Please use this identifier to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/11607/3921Full metadata record
| DC Field | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.advisor | Başbülbül, Gamze | - |
| dc.contributor.author | doğan, yunus | - |
| dc.date.accessioned | 2020-09-24T13:00:32Z | - |
| dc.date.available | 2020-09-24T13:00:32Z | - |
| dc.date.issued | 2020-09-24 | - |
| dc.date.submitted | 2020-08-21 | - |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11607/3921 | - |
| dc.description.abstract | Proteinlerin üretimini kolaylaştırmak ve verimini artırmak için rekombinant teknoloji sürekli geliştirilmektedir. Böylece düşük miktarda üretilen proteinlerin üretimleri artırılabilir ve bunun sonucu olarak maliyetleri düşer. Günümüzde rekombinant protein üretimi için sıklıkla kullanılan tekniklerden biri de gösterim tekniğidir. Gösterim tekniği ile füzyon proteinler hedeflenebilir ve hücre veya bakteriofajın dış yüzey proteinlerine eklenir. Gösterim tekniği yeni protein tasarlamada oldukça kullanışlıdır. Hücre içeriğindeki çeşitli proteinler arasından hedeflenen proteini izole etmek karmaşık bir işlemdir. Bu çalışmada gösterim tekniği, sentezlenen hedef protein streptodornazı saflaştırmada kullanılmıştır. Bu amaçla lpp, ompA ve spd1 genleri için primerler dizayn edilmiş, çoğaltılıp birleştirilen bu genler plazmide aktarılmış ve füzyon protein halinde E. coli’de sentezi sağlanmıştır. Ardından E. coli membranı izole edilmiş ve enterokinaz kesimi ile Spd1 enzimi membrandan ayrılmıştır. Membran proteinleri santrifüjle uzaklaştırıldıktan sonra Spd1 enziminin saflaştırıldığı SDS-PAGE yöntemiyle doğrulanmıştır. Sonuç olarak klinikte kullanım alanı bulunan streptodornaz enziminin bakteri gösterim tekniği ile saflaştırılması ve bu amaçla rekombinant olarak üretilmesi, diğer klasik saflaştırma prosedürlerine kıyasla oldukça hızlı ve düşük maliyette gerçekleştirilmiştir. Tez çalışmamız kapsamında laboratuvarımızda geliştirilen bu yöntem, diğer pek çok hidrofilik, rekombinant protein için de kullanışlı olacaktır. | tr_TR |
| dc.description.sponsorship | Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından FEF-19022 proje numarası ile desteklenmiştir. | tr_TR |
| dc.description.tableofcontents | KABUL VE ONAY SAYFASI ................................................................................................... i TEŞEKKÜR ............................................................................................................................... ii İÇİNDEKİLER ..........................................................................................................................iii SİMGELER DİZİNİ ................................................................................................................... v ŞEKİLLER DİZİNİ ................................................................................................................... vi RESİMLER DİZİNİ ................................................................................................................. vii TABLOLAR DİZİNİ ...............................................................................................................viii ÖZET ......................................................................................................................................... ix ABSTRACT ............................................................................................................................... x 1. GİRİŞ ..................................................................................................................................... 1 2. GENEL BİLGİLER ............................................................................................................... 1 2.1. Gösterim Tekniği ................................................................................................................. 1 2.2. Bakteriyel Gösterimin Kullanım Alanları ........................................................................... 5 2.3. Gösterim Vektörününde Kullanılacak Proteinler ................................................................ 7 2.3.1. Lipoprotein ........................................................................................................................ 7 2.3.2. Dış Membran Proteini A (OmpA)..................................................................................... 7 2.3.3. Streptodornaz .................................................................................................................... 9 3. GEREÇ VE YÖNTEM ........................................................................................................ 11 3.1. Gereç.................................................................................................................................. 11 3.1.1. Bakteri Suşları ................................................................................................................. 11 3.1.2. Kullanılan Plazmidler...................................................................................................... 12 3.1.3. Kullanılan Besiyerleri Ve Çözeltiler ............................................................................... 12 3.2. Yöntem .............................................................................................................................. 14 3.2.1. Primer Tasarımı ............................................................................................................... 14 3.2.2. Lpp, OmpA ve Spd1 Gen Dizilerinin PCR ile Çoğaltılması ........................................... 17 3.2.3. Lpp-OmpA Gen Dizilerinin Füzyonu ve Gösterim Vektörünün Oluşturulması ............. 18 3.2.4. Gösterim Vektörünün Transformasyonu......................................................................... 20 3.2.5. Spd1 Gen Dizisinin Gösterim Vektörüne Klonlanması .................................................. 20 3.2.6. Spd1 Enziminin Aktivitesinin Belirlenmesi ................................................................... 21 3.2.7. Spd1 Enziminin Hasadı ................................................................................................... 21 4. BULGULAR ........................................................................................................................ 23 iv 5. TARTIŞMA ......................................................................................................................... 31 6. SONUÇ ve ÖNERİLER ...................................................................................................... 34 KAYNAKLAR ......................................................................................................................... 35 ÖZGEÇMİŞ .............................................................................................................................. 39 | tr_TR |
| dc.language.iso | tur | tr_TR |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | tr_TR |
| dc.subject | Bakteri gösterimi, Lpp-OmpA, streptodornaz | tr_TR |
| dc.title | BAKTERİ YÜZEY GÖSTERİM TEKNİĞİ İLE REKOMBİNANT NÜKLEAZ ENZİMİNİN SAFLAŞTIRILMASI | tr_TR |
| dc.title.alternative | NUCLEASE ENZYME PURIFICATION BY BACTERIAL SURFACE DISPLAY TECHNIQUE | tr_TR |
| dc.type | masterThesis | tr_TR |
| dc.contributor.authorID | 0000-0002-9587-8400 | tr_TR |
| dc.contributor.department | Aydın Adnan Menderes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoteknoloji Anabilim Dalı (Disiplinlerarası), Moleküler Biyoteknoloji | tr_TR |
| Appears in Collections: | Yüksek Lisans | |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| YUNUS tez.pdf | Tez Dosyası | 1.8 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.