Please use this identifier to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/11607/4241Full metadata record
| DC Field | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.advisor | Benlioğlu, Seher | - |
| dc.contributor.author | Erdem, Canan | - |
| dc.date.accessioned | 2021-09-14T09:28:48Z | - |
| dc.date.available | 2021-09-14T09:28:48Z | - |
| dc.date.issued | 2020 | - |
| dc.date.submitted | 2020 | - |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11607/4241 | - |
| dc.description.abstract | MUĞLA İLİ, DATÇA İLÇESİ’NDE BADEM AĞAÇLARINDA DAL VE SÜRGÜNLERDE KURUMA VE YANIKLIKLARA NEDEN OLAN FUNGAL ETMENLERİN SAPTANMASI Canan ERDEM Yüksek Lisans Tezi, Bitki Koruma Anabilim Dalı Tez Danışmanı: Prof. Dr. H. Seher BENLİOĞLU 2020, 69 sayısı Çalışma, Muğla İli Datça ilçesinde badem ağaçlarında sürgün ve dal yanıklıklarına, geriye doğrum ölüme ve verim kayıplarına neden olan Botryosphaeriaceae familyasında yer alan türlerin ve Diaporthe spp.’nin varlığını ortaya koymak ve neden olan etmenleri klasik ve moleküler yöntemler ile tanılamak amacıyla ele alınmıştır. 2018 ve 2019 yıllarında 8 köyde toplam 25 badem bahçesinden alınan hastalıklı bitki örneklerinden toplam 78 izolat elde edilmiştir. Tüm izolatlardan 36 tanesi (%46) Botryosphaeriaceae, 42 (%54) adet izolat Diaporthe spp. olarak belirlenmiştir. Bir yıllık badem sürgünlerinde (Nurlu badem çeşiti) yapılan patojenisite testinde tüm izolatların patojen olduğu saptanmıştır. Moleküler tanılamalar, patojen tek hif ucu izolatlardan elde edilen genomik DNA’ların Internal Transcribed Spacer (ITS) bölgesi, translation elongation factor 1-α (TEF-1α) geni ve β-tubulin (BT) genlerine özgü primer çiftleri ile PCR’da çoğaltılarak ürünlerinin baz dizilerinin belirlenmesi şeklinde yapılmıştır. Her izolata ait 3 farklı gene özgü baz dizileri Gen Bankası veri tabanı ve BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) yöntemi ile orijini belirli izolatların dizileri ile karşılaştırılarak analiz edilmiştir. Sonuç olarak, 14 Botryosphaeriaceae izolatından 5 izolat Neofusicoccum mediterraneum, 4 izolat Fusicoccum aesculi (Telemorph: Botryosphaeria dothidea), 4 izolat Dothiorella iberica (Telemorph: Botryosphaeria iberica), 1 izolat Dothiorella sarmentorum (Telemorph: Botryosphaeria sarmentorum) olarak tanılanmıştır. Bu türlerin hepsi bademde ülkemiz için ilk kayıt niteliğindedir. Ayrıca 38 Diaporthe spp. izolatından 37 izolatın Diaporthe amygdali, 1 izolatın Diaporthe ambigua olduğu belirlenmiştir. Bademde Phomopsis spp. nin varlığı ülkemizde daha önce saptanmakla birlikte tür düzeyinde tanımlanmamıştır. Etmen bu çalışma ile moleküler ve morfolojik olarak ilk kez Diaporthe amygdali olarak belirlenmiştir. Bilindiği kadarıyla bademde sürgün ve dal yanıklığına neden olan Diaporthe ambigua’nın varlığı dünyada ilk kayıt niteliğindedir. Çalışmada tüm viii Botryosphaeriaceae izolatları ile temsilci olarak seçilen 5 D. amygdali ve 1 D. ambigua izolatının morfolojik karakteristikleri de belirlenmiştir. | tr_TR |
| dc.description.tableofcontents | İÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY SAYFASI.............................................................................. iii BİLİMSEL ETİK BİLDİRİM SAYFASI ...............................................................iv ÖZET…................................................................................................................. vii ABSTRACT............................................................................................................ix ÖNSÖZ…. ..............................................................................................................xi KISALTMALAR DİZİNİ......................................................................................xv SİMGELER DİZİNİ............................................................................................ xvii ŞEKİLLER DİZİNİ...............................................................................................xix ÇİZELGELER DİZİNİ ...................................................................................... xxiii EKLER DİZİNİ.................................................................................................. xxiii 1 . GİRİŞ…… ..........................................................................................................1 2. KAYNAK ÖZETLERİ ........................................................................................8 3 . MATERYAL VE YÖNTEM ............................................................................13 3.1 . Materyal .........................................................................................................13 3.2. Yöntem............................................................................................................13 3.2.1. Örneklerin Toplanması.................................................................................13 3.2.2. İzolasyon Çalışması .....................................................................................15 3.2.3. Patojenisite Testleri ve Virülensliklerin Belirlenmesi..................................16 3.2.3.1. Sürgün Testleri..........................................................................................16 3.2.3.2. Koparılmış Meyve Testleri .......................................................................18 3.2.4. Patojen İzolatların Tanılanması....................................................................19 3.2.4.1. Moleküler Tanılama ..................................................................................19 3.2.4.1.1. DNA ekstraksiyonu................................................................................20 3.2.4.1.2. Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR)........................................................20 3.2.4.1.3. Blast ve filogenetik analiz......................................................................21 xiv 3.2.4.2. Morfolojik Tanılama .................................................................................21 4 . BULGULAR VE TARTIŞMA......................................................................... 23 4.1 . Örneklerinin Toplanması ve İzolasyon ..........................................................23 4.2. Patojenisite ve Virülensliklerin Belirlenmesi..................................................24 4.3. İzolatların Tanılanması....................................................................................31 4.3.1. Moleküler Tanılama .....................................................................................31 4.3.1.1. DNA ekstraksiyonu ...................................................................................31 4.3.1.2. Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR).........................................................33 4.3.1.3. BLAST Analizi..........................................................................................39 4.3.2. Morfolojik Tanılama ....................................................................................46 5. SONUÇ ..............................................................................................................59 KAYNAKLAR.......................................................................................................61 EKLER…….......................................................................................................... 65 ÖZGEÇMİŞ........................................................................................................... 69 | tr_TR |
| dc.language.iso | tur | tr_TR |
| dc.publisher | AYDIN ADNAN MENDERES ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ | tr_TR |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | tr_TR |
| dc.subject | Badem, Neofusicoccum mediterraneum, Fusicoccum aesculi, Dothiorella iberica, Dothiorella sarmentorum, Diaporthe amygdali, Diaporthe ambigua | tr_TR |
| dc.title | MUĞLA İLİ, DATÇA İLÇESİ’NDE BADEM AĞAÇLARINDA DAL VE SÜRGÜNLERDE KURUMA VE YANIKLIKLARA NEDEN OLAN FUNGAL ETMENLERİN SAPTANMASI | tr_TR |
| dc.type | masterThesis | tr_TR |
| dc.contributor.department | AYDIN ADNAN MENDERES ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ FİTAPATOLOJİ ANABİLİM DALI | tr_TR |
| Appears in Collections: | Yüksek Lisans | |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| 655253.pdf | 2.87 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.