Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11607/3539
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorKIRKAN, PROF. DR. ŞÜKRÜ-
dc.contributor.authorORAL, ELİF OYA-
dc.date.accessioned2019-04-03T06:05:23Z-
dc.date.available2019-04-03T06:05:23Z-
dc.date.issued2019-03-26-
dc.date.submitted2019-03-26-
dc.identifier.citationATLARDA RHODOCOCCUS EQUI VARLIĞININ PCR İLE ARAŞTIRILMASI VE ANTİMİKROBİYEL DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİtr_TR
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11607/3539-
dc.description.abstractRhodococcus equi hem çeşitli hayvan türlerinde hem de insanlarda; pulmoner ve ekstrapulmoner piyogranulomatöz enfeksiyon oluşturabilen ve toprakta bulunan patojen bir bakteridir. Veteriner hekimlikte önemini genç tayların hastalığa özellikle duyarlı olması ve Rhodococcus equi pnömonisinin tanı, koruma ve tedavi yöntemlerinin istenilen düzeyde geliştirilememiş olması nedeniyle oluşturduğu ekonomik kayıplardan almaktadır. Çalışmamızda, 0-5 aylık 90 taydan alınan nazal svap numunelerinde Rhodococcus equi etkeni varlığının hem bakteriyolojik hem moleküler olarak araştırılması ve Rhodococcus equi izolatlarının antimikrobiyel duyarlılıklarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Örneklerin 10 (%11,1)’undan otomatize identifikasyon sistemi ile Rhodococcus equi identifiye edilmiştir. İzolatlar 16S rRNA PCR ile moleküler olarak doğrulanmıştır. Araştırmamızda identifiye edilen 10 Rhodococcus equi izolatının 2 (%20)’sinde vapA geni varlığı ortaya çıkarılmıştır. Rhodococcus equi izolatlarına yapılan antibiyogram testi sonucunda, 10 Rhodococcus equi izolatının 4 (%40)’ünün 11 antibiyotiğe çoklu direnç gösterdiği tespit edilmiştir. At yetiştirme çiftliklerinde kontrol amaçlı ultrasonografık taramalar sonrası uygulanan antibiyotik tedavileri sonucu, makrolid ve rifampin dirençli Rhodococcus equi suşlarının dünya genelinde görülme sıklığı artmaktadır. Çalışmamızda elde edilen sonuçlar, makrolid ve rifampin dirençli Rhodococcus equi suşlarının varlığını bir kere daha ortaya koymuştur. Araştırmamız sonucunda, antibiyotik dirençli Rhodococcus equi suşlarının oluşturduğu tehdide karşı, uygulanması kolay, maaliyeti düşük ve tanı değeri yüksek yeni metotların geliştirilmesi, dirençlilikle ilgili gen ekspresyonlarının daha iyi anlaşılması, dirençli suşların spesifik antijenik özelliklerin belirlenmesi ve hastalıktan korunmada etkili immunizasyon tekniklerinin geliştirilmesi önerilmektedir.tr_TR
dc.description.tableofcontentsKABUL VE ONAY SAYFASI i TEŞEKKÜR ii İÇİNDEKİLER iii SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ vi ŞEKİLLER DİZİNİ vii RESİMLER DİZİNİ viii TABLOLAR DİZİNİ ix ÖZET x ABSTRACT xi 1. GİRİŞ 1 2. GENEL BİLGİLER 3 2.1. Rhodococcus Cinsi 3 2.2. R. equi’nin Taksonomisi 6 2.3. R. equi Morfolojik ve Biyokimyasal Özellikleri 8 2.4. R. equi Mikroskobik Morfoloji ve Boyama Özellikleri 12 2.5. Diğer Belirleyici Özellikler 13 2.6. Epidemiyoloji 13 2.7. R. equi’de Hücre Biyolojisi ve Patogenez 16 2.7.1. Virülens Plazmidi 22 2.7.1.1.ORF8 ve ORF4 25 2.7.1.2.Diğer ORF’ler 26 2.7.2. Virülens Plazmidi Gen Ekspresyon Regülasyonu 27 2.8. Bağışıklık 28 2.8.1. R. equi ve Fagositik Hücre Etkileşimleri 28 2.8.2. Antikor Kaynaklı Bağışıklık 29 2.8.3. Hücresel Bağışıklık 30 2.8.4. Yeni Doğan Tayların Bağışıklığı 31 2.9. Klinik Bulgular 32 2.10. Tanı 34 2.10.1. Sitoloji 35 2.10.2. Kültür 35 2.10.3. Nükleik Asit Amplifikasyonu ve Polimeraz Zincir Reaksiyonu 36 2.10.4. Serolojik Testler 37 2.10.5. Yardımcı Tanı testleri 38 2.10.5.1. Klinik Patoloji 38 2.10.5.2. Tanısal Görüntüleme 39 2.10.5.3. Patolojik Bulgular 40 2.11. Tedavi 41 2.11.1. Rifampin ve Makrolitler 42 2.12. Koruma Kontrol 44 2. 12.1. Erken Teşhis İçin Taramalar 44 2.12.2. Pasif İmmunizasyon 46 2.12.3. Kemoflaksi 47 2.12.4. Aşılama 48 3. GEREÇ VE YÖNTEM 50 3.1. Gereç 50 3.1.1. Örnekler 50 3.1.2. Kullanılan Besiyeri 50 3.1.2.1. R. equi selektif NANAT Besi yeri 50 3.1.2.2.TSA (Tryptic Soy Agar) 51 3.1.3. Kullanılan Kimyasal/Solüsyonlar 51 3.1.3.1. TBE(Tris, BorikAsit, EDTA, pH: 8,0) Buffer 51 3.1.3.2. Jel Loading Buffer(6X) 52 3.1.3.3. Tris(1M) 52 3.1.3.4. TE Buffer(10mM tris, 1mM EDTA) 52 3.1.3.5. ExPrime Taq Premix(2X) (GeNet Bio®) 52 3.1.4. DNA Ekstrasyon Kiti 52 3.1.4.1. Thermo ScientificTM Genomic DNA Purification Kit Prosedürü 52 3.1.5. Primerler 53 3.1.6. Agaroz Jel Hazırlanışı 53 3.1.7. Marker 53 3.1.8. Ethidium Bromid 54 3.1.9. Standart Suş 54 3.1.10. Antibiyotikler 54 3.1.10.1. Antibiyotik Sulandırmaları 54 3.1.11. Kullanılan Cihazlar 54 3.2. Yöntem 55 3.2.1. Örneklerin Toplanması 55 3.2.2. Fenotipik İzolasyon ve İdentifikasyon 55 3.2.3. Genotipik İdentifikasyon 55 3.2.3.1. PCR. 55 3.2.3.1.1. Rhodococcus equi 16S rRNA PCR Aşaması 55 3.2.3.1.2. Rhodococcus equi vapA ve vapB gen varlığının belirlenmesi 56 3.2.4. Antibiyogram 57 3.2.4.1. Bakteri İnokulumun Hazırlanması 57 3.2.4.2. Broth Mikrodilüsyon 57 4. BULGULAR 59 4.1. Fenotipik Bulgular 59 4.2. PCR Bulguları 60 4.3. Antibiyogram Sonuçları 62 5. TARTIŞMA 66 6. SONUÇ VE ÖNERİLER 72 7. KAYNAKLAR 73 8. ÖZGEÇMİŞ 99tr_TR
dc.language.isoturtr_TR
dc.publisherAYDIN ADNAN MENDERES ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜtr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesstr_TR
dc.subjectTay Pnömonisi, Rhodococcus equi, PCR, vapA, Antimikrobiyel Duyarlılıktr_TR
dc.titleATLARDA RHODOCOCCUS EQUI VARLIĞININ PCR İLE ARAŞTIRILMASI VE ANTİMİKROBİYEL DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİtr_TR
dc.typedoctoralThesistr_TR
dc.contributor.authorID10242647tr_TR
dc.contributor.departmentSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜtr_TR
Appears in Collections:Doktora

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
oya tez son.docxTEZ METNİ2.86 MBMicrosoft Word XMLView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.