Please use this identifier to cite or link to this item:
http://hdl.handle.net/11607/3403Full metadata record
| DC Field | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.advisor | Kırkan, Şükrü | - |
| dc.contributor.author | Oklay, Mehmet Ali | - |
| dc.date.accessioned | 2018-09-20T07:00:44Z | - |
| dc.date.available | 2018-09-20T07:00:44Z | - |
| dc.date.issued | 2018-09-20 | - |
| dc.date.submitted | 2018-09-11 | - |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11607/3403 | - |
| dc.description.abstract | SIĞIR MASTİTİSLERİYLE İLİŞKİLİ AEROCOCCUS VIRIDANS TÜRÜNÜN MOLEKÜLER İDENTİFİKASYONU VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ Oklay MA. Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Yüksek Lisans Tezi, Aydın, 2018. Aerococcus türleri çevrede saprofitik olarak bulunabildiği gibi birçok insan ve hayvan infeksiyonlarından da izole edilmiştir. Sığırlarda klinik ve subklinik mastitis vakalarında da tespit edildiği bildirilmiştir. Streptococcus ve Staphylococcus türleri ile olan benzerliği bilinmekte ve bu nedenle hatalı teşhislere neden olabilmektedir. Araştırmamız için Aydın ilindeki çiftliklerden klinik mastitis tespit edilmiş 100 inekten süt numunesi toplanmıştır. Numuneler soğuk zincirle Adnan Menderes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalına getirilmiştir. 16S rRNA geninin dizilimine yönelik genotipik identifikasyon ve otomatize ileri identifikasyon sistemi olan MALDI-TOF MS ile birlikte, klinik ve subklinik mastitisli sığırlardan 15 adet (%15) Aerococcus viridans identifikasyonu yapılmıştır. Ayrıca Minimal İnhibitör Konsantrasyon (MİK) belirleme yöntemine dayalı olarak yapılan antibiyotik duyarlılık testlerinde izolatların Siprofloksasin, Tigesiklin ve Trimetoprim-Sulfometoksazol’e % 100, Vankomisin’e %87, Eritromisin’e % 80, Tetrasiklin’e % 67, Penisilin ve Linezolide % 53.3 oranlarında duyarlı; Nitrofurantoin’e %93 ve Teikoplanin’e % 53.3 oranlarında dirençli olduğu saptanmıştır. Elde edilen bölgesel verilerin, ileride yapılacak araştırmalarda A. viridans etkeninin sığırlarda mastitis hastalığındaki rolünün aydınlatılması açısından ışık tutması umulmaktadır. | tr_TR |
| dc.description.tableofcontents | İÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY i TEŞEKKÜR ii İÇİNDEKİLER iii RESİMLER DİZİNİ v TABLOLAR DİZİNİ vi ÖZET vii ABSTRACT viii 1. GİRİŞ 1 2. GENEL BİLGİLER 3 2.1. Aerococcus Türleri 3 2.2. Aerococcus Türlerinin Biyokimyasal Özellikleri 4 2.3. Aerococcus Türlerinin Virulans Mekanizması 6 2.4. Aerococcus Türlerinin İzolasyon ve İdentifikasyonları 7 2.5. Klinik ve Subklinik Mastitis Vakalarında Aerococcus Türleri 9 2.6. Aerococcus Türlerinde Antibiyotik Direnci 11 3. GEREÇ ve YÖNTEM 14 3.1. Gereç 14 3.1.1. Besiyerleri ve Ayıraçlar 14 3.1.1.1. Besiyerleri 14 3.1.1.1.1. Blood Agar (Merck 1. 10886) 14 3.1.1.1.2. Mueller-Hinton Agar (MHA) (Oxoid CM 129) 15 3.1.1.1.3. Brain Heart Infusion Broth (BHIB) (% 20 Gliserinli) (Oxoid CM 0225) 15 3.1.1.1.4. Trypton Soya Broth (TSB) (Oxoid CM 129) 15 3.1.2. Kaliforniya Mastitis Test Ayracı (Immucell®) 15 3.1.3. Primerler 16 3.2. Yöntem 16 3.2.1. Örneklerin Alınması 16 3.2.2. Aerococcus sp. İzolasyonu 17 3.2.3. Aerococcus sp. Mikroskopisi 17 3.2.4. Aerococcus sp. Konvansiyonel İdentifikasyonu 17 3.2.4.1. Katalaz Testi 17 3.2.5. Aerococcus sp. VITEK MS (MALDI-TOF MS) ile İdentifikasyon 18 3.2.6. Aerococcus İzolatlarının Genotipik İdentifikasyonu 19 3.2.6.1. DNA Ekstraksiyonu 19 3.2.6.2. PCR 19 3.2.6.2.1. Aerococcus sp 16S rRNA PCR Aşaması 19 3.2.6.2.2. Aerococcus viridans tür spesifik PCR Aşaması 20 3.2.6.3. PCR Ürün Jel Elektroforezi 21 3.3. Antibiyogram 22 4. BULGULAR 23 4.1. Konvansiyonel Yöntemler ile Aerococcus sp. İzolasyon Bulguları 23 4.2. VITEK MS (MALDI-TOF MS) ile Aerococcus viridans İdentifikasyon Bulguları 23 4.3. Aerococcus sp. 16S rRNA ve Tür Spesifik PCR ile Genotipik İdentifikasyon Bulguları 24 4.4. Antibiyogram Bulguları 27 5. TARTIŞMA 30 6. SONUÇ ve ÖNERİLER 34 KAYNAKLAR 35 ÖZGEÇMİŞ 41 | tr_TR |
| dc.language.iso | tur | tr_TR |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/closedAccess | tr_TR |
| dc.subject | Sığır, Aerococcus viridans, 16S rRNA, Mastitis, İdentifikasyon | tr_TR |
| dc.title | SIĞIR MASTİTİSLERİYLE İLİŞKİLİ AEROCOCCUS VIRIDANS TÜRÜNÜN MOLEKÜLER İDENTİFİKASYONU VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ BELİRLENMESİ | tr_TR |
| dc.title.alternative | MOLECULAR IDENTIFICATION OF AEROCOCCUS VIRIDANS ASSOCIATED WITH BOVINE MASTITIS AND DETERMINATION OF ANTIBIOTIC SUSCEPTIBILITIES | tr_TR |
| dc.type | masterThesis | tr_TR |
| dc.contributor.authorID | 10212558 | tr_TR |
| dc.contributor.department | Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü | tr_TR |
| Appears in Collections: | Yüksek Lisans | |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| 3. içindekiler özet abstract m ali oklay 19092018.doc | Özet İçindekiler ..... | 75 kB | Microsoft Word | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.