Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11607/4190
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorKaraca, Orhan-
dc.contributor.authorSevim, Semih-
dc.date.accessioned2021-09-09T13:21:58Z-
dc.date.available2021-09-09T13:21:58Z-
dc.date.issued2020-
dc.date.submitted2020-
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11607/4190-
dc.description.abstractKARACABEY MERİNOSU KUZULARINDA MELANOKORTİN-4 RESEPTÖR (MC4R) GEN POLİMORFİZMİNİN BÜYÜME ÖZELLİKLERİNE ETKİSİ VE SELEKSİYONDA KULLANIM OLANAKLARININ ARAŞTIRILMASI Semih SEVİM Doktora Tezi, Zootekni Anabilim Dalı Tez Danışmanı: Prof.Dr. Orhan KARACA 2020, 85 Sayfa Karacabey Merinosu kuzularında yapılan bu çalışmada, Melanokortin-4 Reseptör (Mc4R) geni bakımından polimorfizmin tanımlanması ve kuzuların büyüme özellikleri bakımından genotipler arası farklılıkların ortaya konması amaçlanmıştır. Bu çalışma Koyunculuk Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü bünyesindeki koyunculuk şubesinde bulunan 300 baş Karacabey Merinosu kuzuda yürütülmüştür. Kuzuların büyüme özelliklerinin genotiplere göre değişimini saptamak üzere doğum ağırlığı, 45., 90. ve 180. gün canlı ağırlıkları, 0-90.gün, 90-180.gün ve 0-180 gün ortalama günlük canlı ağırlık artışları, 90 ve 180. gün vücut ölçümleri ve ultrason ölçümleri yapılmıştır. Mc4R geni, dizi bilgileri temin edildikten sonra tasarlanan primer çiftleri vasıtasıyla Mc4R1 ve Mc4R2 bölgelerine ayrılmış ve sırasıyla 825 ve 590 bç uzunluğundaki bu bölgeler sorunsuz olarak dizilenmiştir. DNA dizilimi çıkartılan bu bölgelerden Mc4R1 bölgesi içerisinde 9.T>C, 12.G>C, 93.G>A ve 381.G>A SNP’leri; Mc4R2 bölgesi içerisinde ise 681.G>C ve 1016.G>A SNP’leri tespit edilmiştir. 9.T>C SNP’inin 90. gün vücut ölçümlerinden sağrı genişliği (p<0.05), 12.G>C SNP’inin 90. gün canlı ağırlığı ve 0-90.gün ortalama günlük canlı ağırlık artışı (p<0.05), 93.G>A SNP’inin 90. gün vücut ölçümlerinden sağrı genişiliği (p<0.05), 381.G>A SNP’inin 90. gün ultrason ölçümlerinden yağ kalınlığı (p<0.01), 681.G>C SNP’sinin 90. gün vücut ölçümlerinden cidago yüksekliği ile but çevresi (p<0.05), 90. gün ultrason ölçümlerinden yağ kalınlığı (p<0.01), 1016.G>A SNP’inin 180. gün canlı ağırlığı (p<0.05), sütten kesim öncesi ortalama günlük canlı ağırlık artışı (p<0.05), sütten kesim sonrası günlük canlı ağırlık artışı (p<0.01), 0-180.gün ortalama günlük canlı ağırlık artışı (p<0.05), 90. gün ultrason ölçümlerinden deri kalınlığı (p<0.05), 180. gün ultrason ölçümlerinden kas derinliği viii (p<0.05) ile ilişkili olduğu bulunmuştur. Sonuç olarak Mc4R geninin koyunlarda büyüme özellikleri için moleküler markör olarak kullanılabileceği düşünülmektedirtr_TR
dc.description.tableofcontentsİÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY SAYFASI.............................................................................. iii BİLİMSEL ETİK BİLDİRİM SAYFASI ................................................................v ÖZET..................................................................................................................... vii ABSTRACT............................................................................................................ix ÖNSÖZ ...................................................................................................................xi KISALTMALAR VE SİMGELER DİZİNİ........................................................ xvii ŞEKİLLER DİZİNİ...............................................................................................xix ÇİZELGELER DİZİNİ .........................................................................................xxi 1. GİRİŞ ...................................................................................................................1 2. KAYNAK ÖZETLERİ ........................................................................................6 2.1. Karacabey Merinosu Irkı...................................................................................6 2.2. Koyun Yetiştiriciliğinde MLD (Musculus Longissimus Dorsi) Kasına ait Ölçümlerin Önemi............................................................................................7 2.3. DNA Temelli Markörler....................................................................................8 2.3.1. Rastgele Çoğaltılmış Polimorfik DNA (RAPDs)...........................................8 2.3.2. Çoğaltılmış Parça Uzunluk Polimorfizmi (AFLPs) .......................................9 2.3.3. Tek Zincirli Konformasyon Polmorfizmi (SSCP) .........................................9 2.3.4. Sınırlandırılmış Parça Uzunluk Polimorfizmi (RFLPs) ...............................10 2.3.5. Mikrosatelitler..............................................................................................10 2.3.6. Tek Nükleotid Polimorfizmi (SNP) .............................................................10 2.4. DNA Dizi Analizi Yöntemleri ........................................................................11 2.4.1. Maxam Gilbert Yöntemi ..............................................................................12 2.4.2. Sanger Yöntemi............................................................................................12 2.5. Mc4R Geninin Yapısı ve İşlevi.......................................................................13 2.6. Koyunlarda MLD kası üzerine yapılan çalışmalar..........................................14 xiv 2.7. Çiftlik Hayvanlarında Mc4R Gen Polimorfizmi ile İlgili Yapılmış Çalışmalar ................................................................................................... 16 2.7.1. Koyunlarda yapılan Çalışmalar................................................................... 16 2.7.2. Farklı Türlerde yapılan çalışmalar............................................................... 17 3. MATERYAL VE YÖNTEM ............................................................................ 20 3.1. Materyal.......................................................................................................... 20 3.2. Yöntem........................................................................................................... 20 3.2.1. Hayvanlara Ait Verim Özelliklerinin Belirlenmesi..................................... 20 3.2.2. Kan Örneklerinin Alınması ve Saklanması ................................................. 23 3.2.3. Kan Örneklerinden DNA İzolasyonu .......................................................... 23 3.2.4. DNA’nın Saflık ve Miktar Ölçümü............................................................. 24 3.2.5. Mc4R Geninin PCR ile Yükseltgenmesi..................................................... 24 3.2.6. Dizi Analizi ................................................................................................. 26 3.2.6.1. PCR ürünlerinin saflaştırılması ................................................................ 26 3.2.6.2. Döngüsel dizileme protokolü (Cycle Sequencing)................................... 26 3.2.7. İstatistik Analiz............................................................................................ 27 4. BULGULAR VE TARTIŞMA.......................................................................... 29 4.1. Genomik DNA İzolasyon Sonuçları............................................................... 29 4.2. Mc4R Gen Bölgesinin PCR ile Çoğaltılması ................................................. 29 4.3. DNA Dizi Analizi Sonuçları .......................................................................... 29 4.4. Dizi Analizi ile Genotipleme Sonuçları ......................................................... 33 4.5. Canlı Ağırlık, Vücut ve Ultrason ölçümleri ................................................... 37 4.5.1. Canlı Ağırlık, Vücut ve Ultrason Ölçümlerine Ait Tanımlayıcı İstatistikler ..................................................................................................................... 37 4.6. Mc4R Gen Polimorfizmi ile Büyüme ve Verim Özellikleri Arasındaki İlişkiler ........................................................................................................ 39 4.6.1. Canlı Ağırlık Kayıtları ile Genotipler Arası İlişkiler................................... 39 xv 4.6.2. 90. Güne Ait Vücut ve Ultrason Ölçümleri ile Genotipler Arası İlişkiler....47 4.6.3. 180. Güne Ait Vücut ve Ultrason Ölçümleri ile Genotipler Arası İlişkiler..51 4.7. Haplotip Blokları ile Verim Özellikleri Arasındaki İlişkiler...........................54 4.7.1. Diplotipler ile Canlı Ağırlıklar Arasındaki İlişki .........................................57 4.7.2. Diplotipler ile 90. Güne Ait Vücut ve Ultrason Ölçümleri Arasındaki İlişki .....................................................................................................................62 4.7.3. Diplotipler ile 180. Güne Ait Vücut ve Ultrason Ölçümleri Arasındaki İlişki .............................................................................................................65 5. SONUÇ ..............................................................................................................68 KAYNAKLAR ......................................................................................................71 ÖZGEÇMİŞ ...........................................................................................................82tr_TR
dc.language.isoturtr_TR
dc.publisherAYDIN ADNAN MENDERES ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜtr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesstr_TR
dc.subjectKaracabey Merinosu, DNA dizi analizi, SNP, Mc4R, Canlı Ağırlık, Vücut Ölçümleritr_TR
dc.titleKARACABEY MERİNOSU KUZULARINDA MELANOKORTİN-4 RESEPTÖR (MC4R) GEN POLİMORFİZMİNİN BÜYÜME ÖZELLİKLERİNE ETKİSİ VE SELEKSİYONDA KULLANIM OLANAKLARININ ARAŞTIRILMASItr_TR
dc.typedoctoralThesistr_TR
dc.contributor.departmentAYDIN ADNAN MENDERES ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ZOOTEKNİ ANABİLİM DALItr_TR
Appears in Collections:Doktora

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
629386.pdf3.1 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.