Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11607/3554
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorKırkan, Prof. Dr. Şükrü-
dc.contributor.authorYüksel, Hafize Tuğba-
dc.date.accessioned2019-07-08T08:31:57Z-
dc.date.available2019-07-08T08:31:57Z-
dc.date.issued2019-06-17-
dc.date.submitted2019-06-17-
dc.identifier.citationYüksel H.T.KEDİ VE KÖPEKLERDE HEMOTROPİK MİKOPLAZMA TÜRLERİNİN MOLEKÜLER KARAKTERİZASYONLARININ ARAŞTIRILMASI. Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Mikrobiyoloji Programı Doktora Tezi, Aydın, 2019.tr_TR
dc.identifier.uri10263164-
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11607/3554-
dc.description.abstractHemotropik mikoplazmalar, kültürleri yapılamayan, eritrosit tropizmi gösteren ve infekte konakçılarda değişen derecelerde hemolitik anemiye neden olan bakterilerdir. Hemotropik mikoplazma türlerinin klasik yöntemlerle identifikasyonları yapılamadığından dolayı moleküler yöntemlerle teşhisleri yapılmaktadır. Araştırmamızda kedi ve köpeklerde hemotropik mikoplazma varlığının ve karakterizasyonlarının moleküler teknikler kullanılarak yapılması amaçlanmıştır. Araştırmamızda kedi ve köpeklerden alınan 100’er tane tam kan örneklerinde hemotropik mikoplazma etkenlerinin varlığı PCR ile incelenmiştir. Köpek örneklerinin 66 (% 66)’sında hemotropik Mycoplasma sp. varlığı ortaya çıkarılırken, kedi örneklerinde ise hemotropik Mycoplasma sp. varlığına rastlanmamıştır. Köpek hemotropik Mycoplasma sp. izolatlarının Sanger sekans ile yapılan tiplendirmeleri sonucunda, 66 örneğin 6 (% 9,0)’sı Mycoplasma haemocanis; 5 (% 7,6)’i Candidatus Mycoplasma hematoparvum; 1 (% 1,5)’i Candidatus Mycoplasma haemominutum; 34 (%51,5)’ü Mycoplasma wenyonii olarak tiplendirilmiş ve 20 (% 30,4) örnekte ise tiplendirme yapılamamıştır. Sekans sonucu Mycoplasma haemocanis identifiye edilen hayvanların 5 (% 83,0)’inde, Candidatus Mycoplasma haematoparvum identifiye edilen hayvanların 3 (% 60,0)’ünde, Mycoplasma wenyonii identifiye edilen hayvanların 20 (% 59,0)’sinde anemi tablosu bulunduğu tespit edirken, 18 adet M. wenyonii izolatı saptandığı hayvanlarda (% 27,2) ise anemi tablosu olmadığı belirlenmiştir. Araştırmamızın sonucunda, anemili/anemisiz köpek tam kan örneklerinde hemotropik mikoplazma türlerinin varlığı ve tiplendirmeleri moleküler yöntemler kullanılarak yapılmıştır.tr_TR
dc.description.sponsorshipAydın Adnan Menderes Üniversitesi Öğretim Üyesi Yetiştirme Birimi 14044tr_TR
dc.description.tableofcontentsKABUL ve ONAY SAYFASI …..…………………………………………………… i TEŞEKKÜR………………………………………………………………................. ii İÇİNDEKİLER…..…………………………………………………………………... iii SİMGELER ve KISALTMALAR DİZİNİ…………………………........................... vi ŞEKİLLER DİZİNİ……..………………………………………................................. viii RESİMLER DİZİNİ…………………………………………………………………. ix TABLOLAR DİZİNİ ………………………………………………............................ x ÖZET............................................................................................................................. xii ABSTRACT.................................................................................................................. xiii 1. GİRİŞ………………………………………………………………………………. 1 2. GENEL BİLGİLER………………………………………………………………... 3 2.1. Etiyoloji……….…………………………………………………………………. 3 2.2. Patogenezis………………………………………………………………………. 11 2.3. Klinik Bulgular………………………………………………………………….... 15 2.4. Risk Faktörleri ve Bulaşma Yolları……………………………………………… 20 2.5. Halk Sağlığına Etkileri…………………………………………………………… 25 2.6. Teşhis…………………………………………………………………………….. 26 2.6.1. Sitolojik Muayene……………………………………………………………... 27 2.6.2. Serolojik Tanı…………………………………………………………………... 29 2.6.3. Polimeraz Zincir Reaksiyonu…………………………………………………... 30 2.7. Tedavi…………………………………………………………………………….. 32 3. GEREÇ ve YÖNTEM…………………………………………………………….. 39 3.1. Gereç……………………………………………………………………………... 39 3.1.1. Örnekleme ……….…………………………………………………………….. 39 3.1.2. Kullanılan Solüsyonlar ve Ayıraçlar…………………………………………… 40 3.1.2.1. Giemsa boya…………………………………………………………………. 40 3.1.2.2. Hemogram solüsyonları……………………………………………………... 40 3.1.2.3. 50X TAE (Tris, Asetik Asit, EDTA) Elektroforez Solüsyonu………………. 40 3.1.2.4. 6X DNA loading dye……………………………………………………….. 40 3.1.2.5. Tris/EDTA (TE) buffer…………………………………………………….... 40 3.1.3. PCR ……………………………………………………………………………. 41 3.1.3.1. DNA ekstraksiyon kiti ……..………………………………………………... 41 3.1.3.2. ExPrime taq premix ………………………………………………………... 41 3.1.3.3. Primerler …………………………………………………………………….. 41 3.1.3.4. Agaroz Jel …………………………………………………………………… 42 3.1.3.5. Marker ………………………………………………………………………. 42 3.1 3.6. Etidium bromür ……………………………………………………………... 42 3.1.3.7. PCR ürünü saflaştırılması …………………………………………………… 42 3.1.3.8. Sekans PCR ürünü saflaştırılması …………………………………………… 43 3.1.4. Kullanılan Cihazlar …………………………………………………………… 43 3.1.4.1. QuickGene-Mini80 cihazı …………………………………………………… 43 3.1.4.2. Santrifüj cihazı ………………………………………………………………. 43 3.1.4.3. Termal döngüleme cihazı ……………………………………………………. 43 3.1.4.4. Elektroforez cihazı …………………………………………………………... 43 3.1.4.5. Görüntüleme cihazı …………………………………………………………. 43 3.1.4.6. Saflaştırılmış PCR ürünü ölçüm cihazı ……………………………………… 43 3.1.4.7. DNA sekans cihazı …………………………………………………………... 43 3.2. Yöntem ………………………………………………………………………….. 44 3.2.1. Örnekleme …………………………………………………………………….. 44 3.2.2. Giemsa Boyama ……………………………………………………………….. 44 3.2.3. Hemogram …………………………………………………………………….. 44 3.2.4. DNA Ekstraksiyonu …………………………………………………………… 44 3.2.5. DNA Ekstraksiyon Kiti Prosedürü …………………………………………….. 45 3.2.5.1. Solüsyonların hazırlanması ………………………………………………….. 45 3.2.5.2. Lizat hazırlama protokolü …………………………………………………… 45 3.2.5.3. QG-Mini80 ekstraksiyon protokolü ………………………………………… 46 3.2.5.4. Ekstraksiyon işlemi ………………………………………………………….. 47 3.2.6. PCR ……………………………………………………………………………. 48 3.2.7. PCR Ürünlerinin Elektroforez Tankına Yüklenmesi…………………………... 53 3.2.8. Jelde Yürütme…………………………………………………………………. 53 3.2.9. Görüntüleme ve Değerlendirme ……………………………………………….. 53 3.2.10. PCR Ürün Saflaştırılması …………………………………………………….. 53 3.2.11. Sekans PCR …………………………………………………………………... 54 3.2.11.1. Sekans PCR ürünlerinin saflaştırma protokolü …………………………….. 55 3.2.12. DNA Sekanslama .…………………………………………………………… 56 4. BULGULAR ……………………………………………………………………… 57 4.1. Giemsa Boyama Bulguları ……………………………………………………… 57 4.2. Hemogram Bulguları ……………………………………………………………. 57 4.3. PCR Bulguları ………………………………………….………………………... 67 4.3.1. Köpek Hemotropik Mikoplazma 16S rRNA PCR Bulguları …………………... 67 4.3.2. Köpek Hemotropik Mikoplazma RNAse P Geni PCR Bulguları ……………… 69 4.3.3. Kedi Hemotropik Mikoplazma 16S rRNA PCR Bulguları..……………………. 70 4.3.4. Candidatus Mycoplasma turicensis 16S rRNA PCR Bulguları ………………... 70 4.4. Sekans Bulguları ………………………………………….……………………... 70 5. TARTIŞMA ………………………………………….……………………………. 79 6.SONUÇ ve ÖNERİLER ………………………………………….……………….. 90 KAYNAKLAR………………………………………….……………………………. 91 ÖZGEÇMİŞ…………………………………………………………………………... 104tr_TR
dc.language.isoturtr_TR
dc.publisherAydın Adnan Menderes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsütr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/restrictedAccesstr_TR
dc.subjectAnemi, hemotropik mikoplazma, kedi, köpek, PCRtr_TR
dc.titleKEDİ VE KÖPEKLERDE HEMOTROPİK MİKOPLAZMA TÜRLERİNİN MOLEKÜLER KARAKTERİZASYONLARININ ARAŞTIRILMASItr_TR
dc.typedoctoralThesistr_TR
dc.contributor.authorID10263164tr_TR
dc.contributor.departmentAydın Adnan Menderes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Mikrobiyoloji Anabilim Dalıtr_TR
Appears in Collections:Doktora
Doktora

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
HTY KABUL ONAY TEŞEKKÜR İÇİNDEKİLER 190619.pdfKabul Onay, İçindekiler, Özet400.8 kBAdobe PDFView/Open
HTY TEZ 190619.pdfAna Metin2.12 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.