Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11607/4621
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorKılıç Eren, Mehtap-
dc.contributor.authorDemir, Ebru-
dc.date.accessioned2022-02-09T06:04:21Z-
dc.date.available2022-02-09T06:04:21Z-
dc.date.issued2022-
dc.date.submitted2022-01-17-
dc.identifier.citationDemir, E. (2022) Rabdomyosarkom hücre dizisinde onkogenik WIP1 fosfatazın ve DNA hasarı cevabı regülasyonunun araştırılması (yayınlanmamış Yüksek Lisans tezi) Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Aydıntr_TR
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11607/4621-
dc.description.abstractAmaç: RMS A204 hücre hattında onkojenik Wip1 fosfatazın genotoksik stres kaynaklı (etoposid) apoptoz aktivasyonu üzerine etkisinin araştırılması amaçlandı. Gereç ve Yöntem: Çalışmada, A204 hücrelerinde etoposid, GSK2830371 ve etoposid + GSK2830371 kullanılarak; Hücre canlılığı, 24-48-72 saatlik inkübasyonun ardından MTT ile analizi edildi. Apoptozu indüklemek için 24-48-72 saatlik inkübasyonun ardından Annexin V testi yapıldı. WIP1, GAPDH, fosfo p53 ve total p53 proteinlerinin seviyeleri, 48 saatlik inkübasyonun ardından Western blot analizi ile ölçülmüştür. Bulgular: Etoposide'in GSK ile kombinasyonu halinde zamana ve doz artışına bağlı olarak metabolik aktiviteyi azalttığı MTT testi ile belirlenmiştir. Etoposid ve GSK kombinasyonun da zaman artışına bağlı olarak apoptoz miktarında artış olduğu Annexin V testi ile saptanmıştır. Etoposid + GSK kombinasyonunun Wip1’in baskılanmasıyla fosfo p53 proteini seviyesinde artışa sebep olduğu Western Blot analizi ile tespit edilmiştir. Sonuç: bu çalışmada, A204 rabdomyosarkom hücre hattında PPM1D amplifikasyonu nedeniyle aşırı artan Wip1 ekspresyonunu inhibe ederek genotoksik stres oluşturan bir kemoterapi ajanı olan etoposidin etkinliği ve bu hücrelerin apoptoz yoluyla kemoterapiye yanıtı araştırıldı.tr_TR
dc.description.abstractObjective: It was aimed to investigate the effect of oncogenic Wip1 phosphatase on genotoxic stress-induced (etoposide) apoptosis activation in RMS A204 cell line. Material and Methods: In the study, using etoposide, GSK2830371, and etoposide + GSK2830371 in A204 cells; Cell viability was tested by MTT analysis after 24-48-72 hours of incubation. Annexin V test was performed at the end of the 24-48-72 hours period to induce apoptosis. The levels of WIP1, GAPDH, phospho p53, and total p53 proteins were measured by Western blot analysis at 48 hours. Results: It has been determined by the MTT test that Etoposide reduces metabolic activity depending on time and dose increase in combination with GSK. It was determined by the Annexin V test that the combination of etoposide and GSK also increased the amount of apoptosis depending on the increase in time. It was determined by Western blot analysis that the combination of etoposide + GSK caused an increase in the level of phospho p53 protein by suppressing Wip1. Conclusion: in this study, the efficacy of etoposide, a chemotherapy agent that creates genotoxic stress by inhibiting the excessively increased expression of Wip1 due to PPM1D amplification in A204 rhabdomyosarcoma cell line, and the response of these cells to chemotherapy were investigated through apoptosis.tr_TR
dc.description.sponsorshipAydın Adnan Menderes Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri birimi TPF21001 nolu proje ile bu tez çalışması desteklenmiştir.tr_TR
dc.description.tableofcontentsİÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY İ TEŞEKKÜR İİ İÇİNDEKİLER İİİ ŞEKİLLER DİZİNİ Vİİ TABLOLAR DİZİNİ Vİİİ ÖZET İX ABSTRACT X 1.GİRİŞ 1 2.GENEL BİLGİLER 6 2.1.Rabdomyosarkom 6 2.3. PPM1D/Wip1 Fosfatazın Regülasyonu ve DDR’de Rolü 9 2.3.2. Wip1’in Apoptozis Üzerine Etkisi 12 2.3.3. Wip1’in kontrol noktaları üzerine etkisi 13 3.GEREÇ VE YÖNTEMLER 15 3.1.Gereç 15 3.1.1.Kullanılan Hücre Dizisi, Cihazlar ve Aletler 15 3.2.Yöntem 17 3.2.1. Hücre Kültürü Çalışmaları 17 3.2.2. Hücrelerin Çözdürülüp Kullanılması 17 3.2.3. Hücrelerin Sayım Yöntemi 17 3.2.4. Hücrelerin Pasajlanması 18 3.2.5. Hücrelerin Dondurulup Saklanma İşlemi Dondurma Besiyeri İçeriği 19 3.2.6. Kemoterapötik İlaç Stoklarının Hazırlanması 19 3.2.7. Hücre Kültürü Çalışmalarının ve Sonrasında Yapılacak Olan Analizlerin Hazırlanışı 21 3.2.8. A204 Hücre Hattında MTT Hücre Canlılığı Testi 21 3.2.9. A204 Hücre Hattında Annexin V ApoptozisTesti 22 3.2.10. Western Blot Analizi İçin Yapılan Çalışmalar 23 3.2.10.1. Protein İzolasyonu ve Protein Miktar Tayini 23 3.2.10.2.Western BlotAnalizi 24 3.2.10.3.Poliakrilamid Jelin (SDS-PAGE) Hazırlanması 26 3.2.10.4. Jele Yüklenecek Protein Örneklerinin Hazırlanması 27 3.2.10.5. Elektroforetik Yürütme İşlemi 28 3.2.10.6. Yarı-Kuru Transfer (Semi-DryBlotting) 28 3.2.10.7. MembranıBloklama İşlemi 29 3.2.10.8. Membranın Primer Antikor İleMuamelesi 29 3.2.10.9. KemilüminesansYöntemİleMembranıGörüntüleme 30 4. BULGULAR 31 4.1. MTT Testi ile Hücre Canlılığının ve Sitotoksik Etkinin 24, 48 ve 72 s Sonuçları 31 4.2. Annexin-V Testi ile Hücre Ölümü Analizi 24, 48 ve 72 s Sonuçları 34 4.3. Etoposid ve GSK2830371 uygulmasının wip1, p53 seviyesi üzerine Etkileri 38 5. TARTIŞMA 40 5.1. A204 Hücrelerinde Wip1’in GSK2830371 Tarafından İnhibisyonu 40 5.2. Etoposid Uygulamasının A204 Hücreleri Üzerinde Etkileri 42 5.3. GSK ve EtoUygulamasının A204 Hücrelerinde Apoptotik Etkileri 43 6. SONUÇLAR VE ÖNERİLER 46 7. KAYNAKLAR 47 EKLER 56 Ek 1 (24 Saat MTT İstatik Analizleri) 56 Ek 2 (48 Saat MTT İstatik Analizleri) 58 Ek 3 (72 Saat MTT İstatik Analizleri) 60 Ek 4 (24 Saat Annexin İstatik Analizleri) 62 Ek 5(48 Saat Annexin İstatik Analizleri) 64 Ek 6 (72 Saat Annexin İstatik Analizleri) 66 BİLİMSEL ETİK BEYANI 68 ÖZ GEÇMİŞ 69tr_TR
dc.language.isoturtr_TR
dc.publisherAydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsütr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccesstr_TR
dc.subjectDNA hasarı cevabı (DDR), A204, Rabdomyosarkom (RMS), Wip1 fosfataztr_TR
dc.titleRabdomyosarkom hücre dizisinde onkogenik WIP1 fosfatazın ve DNA hasarı cevabı regülasyonunun araştırılmasıtr_TR
dc.title.alternativeInvestigation of oncogenic WİP1 phosphatase and DNA damage response regulation in rhabdomyosarcoma cell linetr_TR
dc.typemasterThesistr_TR
dc.contributor.authorID0000-0001-7455-2885tr_TR
dc.contributor.departmentAdnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Bölümütr_TR
Appears in Collections:Yüksek Lisans

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
EBRU DEMİR TEZ 2022.pdfEbru Demir Yüksek Lisans Tez dosyası3.54 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.