Türk populasyununda kalsitonin reseptör (CTR) geni polimorfizminin PCR-RFLP yöntemi ile belirlenmesi

Abstract

Kalsitonin osteoklastların yüzeyinde yerlesen kalsitonin reseptörleri (CTR) uyarmakla, kemik resorbsiyonunun inhibe eden 32 aminoasitlik bir peptid hormondur. Bu etki osteoklastların yüzeyinde yer alan bir 7-transmembran reseptör olan CTR’nin aktivasyonunun bir sonucudur. CTR aktivasyonu adenilsiklazı uyarır ve osteoklastik kemik resorpsiyonunda bir düsüse yol açar. CTR geninin 1340. nükleotid pozisyonunda (447. kodon) yaygın olarak görülen ve osteoporoz, böbrek tası ile iliskili oldugu saptanan C/T polimorfizmi, CTR genin aktivasyonunu etkiler. Bu denli önemli olan CTR genindeki bu polimorfizmin Aydın populasyonundaki bireylerde sıklıgının belirlenmesi amaçlandı. Bu amaçla, Aydın ilinin çesitli bölgelerinde 489 saglıklı bireyin ilgili gen bölgesi polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yoluyla çogaltılıp ve polimorfizm restriksiyon parça uzunluk polimorfizm (RFLP) yöntemi ile belirlendi. Çalısılan populasyonda C/C %16.35, C/T %47.44 ve T/T genotip sıklıgının ise %36.21 oldugu gözlenmistir. C ve T allellerinin sıklıkları ise sırasıyla %44.65 ve %55.35 olarak saptanmıs ve bu degerler en fazla talyanlarınkiyle yakınlık göstermektedir. Aydın populasyonda gözlenen ve beklenen genotip sıklıkları arasındaki farkın önemli olmadıgı ve bu yüzden populasyonun Hardy-Weinberg dengesinde oldugu saptanmıstır.

Calcitonin is a 32 amino acid length peptide hormone inhibiting bone resorption by activating calcitonin receptors located on the surface of the osteoclasts. This effect is a result of CTR activation which is a 7-transmembrane receptor located on the surface of osteoclasts. Activation of CTR induces adenilsiklase and causes a decline in the osteoclastic bone resorption. C/T polymorphism at the nucleotide position 1340 (codon position 447) in the CTR gene, its association has been detected with osteoporosis, and kidney stones, affects CTR activation. In the present study, detection of the frequency of such an important polymorphism in the CTR gene has been aimed. For this aim, the gene in question was amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) from 489 healthy blood donors from Aydın province and the polymorphism was detected by Restriction Fragment Length polymorphism (RFLP) assay. Results obtained from this analysis showed that C/C, C/T and TT genotype frequencies were 16.35%, 47.44% and 36.21%, respectively. The frequency of the mutant T allele was 55.35%. Comparisons these results with those obtained from different populations showed that there was a very close similarity with Italian population. It has been determined that the differences between observed and expected genotype frequencies in Aydın population were not significant, thus the population in question was in the Hardy-Weinberg Equilibrium.