Please use this identifier to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/11607/3612Full metadata record
| DC Field | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.advisor | Çevik, Özge | - |
| dc.contributor.author | Akarçay, Merve | - |
| dc.date.accessioned | 2019-09-03T11:33:49Z | - |
| dc.date.available | 2019-09-03T11:33:49Z | - |
| dc.date.issued | 2019 | - |
| dc.date.submitted | 2019-07-10 | - |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11607/3612 | - |
| dc.description.abstract | IRF5 TRANSKRİPSİYON FAKTÖRÜ ve SOX2 KÖK HÜCRE FAKTÖRÜ İLİŞKİSİNİN PROSTAT KANSERİ HÜCRELERİNDE BELİRLENMESİ Akarçay M. Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Biyokimya (Tıp) Programı Yüksek Lisans Tezi, Aydın, 2019. İnterferon Düzenleyici Faktör (IRF) ailesi interferonların bağışıklık sisteminin düzenlenmesini sağlayan transkripsiyon faktörleridir. İnterferon Düzenleyici Faktör 5 (IRF5) bu ailenin bir üyesi olup çeşitli hastalıklarda bulunan görevleri ile ilgili çalışmalar son yıllarda artmaktadır. SOX2, embriyonik kök hücre faktörü olarak bilinmektedir. Bu kök hücre faktörü hücrelerin farklılaşmasının yanında kanserin oluşum ve gelişiminde oldukça önemlidir. Bu tez çalışmasında bir transkripsiyon faktörü olan IRF5 ve bir kök hücre faktörü olan SOX2’ nin prostat kanserindeki rolleri ve protein-protein ilişkisi araştırılmıştır. PC3 insan prostat kanseri hücre kültürü yapılarak, pIRF5 ve pSOX2 plazmidleri kullanılarak IRF5 ve SOX2 proteinleri overekspresyon deneyleri yapılmıştır. Overekspresyon yapılan örneklerde immunopresipitasyon (IP) yapılarak proteinler western blot ile değerlendirilmiştir. IRF5 ve SOX2 overekspresyon yapılan PC3 hücrelerinde migrasyon düzeyleri scratch yöntemi ile incelenmiştir. Prostat kanser hücrelerinde IRF5 ve SOX2 proteinlerinin birbirleri ile ilişkisi IP deneylerinde protein bantları ile gösterilmiştir. Prostat kanseri hücrelerinde IRF5’ in hücre migrasyonunu anlamlı derecede azalttığı, SOX2’ nin hücre migrasyonunu anlamlı derecede arttırdığı tespit edilmiştir. Sonuç olarak, IRF5 ve SOX2 proteinleri birbirleri ile etkileşimde bulunan iki transkripsiyon faktörü olup prostat kanser tedavisi için yeni sinyal yolaklarının ve çeşitli ilaç moleküllerinin gelişiminde önemli katkılar sağlayabilir. Anahtar Kelimeler: CD133, CD44, Kanser İmmünolojisi, Kök Hücre Faktörleri, Prostat Kanseri | tr_TR |
| dc.description.tableofcontents | KABUL VE ONAY SAYFASI i TEŞEKKÜR ii SİMGELER ve KISALTMALAR DİZİNİ vii ŞEKİLLER DİZİNİ x RESİMLER DİZİNİ xii TABLOLAR DİZİNİ xiii ÖZET xiv ABSTRACT xv 1. GİRİŞ 1 2. GENEL BİLGİLER 3 2.1. Kanser ve Kanserin Moleküler Genetiği 3 2.1.1. Kanser Metabolizması 4 2.2. Prostat Kanseri 6 2.2.1. Prostat Kanseri Patogenezi 8 2.2.2. Prostat Kanseri Epidemiyolojisi 9 2.2.3. Prostat Kanseri Risk Faktörleri 10 2.2.3.1. Yaş 10 2.2.3.2. Ailesel geçmiş 10 2.2.3.3. İnsülin benzeri büyüme faktörleri 10 2.2.3.4. Obezite 11 2.2.3.5. Diğer faktörler 12 2.2.4. Prostat Kanserinde Androjen Reseptörü(AR) 12 2.2.4.1. AR ifadesinin ve spesifik hücresel fonksiyon düzenlenmesi 13 2.3. Prostat Bezi 14 2.4. Prostat Spesifik Antijen 15 2.5. İnterferonlar 16 2.5.1. İnterferonlarda Sinyal İletimi 17 2.5.2. İnterferon Tipleri 18 2.5.2.1. Alfa interferonlar 19 2.5.2.2. Beta interferonlar 19 2.5.2.3. Gama interferonlar 19 2.5.2.4. İnterferon etkileri 21 2.5.2.5. İnterferon etkisinin moleküler ve fizyolojik temeli 22 2.5.3. İnterferona Maruz Kalan Hücrelerdeki Biyokimyasal Değişiklikler 22 2.6. İnteferon Düzenleyici Faktörler 22 2.6.1. IRF5 25 2.7. Transkripsiyon Faktörleri 26 2.7.1. c-Myc 28 2.7.2. OCT4 28 2.7.3. Klf4 (Krüppel-Like Factor 4) 29 2.7.4. Nanog 29 2.7.5. SOX Ailesinin Keşfi 30 2.7.5.1. SOX2 32 2.7.5.2. Kanserde SOX2 düzensizliği 33 2.7.5.3. İmplantasyon öncesi gelişim ve pluripotenside SOX2 34 2.7.5.4. Fetal gelişimde SOX2 35 2.7.5.5. SOX protein ifadesinin ve aktivitesinin düzenlenmesi 36 2.7.5.6. Kök hücre biyolojsinde diğer SOX faktörlerinin katılımı 36 2.7.5.7. Hücresel yeniden programlamada SOX faktörleri 36 2.8. Transkripsiyon Faktörlerinin Yapısı 37 2.9. Transkripsiyon Faktörlerinin Birbirleriyle İlişkisi 38 2.10. Transkripsiyon Aktivasyonu 39 2.10.1. Transkripsiyon Faktörleri Düzenleme 39 2.10.1.1. Transkripsiyon sentezi düzenleme 40 2.10.1.2. Transkripsiyon faktör aktivitesinin düzenlenmesi 40 2.10.2. Transkripsiyon Faktörü ve Kanser 40 2.11. Kök Hücre 41 2.11.1. Kök Hücre Tipleri 43 2.11.1.1. Embriyonik kök hücreler 43 2.11.1.1.1. Totipotent kök hücre 44 2.11.1.1.2. Pluripotent kök hücreler 44 2.11.1.1.3. İndüklenmiş pluripotent kök hücre 45 2.11.1.1.4. Multipotent kök hücre 46 2.11.1.2. Embriyonik olmayan kök hücreler 46 2.11.1.3. Organlardaki kök hücreler 47 2.11.1.3.1. Adiposit kök hücre 47 2.11.1.3.2. Nöronal kök hücre 48 2.11.1.3.3. Epidermal kök hücre 48 2.11.1.3.4. Dental pulpa kök hücresi 48 2.11.1.3.5. Kanser kök hücreleri 48 3. GEREÇ ve YÖNTEM 52 3.1. Kullanılan Malzemeler 52 3.2. Kullanılan Cihazlar 52 3.3. Hücre Kültürü 53 3.3.1. Hücrelerin Büyütülüp Çoğaltılması 53 3.3.2. Hücrelerin Pasajlanması 53 3.3.3. Hücrelerin Dondurulması ve Çözdürülmesi 54 3.3.4. Hücre Sayımı 54 3.4. Pırf5 Ve Psox2 Plazmitlerinin Çoğaltılması ve İzolasyonu 55 3.4.1. Elektroporasyon 56 3.4.1.1. Bakteri kültürlerinin, araçlarının ve reaktiflerinin hazırlanması 56 3.4.1.2. Elektrocompetent bakterilerin büyümesi 57 3.4.1.3. Elektrocompetent bakteriyel hücrelerin hazırlanması 57 3.4.1.4. Elektrocompetent bakterilerin transformasyonu 57 3.4.2. Plazmid İzolasyonu 58 3.4.3. Plazmidlerin Saflık ve Miktar Tayini 60 3.5. IRF5 ve SOX2 İçin Transfeksiyonu 60 3.6. IRF5 ve SOX2 Overekspresyonunun Migrasyon Üzerine Etkisi 60 3.7. BCA Protein Tayini 61 3.8. Hücrelerde Yapılan Western Blot Çalışmaları 62 3.8.1. SDS PAGE/Western Blot 62 3.8.2. Western Blot Aşamasında Hazırlanan Çözeltiler: 63 3.9. Immünopresipitasyon (IP) Deneyleri 65 3.10. CD133/CD44 Bağlanma Deneyleri 67 3.11. İstatistiksel Analiz 68 4. BULGULAR 69 4.1. Plazmidlerin Çoğaltılması ve Klonların Seçimi 69 4.2. Plazmit izolasyonu Sonrasında Agaroz Jel Elektroforezi 69 4.3. Plazmitlerin Protein İfadesi Kontrolü 70 4.4. Overekspresyon Yapılan Proteinlerin Western Blot Analizleri 70 4.5. SOX2’nin Hücre Migrasyonu Üzerine Etkisi 72 4.6. IRF5 İle SOX2 Protein Etkileşimleri Sonuçları 73 5. TARTIŞMA 77 6. SONUÇ ve ÖNERİLER 84 KAYNAKLAR 85 ÖZGEÇMİŞ 108 | tr_TR |
| dc.language.iso | tur | tr_TR |
| dc.publisher | Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü | tr_TR |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | tr_TR |
| dc.title | IRF5 Transkripsiyon Faktörü ve SOX2 Kök Hücre Faktörü İlişkisinin Prostat Kanser Hücrelerinde Belirlenmesi | tr_TR |
| dc.type | masterThesis | tr_TR |
| dc.contributor.department | Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tıbbi Biyokimya Bölümü | tr_TR |
| Appears in Collections: | Yüksek Lisans | |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| merve akarçay.docx | Tez dosyası | 8.07 MB | Microsoft Word XML | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.