Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11607/3566
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorKaragenç, Levent-
dc.contributor.authorDoğan, Göksel-
dc.date.accessioned2019-07-22T12:25:17Z-
dc.date.available2019-07-22T12:25:17Z-
dc.date.issued2019-
dc.date.submitted2019-06-21-
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11607/3566-
dc.description.abstractÖZET FARELERDE IN VITRO EMBRİYO KÜLTÜRÜ VE EMBRİYO TRANSFERİNİN FÖTAL AKCİĞER DOKUSUNDA NOTCH SİNYAL YOLAĞI HEDEF GENLERİNDEN HEY1 VE SKP2 GENLERİNİN EKSPRESYONU ÜZERİNE ETKİSİ Doğan G. Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü HistolojiEmbriyoloji Doktora Programı (Veteriner) Doktora Tezi, Aydın, 2019. Sunulan tez çalışmasında, in vitro embriyo kültürü ve embriyo transferi işlemlerinin fötal (E18.5) akciğer dokusunda Notch sinyal yolağı hedef genlerinden Hey1 ve Skp2 genlerinin ekspresyonu üzerine herhangi bir etkisinin olup olmadığının incelenmesi amaçlanmıştır. Çalışmada bir Kontrol grubu ve bir Deneme grubuna yer verilmiştir. Kontrol grubunu oluşturan fötal akciğer doku örnekleri, PMSG+hCG uygulaması yapılmamış olan dişilerin, aynı yaştaki erkeklerle çiftleştirilmelerinden elde edilen fötuslardan; Deneme grubunu oluşturan fötal akciğer doku örnekleri ise PMSG+hCG uygulamasını takiben çiftleştirilen dişilerden elde edilen döllenmiş yumurta hücrelerinin (zigot) atmosferik oksijen konsantrasyonunda büyütülmesiyle elde edilen blastosistlerin yalancı gebelere transferi sonucunda elde edilen fötuslardan izole edilmiştir. Akciğer dokularında, Hey1 ve Skp2 proteinlerinin ekspresyonlarını belirlemek amacıyla immunohistokimya/immunofloresan boyama teknikleri uygulanmıştır. Hey1 ve Skp2 genlerinin transkripsiyonel ve translasyonel düzeylerde ekspresyonlarının belirlenmesinde kantitatif real-time PCR (qRT-PCR) ve western blot yöntemlerinden yararlanılmıştır. İmmunohistokimya/immunofloresan boyama sonuçları, Kontrol ve Deneme gruplarına ait akciğer dokularında Hey1 ve Skp2 proteinlerinin benzer bir ekspresyon profiline sahip olduklarını göstermiştir. Birleştirilmiş total RNA örneklerinde TaqMan probları kullanılarak gerçekleştirilen qRT-PCR analizlerinden elde edilen sonuçlar, Kontrol grubu ile kıyaslandığında, Deneme grubunda Hey1 mRNA ekspresyonunun 3,30 kat azaldığını; Skp2 mRNA ekspresyonunun ise 8,53 kat arttığını göstermiştir. Aynı örneklerde, SYBR Green metodu ile gerçekleştirilen qRT-PCR analizleri, Hey1 mRNA ekspresyonunun 4,39 kat azaldığını; Skp2 mRNA ekspresyonunun ise 10,57 kat arttığını göstermiştir. Ayrıca, SYBR green qRT-PCR yöntemi ile bireysel örneklerde yapılan analizler, Kontrol grubu ile kıyaslandığında Deneme grubunda Hey1 mRNA ekspresyonunun 3,88 kat azaldığını; Skp2 mRNA ekspresyonunun ise 7,57 kat arttığını göstermiştir. Western blot analizleri, Kontrol xii grubu ile kıyaslandığında, Deneme grubunda Skp2 proteininin ekspresyon düzeyinin 2,34 kat arttığını; istatistiksel olarak anlamlı olmamakla birlikte Hey1 proteininin 1,17 kat azaldığını göstermiştir. Elde edilen veriler, Hey1 ve Skp2’nin farelerde fötal akciğer dokusunda belirli hücreler tarafından eksprese edildiğini göstermekte olup, in vitro embriyo kültürü ve embriyo transferi işlemlerinin Hey1 ve Skp2’nin transkripsiyonel/translasyonel ekspresyonlarını değiştirerek fötal akciğer dokusunun gelişimini etkiliyebileceğini düşündürmektedir.tr_TR
dc.description.tableofcontentsİÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY SAYFASI...................................................................................................i TEŞEKKÜR ...............................................................................................................................ii İÇİNDEKİLER..........................................................................................................................iii SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ...............................................................................v ŞEKİLLER DİZİNİ..................................................................................................................vii TABLOLAR DİZİNİ..................................................................................................................x ÖZET.........................................................................................................................................xi ABSTRACT ............................................................................................................................xiii 1. GİRİŞ......................................................................................................................................1 2. GENEL BİLGİLER................................................................................................................3 2.1. Farelerde Akciğer Gelişimi .................................................................................................3 2.2. Farelerde Akciğer Dokusunun Gelişim Aşamaları..............................................................5 2.2.1. Psödoglandüler Evre.........................................................................................................6 2.2.2. Kanaliküler Evre…………………………………………………………..…………….9 2.2.3. Sakküler Evre (terminal kese evresi)................................................................................9 2.2.4. Alveolar Evre..................................................................................................................10 2.3. Akciğer Gelişiminde Notch Sinyal Yolağı........................................................................11 2.3.1. Notch Sinyal Yolağı .......................................................................................................11 2.3.2. Proksimal Akciğerde Notch Sinyal Yolağı’nın Rolü .....................................................13 2.3.3. Alveolar Gelişimde Notch Sinyal Yolağının Rolü.........................................................15 2.4. Notch Sinyal Yolağı Hedef Genleri...................................................................................17 2.4.1. Notch Sinyal Yolağı Hedef Genlerinden Hey1 ..............................................................19 2.4.2. Notch Sinyal Yolağı Hedef Genlerinden Skp2...............................................................21 2.5. Üremeye Yardımcı Tedavi (ÜYTE) Yöntemleri...............................................................24 2.6. ÜYTE Yöntemlerinin Uygulanmasına Bağlı Olarak Ortaya Çıkan Sağlık Sorunları.......25 3. GEREÇ VE YÖNTEM.........................................................................................................29 3.1. Gereç..................................................................................................................................29 3.1.1. Çalışma Materyali ..........................................................................................................29 3.2. Yöntem ..............................................................................................................................31 iv 3.2.1. Hematoksilen-Eozin Boyama Metodu............................................................................31 3.2.2. İmmunohistokimyasal Boyama Metodu.........................................................................31 3.2.3. İmmunofloresan Boyama Metodu..................................................................................32 3.2.4. Western Blot Metodu .....................................................................................................33 3.2.5. Total RNA İzolasyonu....................................................................................................37 3.2.6. Real-Time PCR (qRT-PCR)...........................................................................................37 3.2.6.1. cDNA (komplementer DNA) sentezi…………...……………………………………37 3.2.6.2. TaqMan metodu ile kantitatif real-time PCR (qRT-PCR) analizi………………...…39 3.2.6.3. SYBR green metodu ile kantitatif real-time PCR (qRT-PCR) analizi………………41 3.2.7. İstatistiksel analizler…………………………………………………………………....43 4. BULGULAR……………………………………………………………………...………..44 4.1. Fötal Akciğer Dokusunun Genel Histolojik Yapısı...........................................................44 4.2. Fötal Akciğer Doku Örneklerinde İmmunohistokimya ve İmmunofloresan Boyama Yöntemiyle Hey1 ve Skp2 Ekspresyonunun Belirlenmesi.................................45 4.3. Fötal Akciğer Doku Örneklerinde Western Blot Tekniğiyle Hey1 ve Skp2 Ekspresyonlarının Belirlenmesi ................................................................49 4.4. Fötal Akciğer Doku Örneklerinden İzole Edilen Total RNA Örneklerinin Kalitesi.........52 4.5. Fötal Akciğer Doku Örneklerinde Real-Time PCR Tekniğiyle Hey1 ve Skp2 Ekspresyonlarının Belirlenmesi ................................................................54 4.6. Bireysel Fötal Akciğer Doku Örneklerinde Hey1 ve Skp2 Ekspresyonlarının Belirlenmesi.........................................................................................64 5. TARTIŞMA..........................................................................................................................67 6. SONUÇLAR VE ÖNERİLER .............................................................................................78 KAYNAKLAR.........................................................................................................................79 EKLER ...................................................................................................................................102 Ek 1. ÜYTE alanında sağlanan teknolojik ilerlemenin kronolojik bir tarihçesi ....................102 Ek 2. Üremeye yardımcı tedavi (ÜYTE) yöntemleri ve tanımları .........................................106 Ek 3. Araştırmada kullanılan solüsyon ve kimyasallar ..........................................................107 Ek 4. Western Blot yönteminde kullanılan solüsyonlar ve Western Blot tekniği..................108 Ek 5. c-DNA Sentezi ve materyalleri .....................................................................................113 Ek 6. RT- PCR solüsyonları ve materyalleri ..........................................................................115 Ek 7. Etik Kurul Raporu.........................................................................................................117 ÖZGEÇMİŞ............................................................................................................................119tr_TR
dc.language.isoturtr_TR
dc.publisherAdnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Histoloji ve Embriyoloji (Veteriner) Anabilim Dalı Doktora Programıtr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccesstr_TR
dc.subjectFare fötal akciğer dokusu, Hey1, in vitro embriyo kültürü ve embriyo transferi, Notch sinyal yolağı, Skp2.tr_TR
dc.titleFARELERDE IN VITRO EMBRİYO KÜLTÜRÜ VE EMBRİYO TRANSFERİNİN FÖTAL AKCİĞER DOKUSUNDA NOTCH SİNYAL YOLAĞI HEDEF GENLERİNDEN HEY1 VE SKP2 GENLERİNİN EKSPRESYONU ÜZERİNE ETKİSİtr_TR
dc.typedoctoralThesistr_TR
dc.contributor.departmentAdnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Histoloji ve Embriyoloji (Veteriner) Anabilim Dalı Doktora Programıtr_TR
Appears in Collections:Doktora

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Göksel Doktora Tezİ yazımı- Son-21.06.2019-son basılan-dönüştürüldü.pdf2.84 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.