Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11607/5050
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorÖrenay Boyacıoğlu, Seda-
dc.contributor.authorTUNA, AYTEN-
dc.date.accessioned2023-08-28T11:30:39Z-
dc.date.available2023-08-28T11:30:39Z-
dc.date.issued2023-
dc.date.submitted2023-08-07-
dc.identifier.citationTuna, A. (2023). Alzheimer tipi demans ile BDNF (Beyin Kaynaklı Nörotrofik Faktör) genini düzenleyen mikroRNA polimorfizmleri arasındaki ilişkinin araştırılması. Yüksek Lisans Tezi, Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Aydın.tr_TR
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11607/5050-
dc.description.abstractALZHEİMER TİPİ DEMANS İLE BDNF (BEYİN KAYNAKLI NÖROTROFİK FAKTÖR) GENİNİ DÜZENLEYEN MİKRORNA POLİMORFİZMLERİ ARASINDAKİ İLİŞKİNİN ARAŞTIRILMASI Tuna A. Aydın Adnan Menderes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoteknoloji Programı, Yüksek Lisans Tezi, Aydın, 2023. Amaç: Alzheimer tipi demans, nöron kaybı ve defektleriyle ilişkili bir nörodejeneratif hastalıktır. BDNF (Beyin Kaynaklı Nörotrofik Faktör), nöronların hayatta kalması ve fonksiyonu için önemlidir ve Alzheimer dahil nörodejeneratif hastalıklarla ilişkilendirilmiştir. MikroRNA'lar (miRNA'lar), BDNF genide dahil gen ekspresyonunun düzenlenmesinde hayati bir rol oynayan küçük, kodlayıcı olmayan RNA molekülleridir. Biriken veriler, BDNF sentezinin miRNA'lardan etkilenebileceğini, aslında BDNF ve miRNA'lar arasında düzenleyici bir negatif geri besleme döngüsü olduğunu göstermektedir. Bu açıdan araştırmamızda, Alzheimer tipi demans hastalarında BDNF genini düzenleyen miRNA polimorfizmlerinin araştırılması amaçlanmaktadır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya Aydın Devlet Hastanesi Psikiyatri polikliniğine başvuran 70 Alzheimer Tipi Demans hastası ile yine Psikiyatri polikliniğine başvuran ve Alzheimer tipi Demans ile başka nörodejeneratif hastalığı bulunmayan aynı yaş grubunda 70 sağlıklı birey dahil edildi. Çalışmada, Entegre Akışkan Devre (IFC) tabanlı bir BioMark teknolojisi kullanılarak nanolitre hacimlerinde reaktiflerle genotipleme yapıldı. Fluidigm tarafından geliştirilen SNPType Paneli, hasta ve kontrol grubumuzun DNA örnekleri üzerinde 5 ilişkili miRNA bölgesini incelemek için kullanıldı. Bulgular: Alzheimer tipi demans ve kontrol grupları arasında cinsiyet ve yaş bakımından istatistiksel olarak anlamlı bir fark saptanmadı. Alzheimer tipi demans grubu ile kontrol grubunun karşılaştırılması sonucu miR-206, miR-30e, miR-26b polimorfizmlerinin genotip dağılımında ve miR-30e ve miR-206 polimorfizmlerinin allel frekanslarında istatistiksel olarak anlamlı farklılıklar görüldü (p <0,05). Sonuç: Araştırmamızın potansiyel sonuçları, Alzheimer tipi demansın mekanizmalarını anlamaya yönelik bilgi sağlayabilir ve miRNA polimorfizmlerini biyobelirteç olarak kullanarak Alzheimer predispoziyonu belirleme ve demans alt tiplerini ayırt etme konusunda katkıda bulunabilir. Ayrıca, miRNA'lar ve BDNF arasındaki ilişkinin terapötik etkilerini araştırarak Alzheimer hastalığına profilaktik etkili hedefli tedaviler geliştirilebilir.tr_TR
dc.description.tableofcontentsİÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY i TEŞEKKÜR ii İÇİNDEKİLER iii SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ vi ŞEKİLLER DİZİNİ x RESİMLER DİZİNİ xi TABLOLAR DİZİNİ xii ÖZET xiii ABSTRACT xv 1. GİRİŞ 1 2. GENEL BİLGİLER 3 2.1. Demans 3 2.2. Alzheimer Tipi Demans 5 2.3. Alzheimer Tipi Demansın Epidemiyolojisi 7 2.4. Alzheimer Tipi Demansın Patofizyolojisi 7 2.4.1. Amiloid Beta Hipotezi 8 2.4.2. Tau Protein Hipotezi 9 2.5. Alzheimer Tipi Demansın Etiyolojisi 12 2.6. Etiyolojisinden Sonra Alzheimer Tipi Demansı Değerlendirme 13 2.7. Alzheimer Tipi Demansın Genetiği 14 2.8. Alzheimer Tipi Demansta Nörogörüntüleme ve Biyobelirteçler 17 2.9. Alzheimer Tipi Demansın Tedavisi 19 2.10. Beyin Kaynaklı Nörotrofik Faktör 26 2.11. BDNF Gen Yapısı ve Transkriptler 27 2.12. BDNF’nin Merkezi Sinir Sistemindeki Rolleri 29 2.13. BDNF'nin Alzheimer Tipi Demansta Nöroprotektif Rolü 30 2.14. MikroRNA (miRNA) 32 2.14.1. MiRNA Biyogenezi 32 2.14.2. MiRNA’nın mRNA Hedeflerini Düzenlemesi 34 2.14.3. Nörodejeneratif Bozukluklarda miRNA’lar 35 2.14.4. BDNF’yi Düzenleyen miRNA’ların AD’deki Etkileri 36 3. GEREÇ VE YÖNTEM 37 3.1. Çalışma Gereçleri 37 3.1.1. Kullanılan Cihazlar 37 3.1.2. Kullanılan Yazılımlar 37 3.1.3. Kullanılan Sarf Malzemeler 38 3.1.4. Kullanılan Kimyasallar 38 3.1.5. Kullanılan Kitler 39 3.1.6. Kullanılan Çözeltilerin Hazırlanışı 39 3.2. Deneysel Çalışma Tasarımı 40 3.2.1. Araştırmanın Örneklem Büyüklüğü 41 3.2.2. Kontrol ve Hasta Grubunun Klinik Değerlendirme Ölçekleri 41 3.2.3. Kontrol ve Hasta Gruplarının Oluşturulması 41 3.2.3.1. Olguların Çalışmaya Dahil Edilme Kriterleri 41 3.2.3.2. Olguların Çalışmaya Dahil Edilmeme Kriterleri 42 3.2.4. Alzheimer Tipi Demansta BDNF İlişkili miRNA’ların Seçilmesi 43 3.2.5. Genotipleme için miRNA Polimorfizmlerinin Seçilmesi 43 3.2.6. miRNA Polimorfizmleri İçin SNPType Assay Yöntemine Uygun Primer Tasarımı 44 3.3. Çalışma Yöntemi 46 3.3.1. Periferik Kandan Genomik DNA İzolasyonu 46 3.3.2. SNP Genotipleme Testi: SNPType Assay 48 3.3.3. SNPType Assay Flex Six Chip Protokolü 49 3.3.3.1. 10X SNPType Spesific Target Amplifikasyon (STA) Primer Havuzunun Hazırlanması 49 3.3.3.2. Spesifik Target Amplifikasyon (STA) Adımı 51 3.3.3.2.1. SNPType Primer Karışımının Hazırlanması 54 3.3.3.2.2. 10X Assay Karışımının Hazırlanması 54 3.3.3.2.3. Örnekler için Mix Hazırlanması 55 3.3.3.3. IFC Controllerda Genotyping Flex-Six Chip’ in Prime Adımı 56 3.3.3.3.1. Genotyping Flex-Six Chip’e Pipetlemelerin Yapılması 58 3.3.3.4. IFC Controller da Genotyping Flex-Six Chip’ in Load Adımı 58 3.3.3.5. Genotyping Flex-Six Chip’ in BioMark’ da Real-Time PCR Yöntemi ile Genotip Analizi 59 3.3.4. AD ve BDNF İlişkili miRNA Genlerine Ait SNP’lerin Data Analizi 61 3.4. İstatistiksel ve Analitik Olarak Çalışmanın Değerlendirilmesi 61 4. BULGULAR 62 5. TARTIŞMA 65 6. SONUÇ VE ÖNERİLER 71 KAYNAKLAR 72 EK-1 (ADÜ-GİRİŞİMSEL OLMAYAN KLİNİK ARAŞTIRMALAR ETİK KURULU) 79 BİLİMSEL ETİK BEYANI 80 ÖZ GEÇMİŞ 81tr_TR
dc.language.isoturtr_TR
dc.publisherAydın Adnan Menderes Üniversitesi-Sağlık Bilimleri Enstitüsütr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesstr_TR
dc.subjectAlzheimer tipi demans, Alzheimer hastalığı, BDNF geni, BDNF genini regüle eden miRNA’lar, SNPType Assaytr_TR
dc.titleALZHEİMER TİPİ DEMANS İLE BDNF (BEYİN KAYNAKLI NÖROTROFİK FAKTÖR) GENİNİ DÜZENLEYEN MİKRORNA POLİMORFİZMLERİ ARASINDAKİ İLİŞKİNİN ARAŞTIRILMASItr_TR
dc.typemasterThesistr_TR
dc.contributor.authorID0000-0003-2199-6575tr_TR
dc.contributor.departmentAydın Adnan Menderes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoteknolojitr_TR
Appears in Collections:Yüksek Lisans

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Ayten TUNA Yüksek Lisans Tezi.pdf1.57 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.