MARMARA BÖLGESİ RUMİNANT ABORTLARINDA Coxiella burnetii’nin REAL-TİME PCR İLE TEŞHİSİ VE MLVA İLE MOLEKÜLER KARAKTERİZASYONU

Abstract

Amaç: Marmara Bölgesindeki ruminant türlerinde C.burnetii varlığının daha iyi değerlendirilmesi ve elde edilen MLVA profillerinin inaktif veri tabanları ile karşılaştırılması, elde edilen verilerle enfeksiyonlardan sorumlu suşların genotiplendirilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Tez çalışmasında, 2017-2019 yılları toplanan 32 sığır, 4 manda, 64 koyun, 8 keçi olmak üzere toplam 108 adet evcil ruminantlara ait aborte fetüs ve plasentala örnekleri materyali oluşturmaktadır. Numunelerin analizlerinde DNA ekstraksiyonu, Real Time PCR, Nested PCR ve MLVA yöntemleri kullanılmıştır. Bulgular: Sunulan tez çalışmasında toplam 108 adet aborte fetüs ve plasenta örneği analiz edilmiştir. Numunelerin alındığı hayvan türleri incelendiğinde koyun örnekleri tüm incelenen numunelerinin %59,2 (64/108)’sini oluşturmuştur. Real Time PCR ile DNA’sı tespit edilen türler; koyun numunlerinde %20,3 (13/64), sığır numunelerinde %9,4 (3/32), keçi numunelerinde %25 (2/8) oranında olduğu belirlenmiştir. Manda numunelerinden herhangi bir pozitiflik tespit edilmemiştir. MLVA analizleri sonrasında tespit edilen C.burnetii suşlarının Dünya literatürleriyle karşılaştırılması sonrası yakınlık durumları kayıt edilmiştir. Sonuç: Marmara Bölgesinde yer alan 12 İlden toplanan 108 adet evcil ruminantlara ait aborte fetüs ve plasenta örneklerinde C.burnetii varlığının tespiti ve MLVA yöntemiyle pozitif DNA’ya sahip numunlerin diğer Coxiella burnetii suşlarıyla olan ilişkilerinin araştırıldığı bu tez çalışmasında; hem Real Time hem de Nested PCR yöntemleriyle 18’er adet paralel C.burnetii DNA’sı saptanmıştır. 16 pozitifliğin MLVA yöntemiyle çalışılması sonucunda yakın ilişkisi bulunan suşlar kayıt edilmiştir.