1. Earsiv@Adu
  2. Tez
  3. Yüksek Lisans
Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11607/4730
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorDönmez Yalçın, Gizem-
dc.contributor.authorAkkulak, Ayşenur-
dc.date.accessioned2022-08-10T09:44:28Z-
dc.date.available2022-08-10T09:44:28Z-
dc.date.issued2022-08-10-
dc.date.submitted2022-07-27-
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11607/4730-
dc.description.abstractAmaç: Eksitotoksisite; glutamatın, fazla salınım veya bozulmuş geri alım nedeniyle nöronlar arası boşlukta birikme durumudur. Eksitotoksisite birçok beyin hastalığında rol oynar. Nöronlar arası boşluğa salınan glutamatı, astrositlerde bulunan GLT-1 (Glutamat Transporter 1) toplar. Glutamatın bir kısmı, astrositlerde glutamat dehidrogenaz (GDH) tarafından α-ketoglutarata çevrilir ve TCA siklusuna girer. İkinci bir yol olarak; glutamat, astrositlerde glutamin sentetaz (GS) tarafından glutamine çevrilir. Glutamin, tekrar glutamaterjik nörona geçerek bu döngüyü sürdürür. Gereç ve Yöntem: Glioblastoma Multiform (GBM), tüm birincil beyin ve merkezi sinir sistemi neoplazilerinin %16'sını oluşturan, en yaygın birincil kötü huylu beyin tümörüdür. Glioblastomada, nöronların, eksitotoksisite yolu ile öldüğü bilinmektedir. Glutamat alınımından çoğunlukla Glutamat Transporter 1 (GLT-1) diğer adıyla Eksitatör Amino Asit Taşıyıcısı 2 (EAAT2) sorumludur. EAAT2'nin aktivitesinin azalması, glutamat birikimine yol açar. Bu birikim, hücre içi Ca+2 konsantrasyonunda yükselme ve hücresel ATP seviyelerinde azalma yolunu takip ederek glutamat eksitotoksisitesine ve nöronların olası nekrozuna sebep olur. Bulgular: Sirtuinler, proteinleri deasetilasyon veya ADP-ribosilasyon yoluyla posttranslasyonel olarak modifiye eden; çekirdek, mitokondri veya sitoplazmada ifade edilen enzimlerdir. Sirtuin 4 (SIRT4), beyinde de ifade edilen bir mitokondriyal sirtuindir. Daha önce, SIRT4'ün farede delesyonunun, bir eksitotoksik ajan olan kainik aside karşı hassasiyeti arttırdığı ve GLT-1'e bağlı glutamat alımını azalttığı gösterilmiştir. Yapılan diğer çalışmalarda ise SIRT4'ün, hücre dizilerinde, glutamate metabolizmasını modüle ederek, eksitotoksisiteyi engellediği gösterilmiştir. Glutamat metabolizması modülatörlerinin glioblastoma tümörlerindeki ifadesinin belirlenmesi; hastalığın tespiti, prognozu, mekanizması ve ilerleyişini anlamak için yol gösterici olacaktır. Sonuç: Bu çalışmada 84 adet primer tümörlü beyin dokusu (parafinli kesit), 12 adet kontrol beyin dokusu (parafinli kesit) alınmıştır. Parafinli doku kesitlerinden, RNA izolasyon kiti kullanılarak ve protokole uyarak total RNA çıkarılmıştır. Nanodrop ile RNA konsantrasyonları ve kalitesi ölçüldükten sonra cDNA sentez kiti kullanılarak ve verilen protokole uyularak cDNA elde edilmiştir. Elde edilen cDNA, glutamat dehidrojenaza (GDH), glutamin sentetaz (GS) ve Sirtuin4 (SIRT4)'e özgü primerler kullanılarak ve qPCR (quantitative PCR-kuantitatif polimer zincir reaksiyonu) kit protokolüne uyularak mRNA elde etme işlemine tabi tutulmuştur. Elde edilen GDH, GS ve SIRT4 mRNA'ları, beta aktin mRNA'sına oranlanarak normalleştirilmiştir. Daha sonra istatiksel analizde iki örnek grubunun ortalamaları arasındaki fark için Two-Tailed Unpaired, Student's t-test kullanılmıştır. Grup sayısı üç ve üzerinde olan durumlar için ise OneWay ANOVA testi kullanılmıştır.tr_TR
dc.description.tableofcontentsİÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY .................................................................................................................. Y TEŞEKKÜR ............................................................................................................................YY SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ ...........................................................................Yv ŞEKİLLER DİZİNİ...............................................................................................................vYY TABLOLAR DİZİNİ............................................................................................................vYYY ÖZET ...................................................................................................................................... Yx ABSTRACT .........................................................................................................................xYYY 1. GİRİŞ...................................................................................................................................1 2. GENEL BİLGİLER ............................................................................................................. 5 2.1. GlYoblastoma MultYforme (GBM) .................................................................................... 5 2.1.1. MerkezY SYnYr SYstemY TümörlerYnYn Sınıflandırılması .................................................. 6 2.1.1.1. GlYoblastoma............................................................................................................... 7 2.1.1.2. Medulloblastoma ........................................................................................................ 8 2.1.1.3. OlYgodendroglYoma.....................................................................................................8 2.1.1.4. EpendYmoma...............................................................................................................9 2.1.1.5. MenengYoma ............................................................................................................. 10 2.1.1.6. AstrosYtoma ............................................................................................................... 11 2.2. Glutamata Bağlı EksYtotoksYsYte ..................................................................................... 12 2.2.1. EksYtotoksYsYte Nasıl Meydana GelYr? ......................................................................... 12 2.3. Glutamat ......................................................................................................................... 13 2.4. Glutamat MetabolYzması................................................................................................. 14 2.5. Glutamat Döngüsü..........................................................................................................14 2.6. Glutamat ReseptörlerY ..................................................................................................... 15 iii 2.6.1. MetabotropYk Glutamat ReseptörlerY (mGLuR) .......................................................... 16 2.6.2. İyonotropYk Glutamat ReseptörlerY (YGluR) ................................................................ 17 2.6.2.1. NMDA (N-MetYl-D-Aspartat) ReseptörlerY .............................................................. 18 2.6.2.2. AMPA (α-amYno-3-hYdroksY-5-metYl-4-YzoksazolpropYyonYk asYt) ReseptörlerY ....... 18 2.6.2.3. KaYnat ReseptörlerY ................................................................................................... 19 2.7. Glutamat Taşıyıcıları ...................................................................................................... 19 2.7.1. EksYtatör AmYno AsYt Taşıyıcıları (EAAT'ler) .............................................................. 20 2.7.2. VesYküler Glutamat Taşıyıcıları (VGLUT'lar) ............................................................. 21 2.8. Glutamat DehYdrogenaz (GDH)...................................................................................... 22 2.9. GlutamYn Sentetaz (GS)..................................................................................................25 2.10. GlYoblastoma ve EksYtotoksYsYte ArasındakY İlYşkY ........................................................ 26 2.10.1. GlYoblastomalarda Nekrozun FYzyolojYk MekanYzması.............................................27 2.11. SYrtuYnler (Sırt)..............................................................................................................29 2.11.1. SYrtuYn 4 (SIRT4) ....................................................................................................... 31 3. GEREÇ VE YÖNTEM ...................................................................................................... 34 3.1. Gereç............................................................................................................................... 34 3.1.1. Kullanılan CYhazlar......................................................................................................34 3.1.2. Kullanılan KYmyasal Maddeler....................................................................................34 3.2. Yöntem ........................................................................................................................... 35 3.2.1. Gen İfadesY DeğYşYm AnalYzlerY ................................................................................... 36 3.2.1.1.Total RNA İzolasyonlarının Yapılması ...................................................................... 36 3.2.1.2. RNA’nın Saflık ve KalYte Kontrolünün Yapılması ................................................... 38 3.2.1.3. Komplementer DNA (cDNA) SentezYnYn GerçekleştYrYlmesY .................................. 38 3.2.1.4. Real TYme PCR (RT-PCR) ....................................................................................... 39 3.2.2. İstatYksel AnalYz ........................................................................................................... 41 4. BULGULAR ..................................................................................................................... 42 iv 4.1. SIRT4’ün İntrakranYyel PrYmer Tümör DokularındakY Gen İfadesYnYn BelYrlenmesY ..... 42 4.2. GlutamYn Sentetaz (GS)’nYn İntrakranYyel PrYmer Tümör DokularındakY Gen İfadesYnYn BelYrlenmesY ................................................................................................ 43 4.3. GDH’ın İntrakranYyel PrYmer Tümör DokularındakY Gen İfadesYnYn BelYrlenmesY........45 5. TARTIŞMA ....................................................................................................................... 48 6. SONUÇ VE ÖNERİLER................................................................................................... 51 KAYNAKLAR ...................................................................................................................... 52 EKLER .................................................................................................................................. 66 Ek 1. Etik Kurul Karar Formu ............................................................................................... 66 BİLİMSEL ETİK BEYANI................................................................................................... 68 ÖZ GEÇMİŞ..........................................................................................................................69tr_TR
dc.language.isoturtr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesstr_TR
dc.subjectGlutamat Dehidrojenaz, Glutamin Sentetaz, Glioblastoma, SIRT4, Eksitotoksisitetr_TR
dc.titleGlioblastoma Primer Beyin Tümörlerinde Sırt4'ün Glutamat Metabolizması İle İlişkisinin İncelenmesi Ve Potansiyel Tümör Baskılayıcı Özelliğinin Araştırılmasıtr_TR
dc.typemasterThesistr_TR
dc.contributor.departmentAydın Adnan Menderes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalıtr_TR
Appears in Collections:Yüksek Lisans

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
BASKI AYŞENUR AKKULAK kopyası.pdfAyşenur Akkulak Yüksek Lisans Tez Dosyası8.05 MBAdobe PDFView/Open
Show simple item record


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.