Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11607/3551
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorKıral, Funda
dc.contributor.authorEkren Aşıcı, Gamze Sevri
dc.date.accessioned2019-06-26T07:21:06Z
dc.date.available2019-06-26T07:21:06Z
dc.date.issued2019-06-26
dc.date.submitted2019-05-03
dc.identifier.citationAŞICI EKREN G. S. Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Biyokimya (Veteriner) Programı Doktora Tezi, Aydın, 2019.tr_TR
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11607/3551
dc.description.abstractZOLEDRONİK ASİDİN D-17 KÖPEK OSTEOSARKOMA HÜCRE HATTINDA SİTOTOKSİK VE APOPTOTİK ETKİLERİ AŞICI EKREN G. S. Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Biyokimya (Veteriner) Programı Doktora Tezi, Aydın, 2019. Çalışmamızda; in vitro olarak zoledronik asidin (ZA) D-17 (CCL-183) köpek osteosarkoma (OSA) hücre hattı üzerinde antiproliferatif etkisinin olup olmadığı ve olası hücre ölüm tipinin (apoptoz/nekroz) belirlenmesi amaçlandı. D-17 köpek osteosarkoma hücre hattına uygulanan zoledronik asidin (1 µM, 5 µM, 10 µM, 25 µM, 50 µM, 75 µM, 100 µM) hücre canlılığına etkisi ve IC50 değeri WST-1 canlılık testi ile 24, 48, 72 ve 96 saat inkübasyon sürelerince tespit edildi. WST-1 canlılık analizleri sonuçlarına göre 24 saatte anlamlı bir sitotoksik etki görülmezken (p≥0,05), ZA’nın IC50 değerleri 48. saat, 72. saat ve 96. saat için sırası ile 82,5 µM, 26,0 µM ve 17,6 µM olarak hesaplandı. ZA’nın hücrelerin koloni oluşturma yeteneklerine etkisi kristal violet, mineral içeriği üzerine etkisi alizarin kırmızısı boyaması ile gösterilirken, ZA’nın ekstraselüler ve intraselüler alkalen fosfataz aktivitesine olan etkisi ise spektrofotometrik yöntemle ölçüldü. ZA’nın hücrelerin koloni oluşturma, mineral içeriği ve alkalen fosfataz üzerine etkisi incelendiğinde hücrede doz ve zamana bağlı olarak azalmaya neden olduğu belirlendi (p<0,05). Hücrelerin göç etme potansiyellerine olan etkisi ucuz ve basit bir yöntem olan yara iyileştirme yöntemi ile belirlendi ve ZA’nın köpek OSA hücre hattı üzerine 5 µM, 7,5 µM, 10 µM, 15 µM konsantrasyonları uygulandığında hücrenin göç etme potansiyelini anlamlı ölçüde azalttığı görüldü. Zoledronik asidin hücredeki apoptotik etkileri ise elektroforetik ve ELİSA yöntemleri ile DNA kırıklarının analizi yapılarak gösterildi. Kaspaz 3, kaspaz 8 ve kaspaz 9 düzeyleri ELİSA yöntemi ile belirlenerek apoptotik yolaklardaki kaspaz-kaskat sistemi üzerine etkisi saptandı. Ayrıca apoptotik yolaklar üzerinde yer alan Bcl-2, Bax ve Bid genleri, hücrelerinin çoğaltılması ve sağkalımı ile ilişkili gen olarak kabul edilen survivin genlerinin ekspresyon düzeyleri RT-PCR yöntemleri kullanılarak belirlendi. Apoptotik etkilerinin saptanmasında WST-1 canlılık testi sonucu bulunan IC50 değerinin altındaki 5 µM, 7,5 µM, 10 µM, 15 µM konsantrasyonları kullanıldı. D-17 köpek OSA hücreleri üzerine seçilen dozlarda ZA uygulandığında doz ve zamana bağlı olarak apoptotik DNA kırıklarında, kaspaz 3 ve kaspaz 9 düzeyinde, Bax/Bcl-2 oranında anlamlı artış (p<0,05) gözlenirken, kaspaz 8 düzeyinde ve Bid ekspresyonunda anlamlı bir değişiklik bulunmadı (p≥0,05). Hücre sağkalımını belirleyen survivinin ekspresyon düzeylerinde ise doz ve zamana bağlı olarak anlamlı bir azalma (p<0,05) saptandı. Çalışmanın sonuçları ZA’nın D-17 köpek osteosarkoma hücrelerinde tek başına uygulanmasının in vitro olarak antikanserojenik etki gösterdiğini ortaya çıkarmıştır. Bu konudaki araştırmaların kapsamı genişletilmeli ve daha ileri moleküler çalışmalar gerçekleştirilmelidir. Ayrıca in vivo hayvan modelleri üzerinde denenerek doğrulukları kanıtlanmalıdır.tr_TR
dc.description.abstractCYTOTOXIC AND APOPTOTIC EFFECTS OF ZOLEDRONIC ACID IN D-17 CANINE OSTEOSARCOMA CELL LINE AŞICI EKREN G. S. Aydın Adnan Menderes University Health Sciences Institute Veterinary Biochemistry Program PhD Thesis, Aydın, 2019. The aim of our study was to determine whether zoledronic acid (ZA) has antiproliferative effect on D-17 (CCL-183) canine osteosarcoma (OSA) cell line in vitro and to determine possible cell death type (apoptosis/necrosis). The effect of zoledronic acid (1 μM, 5μM, 10 μM, 25 μM, 50 μM, 75 μM, 100 μM) on cell viability of the D-17 canine osteosarcoma cell line and the IC50 value were determined during 24, 48, 72 and 96 hours incubation time with the WST-1 viability test. According to the results of WST-1 vitality analysis, no significant cytotoxic effect was observed in 24 hours (p≥0,05), the IC50 values of ZA were calculated as 82,5 µM, 26,0 µM and 17,6 µM respectively for 48 th hour, 72 th and 96 th hours. The effect of zoledronic acid on the colony forming ability of the cells was shown by crystal violet, on mineral content with alizarin red staining while the effect of ZA on extracellular and intracellular alkaline phosphatase activity was measured by spectrophotometric method. When the effect of ZA on colony formation, mineral content and alkaline phosphatase was investigated, ıt was determined decreased on cell dependent on dose and time (p<0,05). The effect of cells on migration potentials was determined by a cheap and simple method is wound healing and ZA significantly decreased cell migration potential when the concentrations of 5 μM, 7,5 μM, 10 μM, 15 μM were applied to on the canine OSA cell line. Apoptotic effects of zoledronic acid in the cell were showed analysis by electrophoretic and ELISA methods. The effect on caspase-cascade system in the apoptotic pathways was detected by determining the caspase 3, caspase 8 and caspase 9 activities with ELISA method. Moreover, expression levels of survivin, regarded as genes related to proliferation and survival of Bcl-2, Bax and Bid genes and cells in the apoptotic pathways, were determined using RT-PCR methods. Below the IC50 value that found by the WST-1 viability test 5 µM, 7,5 µM, 10 µM, 15 µM concentrations were used to determine the apoptotic effects. When the selected doses of ZA were applied on D-17 canine osteosarcoma cells was significantly increased apoptotic DNA fragments, level of caspase 3 and caspase 9, Bax/Bcl-2 ratio (p<0,05) while there was no significant change in caspase 8 level and Bid expression (p≥0,05) depending on dose and time. There was a significant decrease (p<0,05) in the expression levels of the survivin which determined cell survival. The result of this study has been shown that the treatment of ZA alone in D-17 canine osteosarcoma cells shows an anticarcinogenic effect in vitro. The scope of research on this subject should be expanded and proven by testing on more advanced molecular studies and in vivo animal models.tr_TR
dc.description.tableofcontentsİÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY SAYFASI i TEŞEKKÜR ii İÇİNDEKİLER iii SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ vii ŞEKİLLER DİZİNİ ix RESİMLER DİZİNİ xii TABLOLAR DİZİNİ xiii ÖZET xiv ABSTRACT xvi 1. GİRİŞ 1 2. GENEL BİLGİLER 4 2.1. Kanser 4 2.2. Hücre Ölümü 4 2.3. Programlanmış Hücre Ölümü ve Tipleri 5 2.4. Apoptoz 7 2.5. Apoptozun Keşfi ve Tarihçesi 9 2.6. Apoptoz ve Nekroz 11 2.7. Apoptotik Süreç 15 2.8. Apoptozun Biyokimyası 16 2.9. Apoptozun Uyarılması 18 2.10. Apoptozun Etki Mekanizması 19 2.10.1. Ekstrinsik Yolak 19 2.10.1.1. Fas-Fas ligand aracılı apoptoz (CD95 Yolu) 21 2.10.1.2. Tümor nekroz faktör aracılı apoptoz 22 2.10.2. İntrinsik Yolak 23 2.10.3. Sitotoksik T Lenfosit Aracılı Apoptoz (Perforin/Granzim Yolu) 24 2.10.4. Endoplazmik Retikulum Aracılı Apoptoz 26 2.10.5. Kaspaz Bağımsız Apoptoz 28 2.11. Kaspazlar 29 2.11.1. Kaspazların Yapısı 32 2.11.2. Kaspaz 3 34 2.11.3. Kaspaz 8 35 2.11.4. Kaspaz 9 36 2.12. Bcl-2 Gen Ailesi 36 2.13. Survivin (BIRC5) 39 2.14. Köpek Osteosarkoma 42 2.15. Bisfosfonatlar 46 2.15.1. Bisfosfonatların Tarihçesi 46 2.15.2. Bisfosfonatların Yapısı 47 2.15.3. Bisfosfonatların Metabolik Etkileri 49 2.16. Zoledronik Asit 51 3. GEREÇ VE YÖNTEM 57 3.1. Gereç 57 3.1.1. Hücre Hattı 57 3.1.2. Kullanılan Kimyasal Maddeler 57 3.1.3. Kullanılan Sarf Malzemeler 57 3.1.4. Kullanılan Cihazlar 58 3.1.5. Kullanılan Kitler 58 3.1.6. Primerler 58 3.1.7. Kullanılan Besiyeri ve Çözeltilerin Hazırlanışı 61 3.2. Yöntem 62 3.2.1. Sterilizasyon 62 3.2.2. D-17 (CCL-183) Köpek Osteosarkoma Hücre Hattının Kültüre Edilmesi 63 3.2.3. Hücrelerin Dondurulması ve Açma İşlemi 64 3.2.4. Hücrelerin Kaplama Yoğunluğunun Belirlenmesi 65 3.2.5. Zoledronik Asidin Doz ve Zamana Bağlı Olarak Hücre Canlılığı Üzerine Etkisi 65 3.2.6. WST-1 (Water Soluble Tetrazolium tuzu) Canlılık Testi 66 3.2.7. IC50 Değerinin Hesaplanması 67 3.2.8. Koloni Oluşturabilme Yeteneklerinin İncelenmesi 67 3.2.9. Zoledronik Asidin Mineralizasyona Etkisi 68 3.2.10. Zoledronik Asidin Alkalen Fosfataz (ALP) Aktivitesine Olan Etkisi 68 3.2.11. Zoledronik Asidin Hücrelerin Migrasyonuna Olan Etkileri 69 3.2.12. Zoledronik Asidin D-17 (CCL-183) Köpek Osteosarkoma Hücreleri Üzerinde Apoptotik Etkileri 70 3.2.12.1. Apoptotik DNA fragmentlerinin ELİSA yöntemi ile kantitatif analizi 70 3.2.12.2. Apoptotik DNA fragmentasyonun ekstraksiyonu ve agaroz jel elektroforezinde görüntülenmesi 71 3.2.13. Kaspaz 3, Kaspaz 8 ve Kaspaz 9’nın ELİSA ile Belirlenerek Apoptozun Değerlendirilmesi 71 3.2.14. RT-PCR ile Gen İfadelerinin Belirlenmesi 73 3.2.14.1. Total RNA izolasyonu 73 3.2.14.2. cDNA sentezi 74 3.2.14.3. Primerlerin hazırlanışı 74 3.2.14.4. mRNA ekspresyon düzeylerinin qRT-PCR yöntemi ile analizi 75 3.2.14.5. Ekspresyonun değerlendirilmesi 76 3.2.14.6. PCR ürünlerinin agaroz jel elektroforezinde görüntülenmesi 77 3.2.15. İstatistiksel Analiz 77 4. BULGULAR 78 4.1. Hücrelerin Kaplama Yoğunluğunun Belirlenmesi 78 4.2. Zoledronik Asidin Hücre Canlılığı Üzerine Etkisi 79 4.3. Zoledronik Asidin D-17 Köpek Osteosarkoma Hücre Hattı Üzerine Koloni Oluşturabilme Yeteneklerine Etkisi 83 4.4. Zoledronik Asidin Mineralizasyona Etkisi 85 4.5. Zoledronik Asidin Alkalen Fosfataz (ALP) Aktivitesine Olan Etkisi 85 4.6. Zoledronik Asidin Hücrelerin Migrasyonuna Olan Etkisi 88 4.7. Zoledronik Asidin D-17 (CCL-183) Köpek Osteosarkoma Hücreleri Üzerinde Apoptotik Etkileri 91 4.7.1. Apoptotik DNA Fragmentlerinin ELİSA Yöntemi ile Kantitatif Analizi 91 4.7.2. Apoptotik DNA Fragmentasyonun Ekstraksiyonu ve Agaroz Jel Elektroforezinde Görüntülenmesi 93 4.7.3. D-17 (CCL-183) Köpek Osteosarkoma Hücre Hattında Zoledronik Asidin Kaspaz 3, 8, 9 Aktivitesine Olan Etkileri 94 4.7.4. Genlerin Kantitatif Ekspresyon Düzeylerinin Belirlenmesi 97 4.7.4.1. Melting point analizi 100 4.7.4.2. PCR ürününün agaroz jel elektroforezinde görüntülenmesi 102 5. TARTIŞMA 103 6. SONUÇ VE ÖNERİLER 113 KAYNAKLAR 115 ÖZGEÇMİŞ 151tr_TR
dc.publisherAdnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsütr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccesstr_TR
dc.subjectKöpek Osteosarkoma, Apoptoz, Zoledronik Asit, Bisfosfonatlar.tr_TR
dc.subjectCanine Osteosarcoma, Apoptosis, Zoledronic Acid, Bisphosphonates.tr_TR
dc.titleZoledronik Asidin D-17 Köpek Osteosarkoma Hücre Hattında Sitotoksik ve Apoptotik Etkileritr_TR
dc.title.alternativeCYTOTOXIC AND APOPTOTIC EFFECTS OF ZOLEDRONIC ACID IN D-17 CANINE OSTEOSARCOMA CELL LINEtr_TR
dc.typedoctoralThesistr_TR
dc.contributor.authorID195856tr_TR
dc.contributor.departmentAdnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsütr_TR
Appears in Collections:Doktora

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Gamze Sevri Ekren Aşıcı.pdf11.52 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.