Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11607/3779
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorDönmez Yalçın, Gizem-
dc.contributor.authorÇolak, Merve-
dc.date.accessioned2020-07-09T08:01:22Z-
dc.date.available2020-07-09T08:01:22Z-
dc.date.issued2020-
dc.date.submitted2020-01-17-
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11607/3779-
dc.description.abstractHÜCRE MODELİNDE SIRT4 (SİRTUİN4)’ÜN EKSİTOTOKSİSİTEYE KARŞI KORUYUCU ETKİSİNİN ARAŞTIRILMASI Çolak M. Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tıbbi Biyoloji Programı, Yüksek Lisans Tezi, Aydın, 2020. Glutamat, merkezi sinir sisteminde birçok nörolojik işleve sahiptir ve beyinde yüksek konsantrasyonlarda bulunur. Sinir terminallerinde glutamat, yoğun olarak bulunur ve hücre içindeki konsantrasyonu dışındaki konsantrasyona göre çok daha fazladır. Sinir hücre membranının depolarizasyonu ile kalsiyuma bağlı bir süreçte presinaptik sinir uçlarındaki veziküllerden hücreler arası boşluğa glutamat salınır ve postsinaptik nörondaki glutamat reseptörleri uyarılır. Glial hücrelerde yer alan glutamat taşıyıcılarının hücreler arası boşluktan glutamatı toplanmasıyla uyarım bitirilir. Glutamat seviyesinin nöronal boşlukta artışı toksiktir, nöron hasarı ve ölümüne neden olur. Bu durum, glutamata bağlı eksitotoksisite olarak adlandırılır. Eksitotoksisite, travma, serebral iskemi, epilepsi, Parkinson Hastalığı, Alzheimer Hastalığı gibi birçok nörolojik hastalığın altındaki sebeplerdendir. Kainik asit, glutamat analogudur, nörotoksisite oluşturulması için kullanılan kimyasal bir modeldir. Sessiz bilgi düzenleyicisi (Sir) protein ailesinin ilk üyesi olan Sir2’nin homologları sirtüinler olarak adlandırılır. Memelilerde yedi tane sirtüin (Sirt1-7) bulunur. Sirt4, deasetilaz ve ADP-ribosilaz etkinliği gösteren ve mitokondride bulunan memeli sirtüinidir. Sirt4, GDH’ı aracı olarak kullanarak glutamin metabolizmasını düzenler. Bundan dolayı, Sirt4'ün nöronal uyarılar ve eksitotoksisite sırasında artan glutamat seviyesine cevabı düzenleyeceği düşünülmektedir. Bu çalışmada, N2A hücreleri 10 µM, 50 µM, 200 µM ve 1000 µM’lık kainik asit konsantrasyonlarıyla muamele edildi. Ardından, hücrelerin canlılık seviyeleri MTT testi ile değerlendirildi. 200 µM ve 1000 µM’lık kainik asit konsantrasyonlarında hücre canlılık seviyesinde anlamlı düşüş olduğu belirlendi. Takip eden deneylerde 1000 µM’lık kainik asit konsantrasyonunun kullanılmasına karar verildi. N2A hücrelerinde transfeksiyon yöntemi ile Sirt4 ifadesi arttırıldı ve ifade artışı western blot yöntemi ile gösterildi. Sirt4 ifadesi arttırılmamış (kontrol) ve Sirt4 ifadesi arttırılmış (transfekte edilmiş) N2A hücre grupları 1000 µM konsantrasyonda kainik asit ile muamele edildi. Muamele sonrasında, kontrol N2A, kainik asit muamelesi yapılmış N2A, yalnızca Sirt4 ifadesi arttırılmış ve kainik asit muamelesi yapılmış ve Sirt4 ifadesi arttırılmış olmak üzere dört farklı N2A hücre grubu elde edildi. Bu hücre gruplarındaki canlılık seviyesi MTT testi ile ölçüldü. Kontrol N2A ile kainik asit muamelesi yapılmış N2A grupları arasında yapılan kıyaslamada, kainik asit muamelesi sonucu hücrelerin canlılık seviyelerinde anlamlı bir düşüş gözlendi. Sirt4 ifadesinin arttırılmasının ise hücre canlılığındaki düşüşü azalttığı gözlendi. Ayrıca, bu dört farklı deney grubunda glutamat salınımı 0, 12, 24, 48 saatlik süre için ölçüldü. Kainik asit muamelesi yapılmış ve Sirt4 ifadesi arttırılmış deney grubunda, yalnızca kainik asit ile muamele edilmiş deney grubuna kıyasla, hücre ölümünün daha az olduğu, bu nedenle daha fazla glutamat salınımı yapıldığı gösterildi. Dolayısıyla, Sirt4’ün eksitotoksisiteyi engelleyerek hücre ölümünü azaltabileceği gösterildi.tr_TR
dc.description.sponsorshipTÜBİTAktr_TR
dc.description.tableofcontentsKABUL VE ONAY SAYFASI i TEŞEKKÜR ii İÇİNDEKİLER iii SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ vi ŞEKİLLER DİZİNİ ix TABLOLAR DİZİNİ xi ÖZET xii ABSTRACT xiv 1.GİRİŞ 1 2.GENEL BİLGİLER 4 2.1.Glutamat 4 2.2.Glutamat Döngüsü 4 2.3.Glutamata Bağlı Eksitotoksisite 6 2.4.Glutamat Reseptörleri 7 2.4.1.Metabotropik reseptörler 7 2.4.2.İyonotropik reseptörler 9 2.4.2.1.NMDA reseptörleri 9 2.4.2.2.AMPA reseptörleri 10 2.4.2.3.Kainat reseptörleri 10 2.5.Glutamat Taşıyıcıları 11 2.5.1.Eksitatör amino asit taşıyıcıları (EAAT'ler) 11 2.6.Eksitotoksisite İçin Terapötik Stratejiler 15 2.6.1.NMDAR’lerin hedeflenmesi 15 2.6.2.EAAT2 (GLT-1)'in hedeflenmesi 15 2.7.Mitokondri, Endoplazmik Retikulum ve Lizozomda Eksitotoksiteye Bağlı Olarak Görülen Değişimler 16 2.7.1.Eksitotoksisite ve mitokondri 16 2.7.2.Eksitotoksisite’nin ER ve lizozom ile ilişkisi 17 2.8.Epilepsi 18 2.8.1.Status epileptikus 19 2.9.Kainik Asit 20 2.9.1.Kainik asitin nörodejeneratif etki mekanizması 21 2.9.2.Kainik asit modelinin olumlu ve olumsuz özellikleri 23 2.10.Sirtüinler 23 2.10.1.Sirtüinlerin enzim aktiviteleri 24 2.10.2.Memeli sirtüinleri 26 2.10.3.Sirt4 29 2.11.N2A Hücre Hattı ve Nöroblastomanın Tanımlanması 33 3.GEREÇ VE YÖNTEM 34 3.1.Gereç 34 3.1.1.Cihazlar 34 3.1.2.Kullanılan kimyasal maddeler 34 3.1.3.Deney düzeneğinin hazırlanması 35 3.2.Yöntem 36 3.2.1.Hücre kültürü uygulamaları 36 3.2.1.1.Besiyeri hazırlama 36 3.2.1.2.Hücre çözme 36 3.2.1.3.Hücre besiyerlerinin değiştirilmesi 37 3.2.1.4.Hücrelerin pasajlanması 37 3.2.1.5.Dondurma besiyerinin hazırlanması 38 3.2.1.6.Hücrelerin dondurulması 38 3.2.1.7.Hücrelerin sayılması ve hücre canlılığı 39 3.2.1.8.Kainik asitin konsantre edilmesi ve uygulama için kullanılacak dozların hazırlanışı 39 3.2.1.9.MTT (metiltiazol difenil tetrazolyum) assay testi ve testte uygulanacak kainik asit dozlarının belirlenmesi 39 3.2.2.LB besiyerinin hazırlanması, Sirt4 bakteri plazmidinin ekilmesi ve dondurulması 41 3.2.3.Sirt4 plazmid izolasyonu 42 3.2.4.N2A hücrelerinin sirt4 plazmidi ile tranfeksiyonu 43 3.2.5.Sirt4 transfeksiyonu sonrasında N2A hücre hattına yapılan mtt canlılık testi 44 3.2.6.RIPA lizis tamponu kullanılarak protein izolasyonu 45 3.2.7.Bradford assay ile protein miktarının tayin edilmesi 46 3.2.8.Western blot 48 3.2.8.1.Tampon çözeltilerin hazırlanması 48 3.2.8.2.Örneklerin hazırlanması, jele yüklenmesi, jel elektroforezi 49 3.2.8.3.Jelden membrana transfer, bloklama, blotlama ve görüntüleme 50 3.2.9.Glutamat assay 51 3.3.İstatistik 54 4.BULGULAR 55 4.1.Kainik Asit Uygulanan N2A Hücrelerinde MTT Test Sonuçlarının Değerlendirilmesi 55 4.2.Transfeksiyonun Teyit Edilmesi İçin Sirt4 Protein İfadesinin Western Blot İle Tespiti 56 4.2.1.Western blot deneyinde görüntülenen bantların image j programı kullanılarak hesaplanması 57 4.3.Sirt4 Transfeksiyonu Sonrasında N2A Hücre Hattında Yapılan MTT Canlılık Testinin Sonuçlarının Değerlendirilmesi 58 4.4.Sirt4 ile Transfekte edilen N2A Hücre Hattının Kainik Asit Muamelesini Takiben Yapılan Glutamat Assay Sonuçlarının Değerlendirilmesi 60 5.TARTIŞMA 62 6.SONUÇ VE ÖNERİLER 64 KAYNAKLAR 66 ÖZGEÇMİŞ 72tr_TR
dc.language.isoturtr_TR
dc.publisherAydın Adnan Menderes Üniveristesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsütr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccesstr_TR
dc.subjectEksitotoksisite, glutamat, kainik asit, sirtüin, Sirt4.tr_TR
dc.titleHücre Modelinde SIRT4 (Sirtuin4)'ün Eksitotoksisiteye Karşı Koruyucu Etkisinin Araştırılmasıtr_TR
dc.typemasterThesistr_TR
dc.contributor.departmentAydın Adnan Menderes Üniversitesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalıtr_TR
Appears in Collections:Yüksek Lisans

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Merve Çolak Tıbbi Biyoloji YL Tez Baskı Hali.pdfTez Dosyası2.26 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.