Beymelek Lagünü Su ve Balık Örneklerinden İzole Edilen Bakterilerde Antibiyotik Direnç Genlerinin Tespiti | tr_TR |
dc.type | doctoralThesis | tr_TR |
dc.contributor.authorID | 10659032 | tr_TR |
dc.contributor.department | Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü | tr_TR |
Appears in Collections: | Doktora |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
Abdullah Boyraz Doktora tezi 12.08.2024.pdf | TAM METİN | 2.79 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.